Badanie pilotażowe Oncopanel (TOP).
13 kwietnia 2017 zaktualizowane przez: British Columbia Cancer Agency
BCCA Oncopanel to test kliniczny opracowywany w celu określenia stanu genotypu prospektywnie zdefiniowanego zestawu genów.
Celem tego badania pilotażowego jest ocena wykonalności i wpływu testu Oncopanel na podejmowanie decyzji klinicznych. Kwalifikujący się pacjenci to pacjenci z zaawansowanym rakiem płuc, jelita grubego, czerniakiem i GIST oraz pacjenci ze zdiagnozowanymi nowotworami złośliwymi brani pod uwagę w badaniach klinicznych.
Przegląd badań
Status
Zakończony
Szczegółowy opis
Mutacje somatyczne w guzach litych stanowią ustalony sposób charakteryzowania nowotworów złośliwych do celów prognostycznych, diagnostycznych i terapeutycznych. Mutacje w genach EGFR, KRAS, BRAF, KIT i PDGFRA kierują terapią chorych odpowiednio na zaawansowanego raka płuca, jelita grubego, czerniaka i GIST. Znane lub nowe mutacje w innych genach mogą również mieć znaczenie kliniczne, ale nie są identyfikowane przez obecne genotypowanie oferowane pacjentom BC Cancer Agency (BCCA). Ponadto wiele genów kandydujących zostało uznanych za potencjalne biomarkery prognostyczne i predykcyjne u pacjentów z guzami litymi. W związku z tym Oncopanel jest testem klinicznym opracowywanym w celu określenia stanu genotypu prospektywnie zdefiniowanego zestawu genów. Oncpanel obejmuje następujący klinicznie istotny zestaw genów i eksonów: KRAS, EGFR, BRAF, NRAS i HRAS, geny szlaku transdukcji sygnału PIK3CA, szlak RAS-RAF-MEK-MAPK, HER2, IDH1 i IDH2, ALK, TP53, c-KIT, STAT1&3 i PDGFRA. Dodatkowe badania materiału nowotworowego będą również obejmować analizę określonych wariantów genów związanych ze zdarzeniami niepożądanymi lub odpowiedzią na terapię.
Liczne badania udokumentowały obecność krążącego DNA guza (ctDNA) wśród pacjentów z zaawansowanym i wczesnym stadium choroby nowotworowej (20-22). Zdolność do diagnozowania standardowych mutacji nowotworowych za pomocą testu krwi („biopsja płynna”) nie została jeszcze ustalona, ale ma oczywiste zalety. Pojawianie się mutacji „opornościowych” powstających w guzie przerzutowym lub w trakcie terapii jest dobrze udokumentowane (21, 22). Biopsja krwi może stanowić dokładniejsze określenie cech genetycznych guza niż archiwalna próbka DNA. Uzyskanie odpowiednich próbek tkanek od niektórych pacjentów ze zdiagnozowanymi nowotworami złośliwymi, zwłaszcza rakiem płuc, może być trudne. Biopsja krwi może stanowić mniej inwazyjny i szybszy sposób diagnozowania zarówno standardowych, jak i translacyjnych mutacji nowotworowych.
Typ studiów
Obserwacyjny
Zapisy (Rzeczywisty)
432
Kontakty i lokalizacje
Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.
Lokalizacje studiów
-
-
British Columbia
-
Abbotsford, British Columbia, Kanada, V2S 0C2
- Abbotsford Centre, BC Cancer Agency
-
Kelowna, British Columbia, Kanada, V1Y5L3
- BC Cancer Agency - Centre for the Southern Interior
-
Surrey, British Columbia, Kanada, V3V 1Z2
- Fraser Valley Centre, BC Cancer Agency
-
Vancouver, British Columbia, Kanada, V5Z 4E6
- Vancouver Centre, BC Cancer Agency
-
Victoria, British Columbia, Kanada, V8R 6V5
- Vancouver Island Centre, BC Cancer Agency
-
-
Kryteria uczestnictwa
Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
18 lat i starsze (DOROSŁY, STARSZY_DOROŚLI)
Akceptuje zdrowych ochotników
Nie
Płeć kwalifikująca się do nauki
Wszystko
Metoda próbkowania
Próbka bez prawdopodobieństwa
Badana populacja
Pacjenci z zaawansowanym rakiem jelita grubego, niedrobnokomórkowym rakiem płuca i czerniakiem oraz kandydaci do badań klinicznych.
Opis
Pacjenci z archiwalną tkanką nowotworową i znaną historią inwazyjnych nowotworów złośliwych kwalifikują się, jeśli spełniają jedno lub więcej z następujących kryteriów:
- Zaawansowany rak jelita grubego i kwalifikujący się do standardowego testu KRAS,
- Zaawansowany niedrobnokomórkowy rak płuca i kwalifikujący się do standardowego badania EGFR,
- Zaawansowany czerniak i kwalifikujący się do standardowego badania BRAF,
- Guzy podścieliskowe przewodu pokarmowego (GIST) kwalifikujące się do standardowego badania c-KIT i PDGFRA,
- Rozważanie potencjalnego zakwalifikowania się do badania klinicznego.
Plan studiów
Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
|---|
|
Brak leczenia
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Ramy czasowe |
|---|---|
|
Liczba dni między otrzymaniem archiwalnej tkanki guza a wygenerowaniem raportu OncoPanel
Ramy czasowe: 10 dni roboczych
|
10 dni roboczych
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Ramy czasowe |
|---|---|
|
Procent przypadków, w których raport Oncopanel jest generowany na podstawie otrzymanej próbki guza
Ramy czasowe: 1 rok
|
1 rok
|
Inne miary wyników
Miara wyniku |
Ramy czasowe |
|---|---|
|
Odsetek przypadków, w których odkrycie genotypowe zidentyfikowane przez Oncopanel jest powtarzane w standardowym teście klinicznym w celu ukierunkowania dalszej terapii
Ramy czasowe: 1 rok
|
1 rok
|
|
Odsetek pacjentów włączonych do zatwierdzonego badania klinicznego związanego z wynikami Oncopanelu
Ramy czasowe: 1 rok
|
1 rok
|
|
Zgodność między wynikami Oncopanel a sekwencjonowaniem ctDNA
Ramy czasowe: 1 rok
|
1 rok
|
Współpracownicy i badacze
Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.
Sponsor
Współpracownicy
Śledczy
- Główny śledczy: Hagen Kennecke, MD, British Columbia Cancer Agency
Publikacje i pomocne linki
Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.
Publikacje ogólne
- Green RC, Berg JS, Grody WW, Kalia SS, Korf BR, Martin CL, McGuire AL, Nussbaum RL, O'Daniel JM, Ormond KE, Rehm HL, Watson MS, Williams MS, Biesecker LG; American College of Medical Genetics and Genomics. ACMG recommendations for reporting of incidental findings in clinical exome and genome sequencing. Genet Med. 2013 Jul;15(7):565-74. doi: 10.1038/gim.2013.73. Epub 2013 Jun 20. Erratum In: Genet Med. 2017 May;19(5):606.
- Johnson DB, Dahlman KH, Knol J, Gilbert J, Puzanov I, Means-Powell J, Balko JM, Lovly CM, Murphy BA, Goff LW, Abramson VG, Crispens MA, Mayer IA, Berlin JD, Horn L, Keedy VL, Reddy NM, Arteaga CL, Sosman JA, Pao W. Enabling a genetically informed approach to cancer medicine: a retrospective evaluation of the impact of comprehensive tumor profiling using a targeted next-generation sequencing panel. Oncologist. 2014 Jun;19(6):616-22. doi: 10.1634/theoncologist.2014-0011. Epub 2014 May 5.
- Gray SW, Hicks-Courant K, Cronin A, Rollins BJ, Weeks JC. Physicians' attitudes about multiplex tumor genomic testing. J Clin Oncol. 2014 May 1;32(13):1317-23. doi: 10.1200/JCO.2013.52.4298. Epub 2014 Mar 24.
- Choi YL, Soda M, Yamashita Y, Ueno T, Takashima J, Nakajima T, Yatabe Y, Takeuchi K, Hamada T, Haruta H, Ishikawa Y, Kimura H, Mitsudomi T, Tanio Y, Mano H; ALK Lung Cancer Study Group. EML4-ALK mutations in lung cancer that confer resistance to ALK inhibitors. N Engl J Med. 2010 Oct 28;363(18):1734-9. doi: 10.1056/NEJMoa1007478.
- Doebele RC, Pilling AB, Aisner DL, Kutateladze TG, Le AT, Weickhardt AJ, Kondo KL, Linderman DJ, Heasley LE, Franklin WA, Varella-Garcia M, Camidge DR. Mechanisms of resistance to crizotinib in patients with ALK gene rearranged non-small cell lung cancer. Clin Cancer Res. 2012 Mar 1;18(5):1472-82. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-11-2906. Epub 2012 Jan 10.
- Guo J, Si L, Kong Y, Flaherty KT, Xu X, Zhu Y, Corless CL, Li L, Li H, Sheng X, Cui C, Chi Z, Li S, Han M, Mao L, Lin X, Du N, Zhang X, Li J, Wang B, Qin S. Phase II, open-label, single-arm trial of imatinib mesylate in patients with metastatic melanoma harboring c-Kit mutation or amplification. J Clin Oncol. 2011 Jul 20;29(21):2904-9. doi: 10.1200/JCO.2010.33.9275. Epub 2011 Jun 20.
- Chapman PB, Hauschild A, Robert C, Haanen JB, Ascierto P, Larkin J, Dummer R, Garbe C, Testori A, Maio M, Hogg D, Lorigan P, Lebbe C, Jouary T, Schadendorf D, Ribas A, O'Day SJ, Sosman JA, Kirkwood JM, Eggermont AM, Dreno B, Nolop K, Li J, Nelson B, Hou J, Lee RJ, Flaherty KT, McArthur GA; BRIM-3 Study Group. Improved survival with vemurafenib in melanoma with BRAF V600E mutation. N Engl J Med. 2011 Jun 30;364(26):2507-16. doi: 10.1056/NEJMoa1103782. Epub 2011 Jun 5.
- Newman AM, Bratman SV, To J, Wynne JF, Eclov NC, Modlin LA, Liu CL, Neal JW, Wakelee HA, Merritt RE, Shrager JB, Loo BW Jr, Alizadeh AA, Diehn M. An ultrasensitive method for quantitating circulating tumor DNA with broad patient coverage. Nat Med. 2014 May;20(5):548-54. doi: 10.1038/nm.3519. Epub 2014 Apr 6.
- Shi Y, Au JS, Thongprasert S, Srinivasan S, Tsai CM, Khoa MT, Heeroma K, Itoh Y, Cornelio G, Yang PC. A prospective, molecular epidemiology study of EGFR mutations in Asian patients with advanced non-small-cell lung cancer of adenocarcinoma histology (PIONEER). J Thorac Oncol. 2014 Feb;9(2):154-62. doi: 10.1097/JTO.0000000000000033.
- Misale S, Yaeger R, Hobor S, Scala E, Janakiraman M, Liska D, Valtorta E, Schiavo R, Buscarino M, Siravegna G, Bencardino K, Cercek A, Chen CT, Veronese S, Zanon C, Sartore-Bianchi A, Gambacorta M, Gallicchio M, Vakiani E, Boscaro V, Medico E, Weiser M, Siena S, Di Nicolantonio F, Solit D, Bardelli A. Emergence of KRAS mutations and acquired resistance to anti-EGFR therapy in colorectal cancer. Nature. 2012 Jun 28;486(7404):532-6. doi: 10.1038/nature11156.
- Punnoose EA, Atwal S, Liu W, Raja R, Fine BM, Hughes BG, Hicks RJ, Hampton GM, Amler LC, Pirzkall A, Lackner MR. Evaluation of circulating tumor cells and circulating tumor DNA in non-small cell lung cancer: association with clinical endpoints in a phase II clinical trial of pertuzumab and erlotinib. Clin Cancer Res. 2012 Apr 15;18(8):2391-401. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-11-3148. Epub 2012 Apr 5.
- Spindler KL, Pallisgaard N, Vogelius I, Jakobsen A. Quantitative cell-free DNA, KRAS, and BRAF mutations in plasma from patients with metastatic colorectal cancer during treatment with cetuximab and irinotecan. Clin Cancer Res. 2012 Feb 15;18(4):1177-85. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-11-0564. Epub 2012 Jan 6.
- Douillard JY, Oliner KS, Siena S, Tabernero J, Burkes R, Barugel M, Humblet Y, Bodoky G, Cunningham D, Jassem J, Rivera F, Kocakova I, Ruff P, Blasinska-Morawiec M, Smakal M, Canon JL, Rother M, Williams R, Rong A, Wiezorek J, Sidhu R, Patterson SD. Panitumumab-FOLFOX4 treatment and RAS mutations in colorectal cancer. N Engl J Med. 2013 Sep 12;369(11):1023-34. doi: 10.1056/NEJMoa1305275.
- Dienstmann R, Dong F, Borger D, Dias-Santagata D, Ellisen LW, Le LP, Iafrate AJ. Standardized decision support in next generation sequencing reports of somatic cancer variants. Mol Oncol. 2014 Jul;8(5):859-73. doi: 10.1016/j.molonc.2014.03.021. Epub 2014 Apr 4.
- Jimeno A, Messersmith WA, Hirsch FR, Franklin WA, Eckhardt SG. KRAS mutations and sensitivity to epidermal growth factor receptor inhibitors in colorectal cancer: practical application of patient selection. J Clin Oncol. 2009 Mar 1;27(7):1130-6. doi: 10.1200/JCO.2008.19.8168. Epub 2009 Jan 5.
- Lee CK, Brown C, Gralla RJ, Hirsh V, Thongprasert S, Tsai CM, Tan EH, Ho JC, Chu da T, Zaatar A, Osorio Sanchez JA, Vu VV, Au JS, Inoue A, Lee SM, Gebski V, Yang JC. Impact of EGFR inhibitor in non-small cell lung cancer on progression-free and overall survival: a meta-analysis. J Natl Cancer Inst. 2013 May 1;105(9):595-605. doi: 10.1093/jnci/djt072. Epub 2013 Apr 17.
- Cancer Genome Atlas Research Network. Comprehensive genomic characterization of squamous cell lung cancers. Nature. 2012 Sep 27;489(7417):519-25. doi: 10.1038/nature11404. Epub 2012 Sep 9. Erratum In: Nature. 2012 Nov 8;491(7423):288. Rogers, Kristen [corrected to Rodgers, Kristen].
- Ogino S, Lochhead P, Giovannucci E, Meyerhardt JA, Fuchs CS, Chan AT. Discovery of colorectal cancer PIK3CA mutation as potential predictive biomarker: power and promise of molecular pathological epidemiology. Oncogene. 2014 Jun 5;33(23):2949-55. doi: 10.1038/onc.2013.244. Epub 2013 Jun 24.
- Marks JL, Gong Y, Chitale D, Golas B, McLellan MD, Kasai Y, Ding L, Mardis ER, Wilson RK, Solit D, Levine R, Michel K, Thomas RK, Rusch VW, Ladanyi M, Pao W. Novel MEK1 mutation identified by mutational analysis of epidermal growth factor receptor signaling pathway genes in lung adenocarcinoma. Cancer Res. 2008 Jul 15;68(14):5524-8. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-08-0099.
- Gandhi L, Bahleda R, Tolaney SM, Kwak EL, Cleary JM, Pandya SS, Hollebecque A, Abbas R, Ananthakrishnan R, Berkenblit A, Krygowski M, Liang Y, Turnbull KW, Shapiro GI, Soria JC. Phase I study of neratinib in combination with temsirolimus in patients with human epidermal growth factor receptor 2-dependent and other solid tumors. J Clin Oncol. 2014 Jan 10;32(2):68-75. doi: 10.1200/JCO.2012.47.2787. Epub 2013 Dec 9.
- Borger DR, Tanabe KK, Fan KC, Lopez HU, Fantin VR, Straley KS, Schenkein DP, Hezel AF, Ancukiewicz M, Liebman HM, Kwak EL, Clark JW, Ryan DP, Deshpande V, Dias-Santagata D, Ellisen LW, Zhu AX, Iafrate AJ. Frequent mutation of isocitrate dehydrogenase (IDH)1 and IDH2 in cholangiocarcinoma identified through broad-based tumor genotyping. Oncologist. 2012;17(1):72-9. doi: 10.1634/theoncologist.2011-0386. Epub 2011 Dec 16.
- Turcan S, Rohle D, Goenka A, Walsh LA, Fang F, Yilmaz E, Campos C, Fabius AW, Lu C, Ward PS, Thompson CB, Kaufman A, Guryanova O, Levine R, Heguy A, Viale A, Morris LG, Huse JT, Mellinghoff IK, Chan TA. IDH1 mutation is sufficient to establish the glioma hypermethylator phenotype. Nature. 2012 Feb 15;483(7390):479-83. doi: 10.1038/nature10866.
- Yi ES, Boland JM, Maleszewski JJ, Roden AC, Oliveira AM, Aubry MC, Erickson-Johnson MR, Caron BL, Li Y, Tang H, Stoddard S, Wampfler J, Kulig K, Yang P. Correlation of IHC and FISH for ALK gene rearrangement in non-small cell lung carcinoma: IHC score algorithm for FISH. J Thorac Oncol. 2011 Mar;6(3):459-65. doi: 10.1097/JTO.0b013e318209edb9.
- Lux ML, Rubin BP, Biase TL, Chen CJ, Maclure T, Demetri G, Xiao S, Singer S, Fletcher CD, Fletcher JA. KIT extracellular and kinase domain mutations in gastrointestinal stromal tumors. Am J Pathol. 2000 Mar;156(3):791-5. doi: 10.1016/S0002-9440(10)64946-2.
- Carvajal RD, Antonescu CR, Wolchok JD, Chapman PB, Roman RA, Teitcher J, Panageas KS, Busam KJ, Chmielowski B, Lutzky J, Pavlick AC, Fusco A, Cane L, Takebe N, Vemula S, Bouvier N, Bastian BC, Schwartz GK. KIT as a therapeutic target in metastatic melanoma. JAMA. 2011 Jun 8;305(22):2327-34. doi: 10.1001/jama.2011.746.
- Lu HF, Yang JS, Lin YT, Tan TW, Ip SW, Li YC, Tsou MF, Chung JG. Diallyl disulfide induced signal transducer and activator of transcription 1 expression in human colon cancer colo 205 cells using differential display RT-PCR. Cancer Genomics Proteomics. 2007 Mar-Apr;4(2):93-7.
- Corless CL, Schroeder A, Griffith D, Town A, McGreevey L, Harrell P, Shiraga S, Bainbridge T, Morich J, Heinrich MC. PDGFRA mutations in gastrointestinal stromal tumors: frequency, spectrum and in vitro sensitivity to imatinib. J Clin Oncol. 2005 Aug 10;23(23):5357-64. doi: 10.1200/JCO.2005.14.068. Epub 2005 May 31.
- Thompson JD, Shibahara G, Rajan S, Pel J, Marziali A. Winnowing DNA for rare sequences: highly specific sequence and methylation based enrichment. PLoS One. 2012;7(2):e31597. doi: 10.1371/journal.pone.0031597. Epub 2012 Feb 15.
- Pel J, Broemeling D, Mai L, Poon HL, Tropini G, Warren RL, Holt RA, Marziali A. Nonlinear electrophoretic response yields a unique parameter for separation of biomolecules. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009 Sep 1;106(35):14796-801. doi: 10.1073/pnas.0907402106. Epub 2009 Aug 17.
Daty zapisu na studia
Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
1 października 2014
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
1 marca 2017
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
1 marca 2017
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
18 czerwca 2014
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
23 czerwca 2014
Pierwszy wysłany (Oszacować)
24 czerwca 2014
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
14 kwietnia 2017
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
13 kwietnia 2017
Ostatnia weryfikacja
1 kwietnia 2017
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
- HER2
- EGFR
- PIK3CA
- TP53
- KRAS
- Zaawansowany czerniak
- Rak jelita grubego z przerzutami
- Krążące DNA guza
- BRAF
- Zaawansowany niedrobnokomórkowy rak płuca
- ALK
- PDGFRA
- c-zestaw
- NRAS i HRAS
- RAS-RAF-MEK-MAPK
- IDH1 i IDH2
- STAN1&3
- Guz Struma przewodu pokarmowego
- Geny kandydujące zaangażowane jako potencjalne biomarkery prognostyczne i predykcyjne u pacjentów z guzami litymi
Dodatkowe istotne warunki MeSH
- Choroby Układu Pokarmowego
- Choroby Układu Oddechowego
- Nowotwory, tkanka łączna i miękka
- Nowotwory według typu histologicznego
- Nowotwory
- Choroby płuc
- Nowotwory według lokalizacji
- Nowotwory przewodu pokarmowego
- Nowotwory Układu Pokarmowego
- Choroby przewodu pokarmowego
- Nowotwory Układu Oddechowego
- Nowotwory klatki piersiowej
- Rak, Bronchogenny
- Nowotwory oskrzeli
- Nowotwory neuroektodermalne
- Nowotwory, komórki rozrodcze i embrionalne
- Nowotwory, tkanka nerwowa
- Choroby okrężnicy
- Choroby jelit
- Nowotwory jelit
- Choroby odbytu
- Nowotwory płuc
- Nowotwory, tkanka łączna
- Guzy neuroendokrynne
- Nevi i czerniaki
- Rak, płuco niedrobnokomórkowe
- Nowotwory jelita grubego
- Nowotwory stromalne przewodu pokarmowego
- Czerniak
Inne numery identyfikacyjne badania
- H14-01212
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .