De Oncopanel Pilot (TOP)-studie
13 april 2017 bijgewerkt door: British Columbia Cancer Agency
Het BCCA Oncopanel is een klinische test die wordt ontwikkeld om de genotypestatus van een prospectief gedefinieerde reeks genen te bepalen.
Het doel van deze pilotstudie is om de haalbaarheid en het effect op de klinische besluitvorming van de Oncopanel-test te beoordelen. In aanmerking komende patiënten zijn patiënten met gevorderde long-, colorectale, melanoom- en GIST-kankers en patiënten met gediagnosticeerde maligniteiten die in aanmerking komen voor klinische onderzoeken.
Studie Overzicht
Toestand
Voltooid
Gedetailleerde beschrijving
Somatische mutaties in solide tumoren vertegenwoordigen een gevestigde manier om maligniteiten te karakteriseren voor prognostische, diagnostische en therapeutische doeleinden. Mutaties in EGFR-, KRAS-, BRAF- en KIT- en PDGFRA-genen sturen therapie bij patiënten met respectievelijk gevorderde long-, colorectale, melanoom- en GIST-tumoren. Bekende of nieuwe mutaties in andere genen kunnen ook van klinisch belang zijn, maar worden niet geïdentificeerd door de huidige genotypering die wordt aangeboden aan BC Cancer Agency (BCCA)-patiënten. Bovendien zijn talrijke kandidaat-genen betrokken als potentiële prognostische en voorspellende biomarkers bij patiënten met solide tumoren. Als zodanig is het Oncopanel een klinische test die wordt ontwikkeld om de genotypestatus van een prospectief gedefinieerde reeks genen te bepalen. De volgende klinisch relevante set genen en exons zijn opgenomen in het Oncpanel: KRAS, EGFR, BRAF, NRAS en HRAS, PIK3CA Signal Transduction Pathway Genes, RAS-RAF-MEK-MAPK Pathway, HER2, IDH1 and IDH2, ALK, TP53, c-KIT, STAT1&3 en PDGFRA. Aanvullende tests op het tumormateriaal omvatten ook analyse van specifieke genvarianten die verband houden met bijwerkingen of respons op therapie.
Talrijke studies hebben de aanwezigheid van circulerend tumor-DNA (ctDNA) gedocumenteerd bij patiënten met gevorderde en vroege maligniteiten (20-22). Het vermogen om standaard kankermutaties te diagnosticeren met een op bloed gebaseerde test (een "vloeibare biopsie") is nog niet vastgesteld, maar biedt duidelijke voordelen. Het ontstaan van "resistentie"-mutaties die ontstaan in de metastatische tumor of tijdens de therapie is goed gedocumenteerd (21, 22). Een bloedbiopsie kan een nauwkeurigere bepaling van de genetische kenmerken van de tumor vertegenwoordigen dan een DNA-monster uit een archief. Adequate weefselspecimens kunnen moeilijk te verkrijgen zijn van sommige patiënten met gediagnosticeerde maligniteiten, met name longkanker. Een bloedbiopsie kan een minder invasieve en snellere manier zijn om zowel standaard als translationele kankermutaties te diagnosticeren.
Studietype
Observationeel
Inschrijving (Werkelijk)
432
Contacten en locaties
In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.
Studie Locaties
-
-
British Columbia
-
Abbotsford, British Columbia, Canada, V2S 0C2
- Abbotsford Centre, BC Cancer Agency
-
Kelowna, British Columbia, Canada, V1Y5L3
- BC Cancer Agency - Centre for the Southern Interior
-
Surrey, British Columbia, Canada, V3V 1Z2
- Fraser Valley Centre, BC Cancer Agency
-
Vancouver, British Columbia, Canada, V5Z 4E6
- Vancouver Centre, BC Cancer Agency
-
Victoria, British Columbia, Canada, V8R 6V5
- Vancouver Island Centre, BC Cancer Agency
-
-
Deelname Criteria
Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
18 jaar en ouder (VOLWASSEN, OUDER_ADULT)
Accepteert gezonde vrijwilligers
Nee
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Allemaal
Bemonsteringsmethode
Niet-waarschijnlijkheidssteekproef
Studie Bevolking
Patiënten met vergevorderde colorectale kanker, niet-kleincellige longkanker en melanoom en kandidaten voor klinische onderzoeken.
Beschrijving
Patiënten met gearchiveerd tumorweefsel en een bekende voorgeschiedenis van invasieve maligniteiten komen in aanmerking als ze aan een of meer van de volgende criteria voldoen:
- Gevorderde dikkedarmkanker en komt in aanmerking voor standaard KRAS-testen,
- Gevorderde niet-kleincellige longkanker en komt in aanmerking voor standaard EGFR-testen,
- Gevorderd melanoom en in aanmerking komend voor standaard BRAF-testen,
- Gastro-intestinale stromale tumoren (GIST's) die in aanmerking komen voor standaard c-KIT- en PDGFRA-testen,
- Wordt overwogen om mogelijk in aanmerking te komen voor klinische proeven.
Studie plan
Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
|---|
|
Geen behandeling
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Tijdsspanne |
|---|---|
|
Aantal dagen tussen ontvangst van gearchiveerd tumorweefsel en het genereren van het OncoPanel-rapport
Tijdsspanne: 10 werkdagen
|
10 werkdagen
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Tijdsspanne |
|---|---|
|
Percentage gevallen waarin een Oncopanel-rapport is gegenereerd op een ontvangen tumorspecimen
Tijdsspanne: 1 jaar
|
1 jaar
|
Andere uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Tijdsspanne |
|---|---|
|
Percentage gevallen waarin een door het Oncopanel geïdentificeerde genotypische bevinding wordt herhaald op een standaard klinische test met als doel een volgende therapie te begeleiden
Tijdsspanne: 1 jaar
|
1 jaar
|
|
Percentage patiënten dat deelnam aan een goedgekeurd klinisch onderzoek gerelateerd aan Oncopanel-resultaten
Tijdsspanne: 1 jaar
|
1 jaar
|
|
Concordantie tussen Oncopanel-resultaten en ctDNA-sequencing
Tijdsspanne: 1 jaar
|
1 jaar
|
Medewerkers en onderzoekers
Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.
Sponsor
Medewerkers
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Hagen Kennecke, MD, British Columbia Cancer Agency
Publicaties en nuttige links
De persoon die verantwoordelijk is voor het invoeren van informatie over het onderzoek stelt deze publicaties vrijwillig ter beschikking. Dit kan gaan over alles wat met het onderzoek te maken heeft.
Algemene publicaties
- Green RC, Berg JS, Grody WW, Kalia SS, Korf BR, Martin CL, McGuire AL, Nussbaum RL, O'Daniel JM, Ormond KE, Rehm HL, Watson MS, Williams MS, Biesecker LG; American College of Medical Genetics and Genomics. ACMG recommendations for reporting of incidental findings in clinical exome and genome sequencing. Genet Med. 2013 Jul;15(7):565-74. doi: 10.1038/gim.2013.73. Epub 2013 Jun 20. Erratum In: Genet Med. 2017 May;19(5):606.
- Johnson DB, Dahlman KH, Knol J, Gilbert J, Puzanov I, Means-Powell J, Balko JM, Lovly CM, Murphy BA, Goff LW, Abramson VG, Crispens MA, Mayer IA, Berlin JD, Horn L, Keedy VL, Reddy NM, Arteaga CL, Sosman JA, Pao W. Enabling a genetically informed approach to cancer medicine: a retrospective evaluation of the impact of comprehensive tumor profiling using a targeted next-generation sequencing panel. Oncologist. 2014 Jun;19(6):616-22. doi: 10.1634/theoncologist.2014-0011. Epub 2014 May 5.
- Gray SW, Hicks-Courant K, Cronin A, Rollins BJ, Weeks JC. Physicians' attitudes about multiplex tumor genomic testing. J Clin Oncol. 2014 May 1;32(13):1317-23. doi: 10.1200/JCO.2013.52.4298. Epub 2014 Mar 24.
- Choi YL, Soda M, Yamashita Y, Ueno T, Takashima J, Nakajima T, Yatabe Y, Takeuchi K, Hamada T, Haruta H, Ishikawa Y, Kimura H, Mitsudomi T, Tanio Y, Mano H; ALK Lung Cancer Study Group. EML4-ALK mutations in lung cancer that confer resistance to ALK inhibitors. N Engl J Med. 2010 Oct 28;363(18):1734-9. doi: 10.1056/NEJMoa1007478.
- Doebele RC, Pilling AB, Aisner DL, Kutateladze TG, Le AT, Weickhardt AJ, Kondo KL, Linderman DJ, Heasley LE, Franklin WA, Varella-Garcia M, Camidge DR. Mechanisms of resistance to crizotinib in patients with ALK gene rearranged non-small cell lung cancer. Clin Cancer Res. 2012 Mar 1;18(5):1472-82. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-11-2906. Epub 2012 Jan 10.
- Guo J, Si L, Kong Y, Flaherty KT, Xu X, Zhu Y, Corless CL, Li L, Li H, Sheng X, Cui C, Chi Z, Li S, Han M, Mao L, Lin X, Du N, Zhang X, Li J, Wang B, Qin S. Phase II, open-label, single-arm trial of imatinib mesylate in patients with metastatic melanoma harboring c-Kit mutation or amplification. J Clin Oncol. 2011 Jul 20;29(21):2904-9. doi: 10.1200/JCO.2010.33.9275. Epub 2011 Jun 20.
- Chapman PB, Hauschild A, Robert C, Haanen JB, Ascierto P, Larkin J, Dummer R, Garbe C, Testori A, Maio M, Hogg D, Lorigan P, Lebbe C, Jouary T, Schadendorf D, Ribas A, O'Day SJ, Sosman JA, Kirkwood JM, Eggermont AM, Dreno B, Nolop K, Li J, Nelson B, Hou J, Lee RJ, Flaherty KT, McArthur GA; BRIM-3 Study Group. Improved survival with vemurafenib in melanoma with BRAF V600E mutation. N Engl J Med. 2011 Jun 30;364(26):2507-16. doi: 10.1056/NEJMoa1103782. Epub 2011 Jun 5.
- Newman AM, Bratman SV, To J, Wynne JF, Eclov NC, Modlin LA, Liu CL, Neal JW, Wakelee HA, Merritt RE, Shrager JB, Loo BW Jr, Alizadeh AA, Diehn M. An ultrasensitive method for quantitating circulating tumor DNA with broad patient coverage. Nat Med. 2014 May;20(5):548-54. doi: 10.1038/nm.3519. Epub 2014 Apr 6.
- Shi Y, Au JS, Thongprasert S, Srinivasan S, Tsai CM, Khoa MT, Heeroma K, Itoh Y, Cornelio G, Yang PC. A prospective, molecular epidemiology study of EGFR mutations in Asian patients with advanced non-small-cell lung cancer of adenocarcinoma histology (PIONEER). J Thorac Oncol. 2014 Feb;9(2):154-62. doi: 10.1097/JTO.0000000000000033.
- Misale S, Yaeger R, Hobor S, Scala E, Janakiraman M, Liska D, Valtorta E, Schiavo R, Buscarino M, Siravegna G, Bencardino K, Cercek A, Chen CT, Veronese S, Zanon C, Sartore-Bianchi A, Gambacorta M, Gallicchio M, Vakiani E, Boscaro V, Medico E, Weiser M, Siena S, Di Nicolantonio F, Solit D, Bardelli A. Emergence of KRAS mutations and acquired resistance to anti-EGFR therapy in colorectal cancer. Nature. 2012 Jun 28;486(7404):532-6. doi: 10.1038/nature11156.
- Punnoose EA, Atwal S, Liu W, Raja R, Fine BM, Hughes BG, Hicks RJ, Hampton GM, Amler LC, Pirzkall A, Lackner MR. Evaluation of circulating tumor cells and circulating tumor DNA in non-small cell lung cancer: association with clinical endpoints in a phase II clinical trial of pertuzumab and erlotinib. Clin Cancer Res. 2012 Apr 15;18(8):2391-401. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-11-3148. Epub 2012 Apr 5.
- Spindler KL, Pallisgaard N, Vogelius I, Jakobsen A. Quantitative cell-free DNA, KRAS, and BRAF mutations in plasma from patients with metastatic colorectal cancer during treatment with cetuximab and irinotecan. Clin Cancer Res. 2012 Feb 15;18(4):1177-85. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-11-0564. Epub 2012 Jan 6.
- Douillard JY, Oliner KS, Siena S, Tabernero J, Burkes R, Barugel M, Humblet Y, Bodoky G, Cunningham D, Jassem J, Rivera F, Kocakova I, Ruff P, Blasinska-Morawiec M, Smakal M, Canon JL, Rother M, Williams R, Rong A, Wiezorek J, Sidhu R, Patterson SD. Panitumumab-FOLFOX4 treatment and RAS mutations in colorectal cancer. N Engl J Med. 2013 Sep 12;369(11):1023-34. doi: 10.1056/NEJMoa1305275.
- Dienstmann R, Dong F, Borger D, Dias-Santagata D, Ellisen LW, Le LP, Iafrate AJ. Standardized decision support in next generation sequencing reports of somatic cancer variants. Mol Oncol. 2014 Jul;8(5):859-73. doi: 10.1016/j.molonc.2014.03.021. Epub 2014 Apr 4.
- Jimeno A, Messersmith WA, Hirsch FR, Franklin WA, Eckhardt SG. KRAS mutations and sensitivity to epidermal growth factor receptor inhibitors in colorectal cancer: practical application of patient selection. J Clin Oncol. 2009 Mar 1;27(7):1130-6. doi: 10.1200/JCO.2008.19.8168. Epub 2009 Jan 5.
- Lee CK, Brown C, Gralla RJ, Hirsh V, Thongprasert S, Tsai CM, Tan EH, Ho JC, Chu da T, Zaatar A, Osorio Sanchez JA, Vu VV, Au JS, Inoue A, Lee SM, Gebski V, Yang JC. Impact of EGFR inhibitor in non-small cell lung cancer on progression-free and overall survival: a meta-analysis. J Natl Cancer Inst. 2013 May 1;105(9):595-605. doi: 10.1093/jnci/djt072. Epub 2013 Apr 17.
- Cancer Genome Atlas Research Network. Comprehensive genomic characterization of squamous cell lung cancers. Nature. 2012 Sep 27;489(7417):519-25. doi: 10.1038/nature11404. Epub 2012 Sep 9. Erratum In: Nature. 2012 Nov 8;491(7423):288. Rogers, Kristen [corrected to Rodgers, Kristen].
- Ogino S, Lochhead P, Giovannucci E, Meyerhardt JA, Fuchs CS, Chan AT. Discovery of colorectal cancer PIK3CA mutation as potential predictive biomarker: power and promise of molecular pathological epidemiology. Oncogene. 2014 Jun 5;33(23):2949-55. doi: 10.1038/onc.2013.244. Epub 2013 Jun 24.
- Marks JL, Gong Y, Chitale D, Golas B, McLellan MD, Kasai Y, Ding L, Mardis ER, Wilson RK, Solit D, Levine R, Michel K, Thomas RK, Rusch VW, Ladanyi M, Pao W. Novel MEK1 mutation identified by mutational analysis of epidermal growth factor receptor signaling pathway genes in lung adenocarcinoma. Cancer Res. 2008 Jul 15;68(14):5524-8. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-08-0099.
- Gandhi L, Bahleda R, Tolaney SM, Kwak EL, Cleary JM, Pandya SS, Hollebecque A, Abbas R, Ananthakrishnan R, Berkenblit A, Krygowski M, Liang Y, Turnbull KW, Shapiro GI, Soria JC. Phase I study of neratinib in combination with temsirolimus in patients with human epidermal growth factor receptor 2-dependent and other solid tumors. J Clin Oncol. 2014 Jan 10;32(2):68-75. doi: 10.1200/JCO.2012.47.2787. Epub 2013 Dec 9.
- Borger DR, Tanabe KK, Fan KC, Lopez HU, Fantin VR, Straley KS, Schenkein DP, Hezel AF, Ancukiewicz M, Liebman HM, Kwak EL, Clark JW, Ryan DP, Deshpande V, Dias-Santagata D, Ellisen LW, Zhu AX, Iafrate AJ. Frequent mutation of isocitrate dehydrogenase (IDH)1 and IDH2 in cholangiocarcinoma identified through broad-based tumor genotyping. Oncologist. 2012;17(1):72-9. doi: 10.1634/theoncologist.2011-0386. Epub 2011 Dec 16.
- Turcan S, Rohle D, Goenka A, Walsh LA, Fang F, Yilmaz E, Campos C, Fabius AW, Lu C, Ward PS, Thompson CB, Kaufman A, Guryanova O, Levine R, Heguy A, Viale A, Morris LG, Huse JT, Mellinghoff IK, Chan TA. IDH1 mutation is sufficient to establish the glioma hypermethylator phenotype. Nature. 2012 Feb 15;483(7390):479-83. doi: 10.1038/nature10866.
- Yi ES, Boland JM, Maleszewski JJ, Roden AC, Oliveira AM, Aubry MC, Erickson-Johnson MR, Caron BL, Li Y, Tang H, Stoddard S, Wampfler J, Kulig K, Yang P. Correlation of IHC and FISH for ALK gene rearrangement in non-small cell lung carcinoma: IHC score algorithm for FISH. J Thorac Oncol. 2011 Mar;6(3):459-65. doi: 10.1097/JTO.0b013e318209edb9.
- Lux ML, Rubin BP, Biase TL, Chen CJ, Maclure T, Demetri G, Xiao S, Singer S, Fletcher CD, Fletcher JA. KIT extracellular and kinase domain mutations in gastrointestinal stromal tumors. Am J Pathol. 2000 Mar;156(3):791-5. doi: 10.1016/S0002-9440(10)64946-2.
- Carvajal RD, Antonescu CR, Wolchok JD, Chapman PB, Roman RA, Teitcher J, Panageas KS, Busam KJ, Chmielowski B, Lutzky J, Pavlick AC, Fusco A, Cane L, Takebe N, Vemula S, Bouvier N, Bastian BC, Schwartz GK. KIT as a therapeutic target in metastatic melanoma. JAMA. 2011 Jun 8;305(22):2327-34. doi: 10.1001/jama.2011.746.
- Lu HF, Yang JS, Lin YT, Tan TW, Ip SW, Li YC, Tsou MF, Chung JG. Diallyl disulfide induced signal transducer and activator of transcription 1 expression in human colon cancer colo 205 cells using differential display RT-PCR. Cancer Genomics Proteomics. 2007 Mar-Apr;4(2):93-7.
- Corless CL, Schroeder A, Griffith D, Town A, McGreevey L, Harrell P, Shiraga S, Bainbridge T, Morich J, Heinrich MC. PDGFRA mutations in gastrointestinal stromal tumors: frequency, spectrum and in vitro sensitivity to imatinib. J Clin Oncol. 2005 Aug 10;23(23):5357-64. doi: 10.1200/JCO.2005.14.068. Epub 2005 May 31.
- Thompson JD, Shibahara G, Rajan S, Pel J, Marziali A. Winnowing DNA for rare sequences: highly specific sequence and methylation based enrichment. PLoS One. 2012;7(2):e31597. doi: 10.1371/journal.pone.0031597. Epub 2012 Feb 15.
- Pel J, Broemeling D, Mai L, Poon HL, Tropini G, Warren RL, Holt RA, Marziali A. Nonlinear electrophoretic response yields a unique parameter for separation of biomolecules. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009 Sep 1;106(35):14796-801. doi: 10.1073/pnas.0907402106. Epub 2009 Aug 17.
Studie record data
Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
1 oktober 2014
Primaire voltooiing (Werkelijk)
1 maart 2017
Studie voltooiing (Werkelijk)
1 maart 2017
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
18 juni 2014
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
23 juni 2014
Eerst geplaatst (Schatting)
24 juni 2014
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
14 april 2017
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
13 april 2017
Laatst geverifieerd
1 april 2017
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
- HER2
- EGFR
- PIK3CA
- TP53
- KRAS
- Geavanceerd melanoom
- Gemetastaseerde colorectale kanker
- Circulerend tumor-DNA
- BRAF
- Gevorderde niet-kleincellige longkanker
- ALK
- PDGFRA
- c-KIT
- NRAS en HRAS
- RAS-RAF-MEK-MAPK
- IDH1 en IDH2
- STAT1&3
- Gastro-intestingale Struma-tumor
- Kandidaatgenen betrokken als potentiële prognostische en voorspellende biomarkers bij patiënten met solide tumoren
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
- Ziekten van het spijsverteringsstelsel
- Ziekten van de luchtwegen
- Neoplasmata, bindweefsel en zacht weefsel
- Neoplasmata per histologisch type
- Neoplasmata
- Longziekten
- Neoplasmata per site
- Gastro-intestinale neoplasmata
- Neoplasmata van het spijsverteringsstelsel
- Gastro-intestinale aandoeningen
- Neoplasmata van de luchtwegen
- Thoracale neoplasmata
- Carcinoom, bronchogeen
- Bronchiale neoplasmata
- Neuro-ectodermale tumoren
- Neoplasmata, kiemcellen en embryonaal
- Neoplasmata, zenuwweefsel
- Colon Ziekten
- Darmziekten
- Intestinale neoplasmata
- Rectale ziekten
- Longneoplasmata
- Neoplasmata, bindweefsel
- Neuro-endocriene tumoren
- Nevi en melanomen
- Carcinoom, niet-kleincellige long
- Colorectale neoplasmata
- Gastro-intestinale stromale tumoren
- Melanoma
Andere studie-ID-nummers
- H14-01212
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .