Eturauhassyövän erojen taustalla olevat molekyylimekanismit (GENCADE)
keskiviikko 11. marraskuuta 2020 päivittänyt: Duke University
Eturauhassyövän erojen taustalla olevat molekyylimekanismit.
Tämän tutkimuksen tarkoituksena on edelleen selvittää eturauhassyövän erojen taustalla olevia molekyylimekanismeja.
Aiemmassa työssään tutkijat ovat tunnistaneet joukon eri tavalla säätelemättömiä geenejä afroamerikkalaisessa ja valkoihoisessa amerikkalaisessa eturauhassyövässä.
Näiden löydösten perusteella he olettavat pystyvänsä validoimaan nämä kohteet, jotka alun perin tunnistettiin George Washingtonin yliopiston lääketieteellisessä keskuksessa tehdyssä itsenäisessä Duke University Medical Centerin eturauhassyöpänäytteiden kohortissa.
Lisäksi tutkijat olettavat, että he voivat löytää uusia kohteita Duke University Medical Centerin eturauhassyöpänäytteiden kohortista alueellisten erojen vuoksi.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Yksityiskohtainen kuvaus
Yksittäiset afrikkalaisamerikkalaiset ja valkoihoiset amerikkalaiset potilaat saavat eturauhasen biopsiaytimet tai kirurgiset näytteet seuraavista toimenpiteistä: eturauhasen transrektaalinen ultraäänibiopsia (TRUSBxP), MR-fuusiobiopsia, intraoperatiivisesti (IO) eturauhasen poiston yhteydessä.
Käyttämällä solu-DNA:ta ja RNA:ta, jotka on eristetty eturauhassyövästä ja potilaiden mukaisia normaaleja eturauhasen biopsiaytimiä tai kirurgisia näytteitä, tutkijat suorittavat esi-isien genotyypityksen, eksoniryhmiä, kohdistetun RNA-sekvensoinnin ja epigeneettisiä analyyseja.
Kontrollina kerätään myös verta.
Veren ja kasvainkudoksen genomisia tietoja verrataan.
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Todellinen)
226
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskelupaikat
-
-
North Carolina
-
Durham, North Carolina, Yhdysvallat, 27710
- Duke University Medical Center
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
18 vuotta ja vanhemmat (Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Ei
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Uros
Näytteenottomenetelmä
Ei-todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
Tutkimuspopulaatio sisältää afroamerikkalaisia ja valkoihoisia amerikkalaisia potilaita (itseraportoituja), joille tehdään kliinisesti indikoidut diagnostiset biopsiat epäillyn eturauhassyövän varalta tai leikkauksensisäiset biopsiat potilaista, joille tehdään kliinisesti indikoitu eturauhasen poisto vahvistetun eturauhassyövän vuoksi.
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Epäilty eturauhassyövän pahanlaatuisuus
- Afroamerikkalaisen tai valkoihoisen amerikkalaisen itsensä ilmoittama rotu
- Ikä >/= 18 vuotta
- Pystyy lukemaan, ymmärtämään ja allekirjoittamaan tietoisen suostumusasiakirjan
Poissulkemiskriteerit:
- Kerätty kasvainkudos ei ole riittävä DNA- ja RNA-analyysiin ja/tai se ei ole positiivinen eturauhasen adenokarsinooman suhteen.
- Potilaat, jotka ovat saaneet aikaisempaa systeemistä hoitoa, eivät ole oikeutettuja tutkimukseen eli sädehoitoon tai kemo- tai immunoterapiaan.
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Kaukasialainen
Kaukasialaiset koehenkilöt, joille on tehty biopsia tai eturauhasen poisto.
|
|
|
Afrikkalais-amerikkalainen
Afroamerikkalaiset koepalat tai eturauhasen poisto.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Tunnistettujen geenikohteiden korkean ja alhaisen ilmentymisen osuus valkoihoisissa ja afroamerikkalaisissa näytteissä
Aikaikkuna: jopa 2 vuotta
|
Kokonais-RNA:ta tutkitaan mRNA:n ilmentymiskuvioiden varalta Affymetrix Human Exon 1.0 ST GeneChip -sovelluksella.
Mikrosirutiedot normalisoidaan kvantiilinormalisoinnilla taustakorjauksella.
Aiemmin tunnistettujen, afroamerikkalaiselle eturauhassyövälle spesifisten geneettisten tekijöiden kohdennettu RNA-sekvensointi vahvistaa muuttuneen ilmentymisen ja vaihtoehtoisen silmukoinnin näissä säätelemättömissä geeneissä.
Agilent Technologies SureSelect RNA Custom Capture Kit sieppaa ja sekvensoi transkriptit.
Afroamerikkalaiselle eturauhassyövälle spesifisten geneettisten tekijöiden epigeneettiset analyysit tunnistavat DNA-metylaatio- ja histonien modifikaatiomallit näissä säätelemättömissä geeneissä.
Sequenom EpiTYPER seuloa erilaista metylaatiota ja metylaatioerot kvantifioidaan käyttämällä pyrosekvensointia.
Erilaisia histonien modifikaatiomalleja tutkitaan.
Analyysi suoritetaan 33:lle eturauhassyövän biopsianäytteelle kustakin 6:sta rodun ja Gleason-asteen mukaan ositetusta ryhmästä.
|
jopa 2 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Sponsori
Tutkijat
- Päätutkija: Steven Patierno, PhD, Duke University
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Lauantai 1. marraskuuta 2014
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Maanantai 14. lokakuuta 2019
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Maanantai 14. lokakuuta 2019
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Torstai 12. kesäkuuta 2014
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Perjantai 29. elokuuta 2014
Ensimmäinen Lähetetty (Arvio)
Maanantai 1. syyskuuta 2014
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Perjantai 13. marraskuuta 2020
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Keskiviikko 11. marraskuuta 2020
Viimeksi vahvistettu
Sunnuntai 1. marraskuuta 2020
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- Pro00053535
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .