Molekylära mekanismer bakom prostatacancerskillnader (GENCADE)
11 november 2020 uppdaterad av: Duke University
Molekylära mekanismer bakom prostatacancerskillnader.
Syftet med denna studie är att ytterligare belysa de molekylära mekanismerna bakom prostatacancerskillnaderna.
I tidigare arbete har utredarna identifierat en uppsättning differentiellt avreglerade gener i afroamerikanska kontra kaukasisk amerikansk prostatacancer.
Baserat på dessa fynd antar de att de kommer att kunna validera dessa mål, som ursprungligen identifierades i det tidigare arbetet som utfördes vid George Washington University Medical Center, i en oberoende Duke University Medical Center-kohort av prostatacancerprover.
Dessutom antar utredarna att de kommer att kunna upptäcka nya mål i Duke University Medical Center-kohorten av prostatacancerprover på grund av regionala skillnader.
Studieöversikt
Status
Avslutad
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljerad beskrivning
Enskild patient afroamerikanska och kaukasiska amerikanska prostatabiopsikärnor eller kirurgiska prover kommer att erhållas från följande procedurer: transrektal ultraljudsbiopsi av prostata (TRUSBxP), MR-fusionsbiopsi, intraoperativt (IO) vid tidpunkten för prostatektomi.
Med hjälp av cellulärt DNA och RNA, isolerat från prostatacancer och patientmatchade normala prostatabiopsikärnor eller kirurgiska prover, kommer utredarna att utföra förfäders genotypning, exonmatriser, riktad RNA-sekvensering och epigenetiska analyser.
Som kontroller kommer även blod att samlas in.
Genomiska data från blod och tumörvävnad kommer att jämföras.
Studietyp
Observationell
Inskrivning (Faktisk)
226
Kontakter och platser
Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.
Studieorter
-
-
North Carolina
-
Durham, North Carolina, Förenta staterna, 27710
- Duke University Medical Center
-
-
Deltagandekriterier
Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
18 år och äldre (Vuxen, Äldre vuxen)
Tar emot friska volontärer
Nej
Kön som är behöriga för studier
Manlig
Testmetod
Icke-sannolikhetsprov
Studera befolkning
Studiepopulationen inkluderar afroamerikanska och kaukasiska amerikanska patienter (självrapporterade) som genomgår kliniskt indikerade diagnostiska biopsier för en misstänkt prostatamalignitet eller intraoperativa biopsier av patienter som genomgår kliniskt indikerad prostatektomi för en bekräftad prostatacancer.
Beskrivning
Inklusionskriterier:
- Misstänkt malignitet av prostatacancer
- Självrapporterad ras av afroamerikaner eller kaukasiska amerikaner
- Ålder >/= 18 år
- Kunna läsa, förstå och underteckna ett informerat samtycke
Exklusions kriterier:
- Insamlad tumörvävnad är otillräcklig för DNA- och RNA-analys och/eller är inte positiv för adenokarcinom i prostata.
- Patienter med tidigare systemisk terapi kommer inte att vara berättigade till studien, det vill säga strålning eller kemoterapi eller immunterapi.
Studieplan
Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Kaukasiska
Kaukasiska försökspersoner som har en biopsi eller prostatektomi.
|
|
|
Afroamerikan
Afroamerikanska försökspersoner som har en biopsi eller prostatektomi.
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Andel högt och lågt uttryck av identifierade genmål i kaukasiska och afroamerikanska exemplar
Tidsram: upp till 2 år
|
Totalt RNA kommer att förhöras för mRNA-expressionsmönster med Affymetrix Human Exon 1.0 ST GeneChip.
Mikroarraydata kommer att normaliseras genom kvantilnormalisering med bakgrundskorrigering.
Riktad RNA-sekvensering av de tidigare identifierade genetiska faktorerna specifika för afroamerikansk prostatacancer kommer att bekräfta förändrat uttryck och alternativ splitsning i dessa avreglerade gener.
Agilent Technologies SureSelect RNA Custom Capture Kit kommer att fånga och sekvensera transkript.
Epigenetiska analyser av de genetiska faktorerna som är specifika för afroamerikansk prostatacancer kommer att identifiera DNA-metylering och histonmodifieringsmönster i dessa avreglerade gener.
Sequenom EpiTYPER kommer att screena för differentiell metylering och metyleringsskillnader kommer att kvantifieras med hjälp av pyrosekvensering.
Differentiella histonmodifieringsmönster kommer att utforskas.
Analys kommer att utföras på 33 prostatacancerbiopsiprover från var och en av 6 grupper stratifierade efter ras och Gleason-grad.
|
upp till 2 år
|
Samarbetspartners och utredare
Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.
Sponsor
Utredare
- Huvudutredare: Steven Patierno, PhD, Duke University
Studieavstämningsdatum
Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
1 november 2014
Primärt slutförande (Faktisk)
14 oktober 2019
Avslutad studie (Faktisk)
14 oktober 2019
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
12 juni 2014
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
29 augusti 2014
Första postat (Uppskatta)
1 september 2014
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
13 november 2020
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
11 november 2020
Senast verifierad
1 november 2020
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Nyckelord
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- Pro00053535
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Nej
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Nej
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .