Bakteeriresistenssin nopea havaitseminen MALDI-TOF MS:n avulla ja antibioottien säästö (MALDI-TRAc)

Antibioottiresistenssi huolestuttaa suurinta osaa patogeenisista bakteereista. Antibiooteille vastustuskykyisten bakteerien osuus on erityisen suuri sairaalaympäristössä. Resistenssimekanismien kasautuminen voi johtaa monilääkeresistenssiin, terapeuttiseen umpikujaan ja sitä seuraavaan tartunnan saaneiden potilaiden korkeampaan kuolleisuuteen. Antibioottien käyttö ihmisillä ja eläimillä luo valintapaineita, jotka suosivat antibioottiresistenttien kantojen leviämistä. On välttämätöntä optimoida antibioottien kulutus näiden bakteerien leviämisen rajoittamiseksi. Se edellyttää sekä nopeaa bakteerien tunnistamista että niiden resistenssiprofiilin nopeaa määrittämistä, jotta voidaan käyttää kapeampia yhdisteitä.

Yleensä antibioottiherkkyystestaus kestää yleensä 18-24 tuntia. Massaspektrometriatyyppisestä matriisiavusteisesta laserdesorptioionisaatiosta lentoajasta (MALDI-TOF MS) on tullut arvokas työkalu patogeenien tunnistamiseen kliinisissä laboratorioissa. Alustavat tiedot osoittivat, että herkät ja resistentit bakteerit voidaan erottaa 1 tai 2 tunnissa uudella "MS-ASTRA"-nimisellä tekniikalla, joka perustuu alhaisempaan globaaliin huippuintensiteettiin kiinnostavan antibiootin läsnä ollessa (herkkyysraja-pistettä vastaavalla pitoisuudella EUCASTin määrittelemä) kuin sen puuttuessa. Tämän tutkimuksen tavoitteena on arvioida tämän uuden MALDI-TOF MS -menetelmän suorituskykyä villityypin ja resistenttien kliinisten isolaattien paneelissa.

Tämän tutkimuksen tavoitteena on määrittää Escherichia coli -isolaattien resistenssi kefotaksiimille, piperasilliini-tatsobaktaamille, amoksisilliinille ja toteuttaa menetelmä positiivisiin veriviljelmiin. Pienimmät estävät pitoisuudet määritetään standardiagar-laimennusmenetelmällä.

Tulokset ja täydellinen analyysi toimitetaan 2 vuoden sisällä. MS-ASTRA-tekniikalla saatuja tietoja verrataan kliinisten isolaattien resistenssitilanteeseen. Arvioidaan lyhin inkubaatioaika (1 tai 2 tuntia), joka antaa tarkemman tuloksen. Arvioidaan ne antibioottisäästöt, joita tämän uuden menetelmän käyttöönotto olisi voinut mahdollistaa.