Arbovirusten geneettinen evoluutio Uudessa-Kaledoniassa vuosina 1995-2024 ja Wolbachian vaikutus (DENWOLUTION)
Arbovirukset, taudit, jotka tarttuvat ihmisiin hyönteisvektorin puremasta, ovat suuri kansanterveysongelma erityisesti trooppisissa ja subtrooppisissa maissa. Lupaava strategia, jolla pyritään estämään arbovirusten kiertokulku, on vapauttaa endosymbioottista Wolbachia-bakteeria kantavia Aedes aegypti -hyttysiä. Vuonna 2019 Wolbachia-strategia toteutettiin Nouméassa osana World Mosquito -ohjelmaa. Tämä toimenpide muuttaa arbovirusten epidemiologista profiilia Uudessa-Kaledoniassa.
Arbovirusten epidemiologinen seuranta edellyttää potilaiden verestä saadun seerumin sisältämän viruksen molekulaarista karakterisointia. Tämä molekyylien karakterisointi RNA-eristystekniikoilla, RT-qPCR-seurannalla ja sekvensoinnilla mahdollistaa fylogeneettisten puiden rakentamisen.
Maailman hyttysohjelman täytäntöönpanon yhteydessä Nouméassa tutkijat aikovat seurata arbovirusten molekyylikehitystä ajanjaksolla, joka edeltää Wolbachiaa kantavien hyttysten leviämistä (1995–2019) ja sitten 5 vuoden ajan. julkaisujen jälkeen.
Samaan aikaan virus voidaan eristää soluviljelytekniikoilla ja in vitro -infektioilla, mikä mahdollistaa sen tutkimuksen in vitro soluissa tai in vivo hyttysissä. Tämän tutkimuksen avulla voimme mitata Wolbachia-strategian vaikutusta viruksen kykyyn replikoitua soluissa Wolbachian läsnäollessa ja levitä hyttysen välityksellä.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Verinäytteiden kerääminen potilailta, joilla on arbovirusinfektio
Tämä tutkimus on interventiotutkimus, jossa on retrospektiivinen osa.
Tämä tutkimus parantaa:
- arbovirusten molekyylievoluution arviointi Wolbachia-strategian toteuttamista edeltävänä aikana
- tieto Wolbachian vaikutuksista arbovirusten monimuotoisuuteen ja molekyylien evoluutioon
- arboviruksen leviämis- ja replikaatiomekanismien ymmärtäminen Wolbachian läsnä ollessa
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Myrielle Dupont-Rouzeyrol, PhD
- Puhelinnumero: +687 27 75 30
- Sähköposti: mdupont@pasteur.nc
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Catherine Inizan, PhD
- Puhelinnumero: +687 27 26 66
- Sähköposti: cinizan@pasteur.fr
Opiskelupaikat
-
-
Nouvelle-Calédonie
-
Dumbéa Sur Mer, Nouvelle-Calédonie, Ranska, 98 835
- Rekrytointi
- Centre Hospitalier Territorial
-
Ottaa yhteyttä:
- Ann-Claire Gourinat, MD
- Puhelinnumero: +687 208000
- Sähköposti: ann-claire.gourinat@cht.nc
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Kliinisten oireiden ilmaantuminen, jotka viittaavat arbovirusinfektioon 7 päivää ennen verinäytettä,
- Diagnostinen vahvistus RT-qPCR:llä dengueviruksen tai muun arboviruksen aiheuttamasta monoinfektiosta.
- Potilaat tai heidän edustajansa, joille on ilmoitettu alun perin diagnostisiin tarkoituksiin otettujen näytteiden ja niiden johdannaisten mahdollisesta toissijaisesta käytöstä tutkimustarkoituksiin ja jotka eivät ole sittemmin ilmaisseet vastustavansa näytteiden diagnostiikan tai niiden johdannaisten toissijaista käyttöä tutkimukseen,
Poissulkemiskriteerit:
- Potilaan tai hänen edustajansa dokumentoitu vastustus
- Aikaisemmin määritetty virusmäärä liian alhainen.
- Näyte, joka on otettu näytteestä, joka on otettu yli 7 päivää infektion kliinisten merkkien ilmaantumisen jälkeen.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
arboviruksen genomin sekvensointi
Aikaikkuna: 5 vuotta
|
Vuosina 1995–2024 kerättyjen potilaiden verinäytteistä erotetun viruksen koko genomin sekvensointi
|
5 vuotta
|
|
arboviruskantojen geneettinen evoluutio
Aikaikkuna: 5 vuotta
|
Vuosina 1995–2024 kerättyjen seeruminäytteiden sisältämien arboviruskantojen genomin bioinformaattinen analyysi
|
5 vuotta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Wolbachian vaikutuksen mittaaminen viruksen geneettiseen evoluutioon
Aikaikkuna: 5 vuotta
|
Vuosina 1995–2024 kerätyistä verinäytteistä erotettujen virusgenomien vertailu
|
5 vuotta
|
|
mittaamalla näiden virusten kykyä replikoitua Wolbachian läsnä ollessa
Aikaikkuna: 5 vuotta
|
solulinjojen infektio viruskannoilla, jotka on eristetty ja monistettu potilaiden verinäytteistä, jotka on kerätty vuosina 1995–2024
|
5 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Myrielle Dupont-Rouzeyrol, PhD, Institut Pasteur de Nouvelle-Calédonie
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 2019-022
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .