Evolution génétique des arbovirus en Nouvelle-Calédonie entre 1995 et 2024 et impact de Wolbachia (DENWOLUTION)
Les arbovirus, maladies transmises à l'homme par la piqûre d'un insecte vecteur, constituent un problème majeur de santé publique, notamment dans les pays tropicaux et subtropicaux. Une stratégie prometteuse visant à bloquer la circulation des arbovirus consiste à lâcher des moustiques Aedes aegypti porteurs de la bactérie endosymbiotique Wolbachia. En 2019, la stratégie Wolbachia a été mise en place à Nouméa dans le cadre du Programme Mondial Moustique. Cette intervention va modifier le profil épidémiologique des arbovirus en Nouvelle-Calédonie.
La surveillance épidémiologique des arbovirus nécessite la caractérisation moléculaire du virus contenu dans le sérum obtenu à partir du sang prélevé chez les patients. Cette caractérisation moléculaire par des techniques d'isolement d'ARN, de suivi RT-qPCR et de séquençage permet la construction d'arbres phylogénétiques.
Dans le cadre de la mise en place du Programme Mondial Moustique à Nouméa, les enquêteurs prévoient de suivre l'évolution moléculaire des arbovirus, sur la période précédant les lâchers de moustiques porteurs de Wolbachia (de 1995 à 2019) puis sur une période de 5 ans. suite aux sorties.
Parallèlement, le virus peut être isolé par des techniques de culture cellulaire et des infections in vitro, permettant son étude in vitro dans des cellules ou in vivo chez des moustiques. Cette étude permet de mesurer l'impact de la stratégie Wolbachia sur l'évolution de la capacité du virus à se répliquer dans les cellules en présence de Wolbachia et à être transmis par le moustique.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Description détaillée
Prélèvement d'échantillons de sang de patients infectés par des arbovirus
Cette étude est une étude non interventionnelle avec une partie rétrospective.
Cette étude permettra d'améliorer :
- le bilan de l'évolution moléculaire des arbovirus dans la période précédant la mise en place de la stratégie Wolbachia
- la connaissance de l'impact de Wolbachia sur la diversité et l'évolution moléculaire des arbovirus
- la compréhension des mécanismes de transmission et de réplication des arbovirus en présence de Wolbachia
Type d'étude
Inscription (Estimé)
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
- Nom: Myrielle Dupont-Rouzeyrol, PhD
- Numéro de téléphone: +687 27 75 30
- E-mail: mdupont@pasteur.nc
Sauvegarde des contacts de l'étude
- Nom: Catherine Inizan, PhD
- Numéro de téléphone: +687 27 26 66
- E-mail: cinizan@pasteur.fr
Lieux d'étude
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Nouvelle-Calédonie
-
Dumbéa Sur Mer, Nouvelle-Calédonie, France, 98 835
- Recrutement
- Centre Hospitalier Territorial
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Contact:
- Ann-Claire Gourinat, MD
- Numéro de téléphone: +687 208000
- E-mail: ann-claire.gourinat@cht.nc
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- Apparition de signes cliniques évocateurs d'une infection à arbovirus dans les 7 jours précédant la prise de sang,
- Confirmation diagnostique par RT-qPCR d'une mono-infection par le virus de la dengue ou un autre arbovirus.
- Les patients ou leur(s) représentant(s) informé(s) de l'éventuelle utilisation secondaire à des fins de recherche des échantillons initialement prélevés à des fins de diagnostic et de leurs dérivés, et qui n'ont pas manifesté depuis leur opposition à l'utilisation secondaire des échantillons de diagnostic ou de leurs dérivés à des fins de recherche,
Critère d'exclusion:
- Opposition documentée d'un patient ou de son (ses) représentant(s)
- Charge virale précédemment établie trop faible.
- Échantillon obtenu à partir d'un prélèvement effectué plus de 7 jours après l'apparition des signes cliniques d'infection.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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séquençage du génome des arbovirus
Délai: 5 années
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Séquençage du génome entier du virus extrait d'échantillons sanguins de patients prélevés de 1995 à 2024
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5 années
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évolution génétique des souches d'arbovirus
Délai: 5 années
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analyse bioinformatique du génome des souches d'arbovirus contenues dans des échantillons de sérum prélevés de 1995 à 2024
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5 années
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
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mesure de l'impact de Wolbachia sur l'évolution génétique du virus
Délai: 5 années
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comparaison de génomes viraux extraits d'échantillons sanguins prélevés de 1995 à 2024
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5 années
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mesure de la capacité de ces virus à se répliquer en présence de Wolbachia
Délai: 5 années
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infection de lignées cellulaires par des souches virales isolées et amplifiées à partir d'échantillons de sang de patients prélevés de 1995 à 2024
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5 années
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Collaborateurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Myrielle Dupont-Rouzeyrol, PhD, Institut Pasteur de Nouvelle-Calédonie
Publications et liens utiles
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Estimé)
Achèvement de l'étude (Estimé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- 2019-022
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
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