Zoonoosiksi epäillyn kuumeen tutkiminen kehittyneitä diagnostisia tekniikoita käyttäen

Tämän tutkimuksen tavoitteena on soveltaa kehittynyttä teknologiaa kuumeisten sairauksien tutkimukseen beduiiniväestössä, jotta laboratoriodiagnoosin nopeus ja herkkyys paranevat ja ymmärryksemme paremmin beduiiniväestön tartuntatautien patofysiologiasta, mukaan lukien erilaiset ympäristöaltistukset, kuten esim. Eläinten, veden ja jätteiden ja antibioottien altistuminen sekä patogeenien virulenssiin liittyvät isännän ja patogeenin vuorovaikutukset, kroonisuuteen ja uusiutumiseen liittyvät tekijät sekä hoitovaste.

Tutkimusprotokolla:

Ilmoittautuminen:

1. Seulonnan jälkeen potilaita lähestytään ja heille tarjotaan mahdollisuus osallistua tutkimukseen.
2. Tietoisen suostumuksen allekirjoittamisen jälkeen potilasta haastatellaan ja ilmoittautumislomake täytetään.
3. Jos potilas on ilmoittautunut ensiapuun, veri-, sylki- ja ulostenäytteet otetaan. Jos potilaalla ilmenee ihottumaa tai ihovaurio, avovauriosta otetaan vanupuikko.
4. Jos potilas on otettu mukaan antibioottien saamisen jälkeen, yritämme paikantaa myös jäljellä olevat verinäytteet, jotka otettiin ED:stä ennen antibioottien saamista.

Seuranta:

• Sairaalahoidon aikana:

  • Seitsemän päivää sairaalahoidon jälkeen tai kotiutuspäivänä (sen mukaan kumpi tulee ensin) yritetään ottaa toinen näytesarja (veri, sylki ja uloste), ja kliiniset tiedot otetaan lääketieteellisistä tiedoista oireiden häviämisestä. , antibioottihoito, komplikaatiot jne. Jos sairaalahoidon aikana tehdään diagnostisia tai terapeuttisia tarkoituksia varten tehtyjä kirurgisia toimenpiteitä (esim. ihobiopsia, luubiopsia, artrosenteesi, lannepunktio), kaikki kliinisiin tarkoituksiin tarpeettomiksi katsotut jäännökset hyödynnetään analysoinnissa.
  • Sairaalahoidon aikana potilaita haastatellaan ja WASH (Water, Sanitation and Hygiene) -kyselylomake täytetään.

• Kotiutuksen jälkeinen ambulatorinen seuranta:

  • Suunnitellun tartuntatautiklinikan seurantakäynnin (tai muun suunnitellun käynnin yhteydessä SUMC:n ambulatoriossa) tapauksessa, jos verinäytteitä tehdään, yritetään ottaa kokoveri- ja seeruminäytteitä tutkimustarkoituksiin. Jos tutkimukseen tarkoitettu verinäytteenotto ei ole mahdollista, ylijäämämateriaali hyödynnetään tutkimustarkoituksiin. Jos katsotaan kliinisesti merkitykselliseksi, täytetään seurantalomake.

• Toistuvat sairaalahoidot tutkimusjakson aikana

  o Jos potilas otetaan toistuvasti vuoden aikana ilmoittautumisen jälkeen, tutkimusryhmä arvioi sairaalahoidon "liittyneeksi" tai "ei-liittyväksi" alkuperäiseen diagnoosiin. Mikäli sen katsotaan liittyvän tutkittuun sairauteen tai sen komplikaatioihin, yritetään ottaa uusi verinäyte, ja muiden kehon alueiden kliinisistä näytteistä (biopsia, leikkaus tai drenaasi) jäänyt materiaali hyödynnetään analysointiin. Jos katsotaan kliinisesti merkitykselliseksi, täytetään seurantalomake. Koska toistuvia sairaalahoitoja analysoidaan osana tutkimusta, niitä ei pidetä vakavina haittatapahtumina (SAE).

• Kuusi kuukautta ilmoittautumisen jälkeen:

  o Puhelinhaastattelu kliinisten tulosten selvittämiseksi (pöytäkirja liitteenä).

• Opintojakson loppu:

  • Vuoden kuluttua ilmoittautumisesta potilaan lääketieteellisistä tiedostoista kerätään tiedot antibioottien käytöstä, toistuvista sairaalahoidoista ja pitkäaikaisista komplikaatioista.

Näytekokoelma:

Jokaiselle tähän tutkimukseen osallistuvalle potilaalle tehdään seuraava käsittely:

Verinäytteenotto:

Kokoveri- ja seeruminäytteet otetaan ilmoittautumisen yhteydessä ja mahdollisuuksien mukaan kotiutuksen ja jokaisen suunnitellun ambulatorisen poliklinikkakäynnin tai toistuvan sairaalahoidon yhteydessä. Jos potilas on otettu sairaalahoitoon positiivisen testituloksen vuoksi, ennen antibioottihoitoa otetuista kliinisistä ei-tutkimuksen näytteistä jäännöksiä voidaan mahdollisesti käyttää tutkimustarkoituksiin, kunhan niitä ei tarvita kliiniseen käyttöön. ja tavanomaisessa säilytysajassa asianomaisessa sairaalan laboratoriossa. Kullakin aikapisteellä analyysiin saatava enimmäisveritilavuus on 10 ml aikuisilla ja 5 ml lapsilla.

Muut kliiniset näytteet:

Ilmoittautumisen yhteydessä otetaan sylki- ja ulostenäytteitä mikrobiologista analyysiä varten, mukaan lukien mikrobiomiprofilointi, ja mahdolliset ihottumat tai haavanäytteet analysoidaan myös molekyyli- ja metagenomisin menetelmin syyllisen taudinaiheuttajan diagnosoimiseksi.

Näytteen käsittely ja analyysi:

Kaikki näytteet säilytetään Moran-Giladin laboratoriossa, Negevin Ben-Gurionin yliopiston terveystieteiden tiedekunnan laboratoriossa viiden vuoden ajan ilmoittautumisen jälkeen. Näytteiden käsittely tapahtuu erissä, ei reaaliajassa, joten se ei tuota reaaliaikaista dataa, joka voisi vaikuttaa kliinisiin päätöksiin. Analyysin tulokset eivät ole hoitavan lääkärin saatavilla. Bakteerien genomista/metagenomista sekvensointia varten DNA erotetaan kokoverinäytteistä ja vain mikrobi-DNA tunnistetaan ja analysoidaan uutetusta materiaalista. Tässä tutkimuksessa ei tehdä ihmisen DNA:ta koskevaa tutkimusta. Standardiviljelmissä kasvatetut bakteeri-isolaatit analysoidaan lisäkarakterisointia varten (esim. virulenssi). Brucella tai muut standardiviljelmillä tunnistetut bakteeri-isolaatit analysoidaan edelleen käyttämällä in vitro -malleja, mukaan lukien kudosviljelmä isäntä-patogeenivuorovaikutusten analysoimiseksi. Immuunivaste kliinisissä näytteissä analysoidaan isännän tulehdussignaalien varalta (esim. geeniekspressio, proteiinien mittaus). Diagnostisen kyvyn parantamiseksi kokoverinäytteistä tehdään erityisiä PCR-testejä zoonoosien (kuten Brucella, Rickettsia ja Q-kuume tai muut tarvittaessa) varalta. ja verrattuna serologiseen käsittelyyn, joka suoritetaan seeruminäytteitä käyttäen. Kaikki näytteet analysoidaan asianmukaisen bioturvallisuustason ja hyvien laboratoriokäytäntöjen mukaisesti.

Metatietojen kerääminen ja potilastiedot Kaikkia potilaita pyydetään täyttämään kyselylomake, joka koskee heidän nykyistä sairauttaan (liitteenä hepreaksi ja arabiaksi), heidän elinolojaan ja altistumistaan ​​eläimille.

Metatiedot, mukaan lukien demografiset tiedot, terveydentila, mukaan lukien krooniset sairaudet, ja aiemmat sairaalahoidot, aiemmat zoonoositaudit, kerätään lääketieteellisistä tiedoista. Sairaalahoidon aikana kerätään seuraavat parametrit: elintoiminnot, mukaan lukien aika kuumeen häviämiseen, laboratoriotutkimukset ja kuvantamistulokset sekä mahdolliset kirurgiset toimenpiteet tai tehohoitoyksikön oleskelu.

Tietoja kerätään myös potilaan lääketieteellisistä tiedoista tutkimukseen ilmoittautumista seuraavan vuoden aikana koskien kliinisiin tuloksiin liittyviä tekijöitä, mukaan lukien: toistuvat sairaalahoidot, antibioottien käyttö, verikokeiden seurantatulokset, kuten tulehdusmarkkerit, verenkuva, maksaentsyymit ja seuranta. serologiset testit.

Tutkimusjakso ja koko Tähän tutkimukseen on tarkoitus osallistua yhteensä 500 potilasta kolmen vuoden aikana syyskuusta 2020 alkaen.

Eettiset näkökohdat ja tietoturva Kaikille tutkimukseen osallistuville potilaille annetaan tutkimussarjanumero. Kaikki tämän tutkimuksen aikana kerätyt näytteet merkitään tutkimusnumerolla, eikä kerätyissä näytteissä ole muita tunnistetietoja. Myös metatietoja ja kyselylomakkeita sisältävät tiedostot merkitään tutkimusnumerolla. Ilmoitetut suostumuslomakkeet, jotka sisältävät tunnistetiedot, säilytetään lukitussa toimistossa, johon vain tutkimusryhmä pääsee käsiksi, ja koodaustiedosto, joka vastaa tunnistemateriaalia tutkimusnumeroineen, tallennetaan salasanasuojatulle palvelimelle sairaalan tietokoneille. Tunnistetietoja käytetään jatkopuhelinhaastattelussa opiskelujakson lopussa, minkä jälkeen kaikki saadut tiedot poistetaan henkilöllisyydestä ja tallennetaan tutkimuskoodilla. Kaikki tiedot tallennetaan REDCap-suojatulla verkkosovelluksella.