Investigación de fiebre sospechosa de zoonosis mediante tecnologías de diagnóstico avanzadas

Este estudio tiene como objetivo aplicar tecnologías avanzadas para la investigación de enfermedades febriles en la población beduina, a fin de mejorar el diagnóstico de laboratorio en términos de rapidez y sensibilidad y mejorar nuestra comprensión de la fisiopatología de las enfermedades infecciosas en la población beduina, incluidas diversas exposiciones ambientales como como animales, agua y desechos y exposición a antibióticos, así como interacciones huésped-patógeno asociadas con la virulencia del patógeno, factores asociados con la cronicidad y la recaída, y la respuesta al tratamiento.

Protocolo de estudio:

Inscripción:

1. Después de la selección, se acercará a los pacientes y se les ofrecerá la oportunidad de participar en el estudio.
2. Después de firmar un consentimiento informado, se entrevistará al paciente y se completará un cuestionario de inscripción.
3. Si el paciente está inscrito en el servicio de urgencias, se recogerán muestras de sangre, saliva y heces. En caso de que el paciente presente una erupción o una lesión en la piel, se obtendrá un hisopo de una lesión abierta.
4. Si el paciente se inscribió después de recibir antibióticos, también intentaremos localizar las muestras de sangre sobrantes que se extrajeron en el servicio de urgencias antes de recibir los antibióticos.

Hacer un seguimiento:

• Durante la hospitalización:

  • Siete días después de la hospitalización o el día del alta (lo que ocurra primero), se intentará obtener un segundo conjunto de muestras (sangre, saliva y heces), y se extraerán datos clínicos de la historia clínica con respecto a la resolución de los síntomas. , tratamiento antibiótico, complicaciones, etc. En caso de cualquier procedimiento quirúrgico realizado durante el período de hospitalización con fines diagnósticos o terapéuticos (p. biopsia de piel, biopsia ósea, artrocentesis, punción lumbar), cualquier material sobrante que se considere innecesario para fines clínicos se utilizará para el análisis.
  • Durante la hospitalización, los pacientes serán entrevistados y se completará un cuestionario WASH (Agua, Saneamiento e Higiene).

• Seguimiento ambulatorio posterior al alta:

  • En el caso de una visita de seguimiento programada en la clínica de enfermedades infecciosas (o cualquier otra visita planificada en el servicio ambulatorio de SUMC), si se realiza un muestreo de sangre, se intentará obtener muestras de sangre completa y suero para fines de investigación. Si la muestra de sangre designada para el estudio no es factible, el material sobrante se utilizará con fines de investigación. Si se considera clínicamente relevante, se completará un cuestionario de seguimiento.

• Hospitalizaciones recurrentes dentro del período de estudio

  o En caso de ingreso recurrente durante el año posterior a la inscripción, el equipo de investigación evaluará la hospitalización como "relacionada" o "no relacionada" con el diagnóstico original. Si se considera relacionado con la enfermedad estudiada o sus complicaciones, se intentará realizar otro muestreo de sangre y se utilizará para el análisis cualquier material sobrante del muestreo clínico de otros sitios del cuerpo (biopsias, intervención quirúrgica o drenaje). Si se considera clínicamente relevante, se completará un cuestionario de seguimiento. Dado que las hospitalizaciones recurrentes se analizan como parte del estudio, no se considerarán eventos adversos graves (SAE).

• Seis meses después de la inscripción:

  o Entrevista telefónica para establecer resultados clínicos (protocolo adjunto en anexo).

• Fin del período de estudio:

  • Un año después de la inscripción, los datos sobre el uso de antibióticos, las hospitalizaciones recurrentes y las complicaciones a largo plazo se recopilarán de los archivos médicos del paciente.

Coleccion de muestra:

Cada paciente inscrito en este estudio se someterá al siguiente estudio:

Muestra de sangre:

Se obtendrán muestras de sangre completa y suero en el momento de la inscripción y, si es posible, al momento del alta y en cada visita planificada a la clínica ambulatoria para pacientes ambulatorios u hospitalización recurrente. En caso de que el paciente se inscribiera durante la estancia en el hospital debido a un resultado positivo de la prueba, los restos restantes de las muestras clínicas que no sean de investigación obtenidas antes del tratamiento con antibióticos se utilizarán potencialmente para fines de investigación, siempre que no sean necesarios para uso clínico. , y dentro del plazo habitual de su almacenamiento en el laboratorio hospitalario correspondiente. El volumen de sangre máximo obtenido para el análisis en cada momento será de 10 ml para adultos y de 5 ml para niños.

Otro muestreo clínico:

En el momento de la inscripción, se obtendrán muestras de saliva y heces para el análisis microbiológico, incluido el perfil del microbioma, y ​​cualquier muestra de sarpullido o herida también se analizará mediante métodos moleculares y metagenómicos para el diagnóstico del patógeno culpable.

Procesamiento y análisis de muestras:

Todas las muestras se almacenarán en el laboratorio Moran-Gilad, Facultad de Ciencias de la Salud, Universidad Ben-Gurion del Negev, durante cinco años después de la inscripción. El procesamiento de las muestras se realizará por lotes y no en tiempo real, por lo que no producirá ningún dato en tiempo real que pueda afectar las decisiones clínicas. Los resultados de los análisis no estarán disponibles para el médico tratante. A los efectos de la secuenciación genómica/metagenómica bacteriana, se extraerá el ADN de las muestras de sangre completa y solo se identificará y analizará el ADN microbiano del material extraído. En este estudio no se realizará ninguna investigación sobre el ADN humano. Los aislados bacterianos cultivados en cultivos estándar se analizarán para una mayor caracterización (p. virulencia). Brucella u otros aislados bacterianos identificados a través de cultivos estándar se analizarán más a fondo utilizando modelos in vitro, incluido el cultivo de tejidos para el análisis de las interacciones huésped-patógeno. La respuesta inmunitaria en muestras clínicas se analizará en busca de señales inflamatorias del huésped (p. expresión génica, medición de proteínas). Con el fin de mejorar la capacidad diagnóstica, se realizarán pruebas de PCR específicas para zoonosis (como Brucella, Rickettsia, Fiebre Q u otras según sea necesario) en muestras de sangre completa, tratando de examinar su utilidad y concordancia con otros medios de diagnóstico. y en comparación con el estudio serológico que se realizará utilizando muestras de suero. Todas las muestras serán analizadas de acuerdo con el nivel de bioseguridad adecuado y las buenas prácticas de laboratorio.

Recopilación de metadatos e información del paciente A todos los pacientes se les pedirá que completen un cuestionario sobre los detalles de su enfermedad actual (adjunto en hebreo y árabe), y sus condiciones de vida y exposición a los animales.

Los metadatos que incluyen datos demográficos, estado de salud, incluidas enfermedades médicas crónicas y hospitalizaciones previas, antecedentes de enfermedades zoonóticas, se recopilarán de los registros médicos. Durante la hospitalización se recopilarán los siguientes parámetros: signos vitales, incluido el tiempo hasta la resolución de la fiebre, resultados de pruebas de laboratorio e imágenes, y cualquier procedimiento quirúrgico o estancia en la unidad de cuidados intensivos.

También se recopilarán datos de los registros médicos del paciente durante el año posterior a la inscripción en el estudio con respecto a los factores asociados con los resultados clínicos, que incluyen: hospitalizaciones recurrentes, consumo de antibióticos, resultados de análisis de sangre de seguimiento, como marcadores inflamatorios, hemograma, enzimas hepáticas y seguimiento. realizar pruebas serológicas.

Período y tamaño del estudio Este estudio tiene como objetivo incluir un total de 500 pacientes, durante tres años, a partir de septiembre de 2020.

Consideraciones éticas y seguridad de los datos A todos los pacientes inscritos en el estudio se les asignará un número de serie del estudio. Todas las muestras recolectadas durante este estudio se etiquetarán con el número de estudio y ninguna otra información de identificación estará presente en las muestras recolectadas. Los archivos que contengan metadatos y cuestionarios también se etiquetarán con el número de estudio. Los formularios de consentimiento informado que contengan datos de identificación se guardarán en una oficina cerrada con llave a la que solo tendrá acceso el equipo del estudio y se guardará un archivo de codificación que coincida con el material de identificación con los números del estudio en un servidor protegido con contraseña en las computadoras del hospital. Los datos de identificación se utilizarán para la entrevista telefónica de seguimiento al final del período de estudio, y toda la información obtenida se desidentificará y se almacenará utilizando el código de estudio. Todos los datos se almacenarán utilizando la aplicación web segura REDCap.