Untersuchung von Fieber mit Verdacht auf eine Zoonose mithilfe fortschrittlicher Diagnosetechnologien

Diese Studie zielt darauf ab, fortschrittliche Technologien zur Untersuchung fieberhafter Erkrankungen in der Beduinenbevölkerung anzuwenden, um die Labordiagnose im Hinblick auf Schnelligkeit und Empfindlichkeit zu verbessern und unser Verständnis der Pathophysiologie von Infektionskrankheiten in der Beduinenbevölkerung einschließlich verschiedener Umweltexpositionen wie z B. Tier-, Wasser- und Abfall- und Antibiotika-Exposition, sowie Wirt-Pathogen-Wechselwirkungen im Zusammenhang mit der Pathogenvirulenz, Faktoren im Zusammenhang mit Chronizität und Rückfällen und das Ansprechen auf die Behandlung.

Studienprotokoll:

Einschreibung:

1. Nach dem Screening werden die Patienten angesprochen und ihnen wird die Möglichkeit geboten, an der Studie teilzunehmen.
2. Nach der Unterzeichnung einer Einverständniserklärung wird der Patient befragt und ein Aufnahmefragebogen ausgefüllt.
3. Wenn der Patient in die Notaufnahme aufgenommen wird, werden Blut-, Speichel- und Stuhlproben entnommen. Falls der Patient einen Ausschlag oder eine Hautläsion hat, wird ein Abstrich von einer offenen Läsion entnommen.
4. Wenn der Patient nach Erhalt von Antibiotika aufgenommen wurde, werden wir auch versuchen, übrig gebliebene Blutproben zu lokalisieren, die vor der Antibiotikagabe in der Notaufnahme entnommen wurden.

Nachverfolgen:

• Während des Krankenhausaufenthaltes:

  • Sieben Tage nach dem Krankenhausaufenthalt oder am Tag der Entlassung (je nachdem, was zuerst eintritt) wird versucht, einen zweiten Satz Proben (Blut, Speichel und Stuhl) zu entnehmen, und aus den Krankenakten werden klinische Daten zur Beseitigung der Symptome entnommen , Antibiotikabehandlung, Komplikationen usw. Bei chirurgischen Eingriffen, die während des Krankenhausaufenthalts zu diagnostischen oder therapeutischen Zwecken durchgeführt werden (z. B. B. Hautbiopsie, Knochenbiopsie, Arthrozentese, Lumbalpunktion), wird jegliches übrig gebliebene Material, das für klinische Zwecke als unnötig erachtet wird, zur Analyse verwendet.
  • Während des Krankenhausaufenthaltes werden die Patienten befragt und ein WASH-Fragebogen (Wasser, Sanitäranlagen und Hygiene) ausgefüllt.

• Ambulante Nachsorge nach der Entlassung:

  • Im Falle eines geplanten Folgebesuchs in der Klinik für Infektionskrankheiten (oder eines anderen geplanten Besuchs im ambulanten Dienst des SUMC) wird bei Durchführung einer Blutentnahme versucht, Vollblut- und Serumproben für Forschungszwecke zu entnehmen. Wenn eine studienbezogene Blutentnahme nicht möglich ist, wird das übrig gebliebene Material für Forschungszwecke verwendet. Wenn dies als klinisch relevant erachtet wird, wird ein Folgefragebogen ausgefüllt.

• Wiederkehrende Krankenhausaufenthalte innerhalb des Studienzeitraums

  o Im Falle einer erneuten Aufnahme im Laufe des Jahres nach der Einschreibung wird der Krankenhausaufenthalt vom Forschungsteam als „im Zusammenhang“ oder „nicht im Zusammenhang“ mit der ursprünglichen Diagnose bewertet. Wenn ein Zusammenhang mit der untersuchten Krankheit oder ihren Komplikationen vermutet wird, wird versucht, eine weitere Blutentnahme durchzuführen, und sämtliches übrig gebliebenes Material aus der klinischen Probenahme an anderen Körperstellen (Biopsien, chirurgischer Eingriff oder Drainage) wird zur Analyse verwendet. Wenn dies als klinisch relevant erachtet wird, wird ein Folgefragebogen ausgefüllt. Da wiederkehrende Krankenhausaufenthalte im Rahmen der Studie analysiert werden, werden sie nicht als schwerwiegende unerwünschte Ereignisse (SAE) betrachtet.

• Sechs Monate nach der Einschreibung:

  o Telefoninterview zur Feststellung der klinischen Ergebnisse (Protokoll im Anhang).

• Ende der Studienzeit:

  • Ein Jahr nach der Einschreibung werden Daten zum Antibiotikaeinsatz, wiederkehrenden Krankenhausaufenthalten und Langzeitkomplikationen aus den Krankenakten des Patienten erfasst.

Beispielsammlung:

Jeder in diese Studie aufgenommene Patient wird der folgenden Untersuchung unterzogen:

Blutprobe:

Vollblut- und Serumproben werden bei der Einschreibung und, wenn möglich, bei der Entlassung und bei jedem geplanten ambulanten Klinikbesuch oder wiederkehrenden Krankenhausaufenthalt entnommen. Falls der Patient während eines Krankenhausaufenthalts aufgrund eines positiven Testergebnisses aufgenommen wurde, werden alle verbleibenden Reste von klinischen, nicht forschungsbezogenen Proben, die vor der Antibiotikabehandlung entnommen wurden, möglicherweise für Forschungszwecke verwendet, sofern sie nicht für die klinische Verwendung benötigt werden und innerhalb des üblichen Zeitrahmens ihrer Lagerung im entsprechenden Krankenhauslabor. Das zu jedem Zeitpunkt zur Analyse entnommene maximale Blutvolumen beträgt 10 ml für Erwachsene und 5 ml für Kinder.

Andere klinische Probenahme:

Bei der Einschreibung werden Speichel- und Stuhlproben für die mikrobiologische Analyse einschließlich Mikrobiomprofilierung entnommen, und alle Hautausschlag- oder Wundproben werden auch mit molekularen und metagenomischen Methoden analysiert, um den ursächlichen Erreger zu diagnostizieren.

Probenverarbeitung und Analyse:

Alle Proben werden nach der Einschreibung fünf Jahre lang im Moran-Gilad-Labor der Fakultät für Gesundheitswissenschaften der Ben-Gurion-Universität des Negev aufbewahrt. Die Verarbeitung der Proben erfolgt stapelweise und nicht in Echtzeit. Daher werden keine Echtzeitdaten erzeugt, die klinische Entscheidungen beeinflussen könnten. Die Ergebnisse der Analyse stehen dem behandelnden Arzt nicht zur Verfügung. Zum Zweck der bakteriellen Genom-/Metagenomsequenzierung wird DNA aus Vollblutproben extrahiert und aus dem extrahierten Material wird nur mikrobielle DNA identifiziert und analysiert. In dieser Studie wird keine Forschung an menschlicher DNA durchgeführt. In Standardkulturen gezüchtete Bakterienisolate werden zur weiteren Charakterisierung analysiert (z. B. Virulenz). Brucella oder andere durch Standardkulturen identifizierte Bakterienisolate werden mithilfe von In-vitro-Modellen, einschließlich Gewebekulturen, zur Analyse von Wirt-Pathogen-Wechselwirkungen weiter analysiert. Die Immunantwort in klinischen Proben wird auf Entzündungssignale des Wirts analysiert (z. B. Genexpression, Messung von Proteinen). Zur Verbesserung der Diagnosefähigkeit werden an Vollblutproben spezifische PCR-Tests auf Zoonosen (z. B. Brucella, Rickettsia und Q-Fieber oder andere nach Bedarf) durchgeführt, um deren Nützlichkeit und Übereinstimmung mit anderen Diagnosemethoden zu prüfen. und verglichen mit der serologischen Aufarbeitung, die anhand von Serumproben durchgeführt wird. Alle Proben werden gemäß der angemessenen Biosicherheitsstufe und guten Laborpraktiken analysiert.

Erfassung von Metadaten und Patienteninformationen Alle Patienten werden gebeten, einen Fragebogen zu den Einzelheiten ihrer aktuellen Erkrankung (auf Hebräisch und Arabisch beigefügt) sowie zu ihren Lebensbedingungen und ihrem Kontakt mit Tieren auszufüllen.

Aus den Krankenakten werden Metadaten wie demografische Daten, Gesundheitszustand, einschließlich chronischer Erkrankungen, frühere Krankenhausaufenthalte und zoonotische Erkrankungen in der Vorgeschichte erfasst. Während des Krankenhausaufenthalts werden die folgenden Parameter erfasst: Vitalfunktionen, einschließlich der Zeit bis zum Abklingen des Fiebers, Labortests und Bildgebungsergebnisse sowie alle chirurgischen Eingriffe oder Aufenthalte auf der Intensivstation.

Im Laufe des Jahres nach der Aufnahme in die Studie werden auch Daten aus den Krankenakten des Patienten zu Faktoren erhoben, die mit den klinischen Ergebnissen in Zusammenhang stehen, darunter: wiederkehrende Krankenhauseinweisungen, Antibiotikaverbrauch, Folgebluttestergebnisse wie Entzündungsmarker, Blutbild, Leberenzyme usw serologische Tests durchführen.

Studienzeitraum und -größe Ziel dieser Studie ist es, ab September 2020 über einen Zeitraum von drei Jahren insgesamt 500 Patienten einzubeziehen.

Ethische Überlegungen und Datensicherheit Allen in die Studie aufgenommenen Patienten wird eine fortlaufende Studiennummer zugewiesen. Alle während dieser Studie gesammelten Proben werden mit der Studiennummer gekennzeichnet und es werden keine weiteren identifizierenden Informationen auf den gesammelten Proben vorhanden sein. Dateien mit Metadaten und Fragebögen werden ebenfalls mit der Studiennummer gekennzeichnet. Einverständniserklärungen mit identifizierenden Daten werden in einem verschlossenen Büro aufbewahrt, auf das nur das Studienteam zugreifen kann, und eine Codierungsdatei, die das identifizierende Material mit den Studiennummern abgleicht, wird auf einem passwortgeschützten Server auf Krankenhauscomputern gespeichert. Identifizierende Daten werden für das anschließende Telefoninterview am Ende des Studienzeitraums verwendet. Alle erhaltenen Informationen werden dann anonymisiert und unter Verwendung des Studiencodes gespeichert. Alle Daten werden mit der durch REDCap gesicherten Webanwendung gespeichert.