人獣共通感染症が疑われる発熱を先進の診断技術で調査

この研究は、迅速性と感度の点で検査室診断を改善し、さまざまな環境曝露を含むベドウィン集団における感染症の病態生理学についての理解を深めるために、ベドウィン集団における発熱性疾患の調査に先進技術を適用することを目的としています。動物、水、廃棄物、抗生物質への曝露、病原体の毒性に関連する宿主と病原体の相互作用、慢性化と再発に関連する要因、治療への反応などです。

研究プロトコル:

登録:

1. スクリーニング後、患者にはアプローチが行われ、研究に参加する機会が提供されます。
2. インフォームド・コンセントに署名した後、患者は面接を受け、登録アンケートに記入されます。
3. 患者が救急外来に登録されている場合、血液、唾液、便のサンプルが収集されます。 患者に発疹や皮膚病変が見られた場合は、開いた病変から綿棒を採取します。
4. 患者が抗生物質の投与後に登録された場合、抗生物質の投与前に救急外来で採取された残りの血液サンプルの特定も試みます。

ファローアップ：

• 入院中：

  • 入院後 7 日後、または退院日 (どちらか早い方) に 2 回目のサンプル セット (血液、唾液、便) の採取が試みられ、症状の解消に関する臨床データが医療記録から抽出されます。 、抗生物質治療、合併症など。 診断または治療目的で入院期間中に行われた外科的処置の場合（例： 皮膚生検、骨生検、関節穿刺、腰椎穿刺など）、臨床目的に不必要と思われる残存材料は分析に利用されます。
  • 入院中に患者は面接を受け、WASH（水、衛生、衛生）に関するアンケートに記入されます。

• 退院後の外来フォローアップ：

  • 感染症クリニックでの定期的なフォローアップ訪問（または SUMC の外来サービスでのその他の計画された訪問）の場合、採血が行われる場合、研究目的で全血および血清サンプルの採取が試みられます。 研究指定の採血が不可能な場合、残った材料は研究目的に利用されます。 臨床的に関連があるとみなされる場合は、追跡調査の質問票に記入されます。

• 研究期間内に再発した入院

  o 登録後 1 年以内に入院を繰り返した場合、その入院は研究チームによって元の診断と「関連」または「無関連」と評価されます。 研究対象の疾患またはその合併症に関連していると考えられる場合は、別の血液サンプリングの実施が試行され、体の他の部位の臨床サンプリング（生検、外科的介入、またはドレナージ）で得られた残りの物質が分析に利用されます。 臨床的に関連があるとみなされる場合は、追跡調査の質問票に記入されます。 再発入院は研究の一環として分析されるため、重篤な有害事象（SAE）とはみなされません。

• 登録から6か月後:

  o 臨床転帰を確立するための電話面接 (プロトコルは付録に添付)。

• 学習期間の終了:

  • 登録から 1 年後に、抗生物質の使用、再発する入院、長期合併症に関するデータが患者の医療ファイルから収集されます。

サンプルコレクション:

この研究に登録されたすべての患者は、次の精密検査を受けます。

採血:

全血および血清サンプルは、登録時、および可能であれば退院時、および予定されているすべての外来通院時または再発入院時に採取されます。 検査結果が陽性で入院中に患者が登録された場合、抗生物質治療前に採取された臨床非研究サンプルの残り物は、臨床使用に必要でない限り、研究目的で使用される可能性があります。 、および関連する病院の研究室での通常の保管期間内に。 各時点での分析のために得られる最大血液量は、成人の場合は 10 ml、小児の場合は 5 ml です。

その他の臨床サンプリング:

登録時に、マイクロバイオームプロファイリングを含む微生物学的分析のために唾液と便のサンプルが採取され、発疹や創傷のサンプリングも原因となる病原体を診断するために分子的およびメタゲノム的手法によって分析されます。

サンプルの処理と分析:

すべてのサンプルは、登録後 5 年間、ネゲブのベングリオン大学健康科学部のモラン・ギラッド研究室で保管されます。 サンプルの処理はリアルタイムではなくバッチで行われるため、臨床上の意思決定に影響を与える可能性のあるリアルタイム データは生成されません。 分析結果は、治療を担当する医師には提供されません。 細菌のゲノム/メタゲノム配列決定の目的では、全血サンプルから DNA が抽出され、抽出された物質から微生物の DNA のみが同定および分析されます。 この研究ではヒトの DNA に関する研究は行われません。 標準培養で増殖した細菌分離株は、さらなる特性評価のために分析されます（例: 毒性）。 標準培養を通じて同定されたブルセラ菌またはその他の細菌分離株は、宿主と病原体の相互作用の分析のための組織培養を含む in vitro モデルを使用してさらに分析されます。 臨床サンプル中の免疫応答は、宿主の炎症シグナル（例: 遺伝子発現、タンパク質の測定）。 診断能力を向上させる目的で、人獣共通感染症（ブルセラ、リケッチア、Q熱など、必要に応じてその他）に対する特定のPCR検査が全血サンプルに対して行われ、その有用性と他の診断手段との一致性を検討します。血清サンプルを使用して実施される血清学的精密検査と比較します。 すべてのサンプルは、適切な生物学的安全性レベルおよび適切な実験室慣行に従って分析されます。

メタデータ収集と患者情報 すべての患者は、現在の病気の詳細（ヘブライ語とアラビア語で添付）、生活状況、動物との接触に関するアンケートに記入するよう求められます。

人口統計データ、慢性疾患を含む健康状態、過去の入院、人獣共通感染症の過去病歴などのメタデータが医療記録から収集されます。 入院中に次のパラメータが収集されます: 解熱までの時間を含むバイタルサイン、臨床検査および画像結果、外科的処置または集中治療室での滞在。

また、臨床転帰に関連する要因に関するデータは、研究への登録後 1 年間、患者の医療記録から収集されます。これには、再発入院、抗生物質の摂取、炎症マーカー、血球数、肝酵素などの追跡血液検査の結果、および経過観察が含まれます。血清学的検査を強化します。

研究期間と規模 この研究は、2020年9月から3年間にわたり、合計500人の患者を対象とすることを目指しています。

倫理的配慮とデータセキュリティ 研究に登録されたすべての患者には、研究シリアル番号が割り当てられます。 この研究中に収集されたすべてのサンプルには研究番号が付けられ、収集されたサンプルにはその他の識別情報は存在しません。 メタデータとアンケートを含むファイルにも研究番号を使用してラベルが付けられます。 識別データを含むインフォームドコンセントフォームは、研究チームのみがアクセスできる施錠されたオフィスに保管され、識別材料と研究番号を照合するコーディングファイルは、病院のコンピューター上のパスワードで保護されたサーバーに保存されます。 識別データは、研究期間終了時のフォローアップ電話インタビューの目的で使用され、取得されたすべての情報は研究コードを使用して匿名化されて保存されます。 すべてのデータは、REDCap で保護された Web アプリケーションを使用して保存されます。