Epigeneettinen analyysi tulehdusta aktivoivan NLRP3-geenin säätelystä eteisvärinäpotilaiden ja kontrollien monosyyteissä
tiistai 23. huhtikuuta 2024 päivittänyt: Tulane University
Tutkimuksessa analysoidaan vapaaehtoisten verta sen selvittämiseksi, onko eteisvärinään (AF) liittyvälle sydäntulehdukselle taustalla oleva epigeneettinen syy ja sen eteneminen iän myötä.
Tulehduksellisten geenien lisääntymiseen liittyvien epigeneettisten elementtien alueiden vahvistaminen auttaa tutkijoita tunnistamaan kohdepaikkoja tulevien terapeuttisten interventioiden kehittämistä varten.
Tutkijat ehdottavat NOD-, LRR- ja pyriindomeenia sisältävän proteiinin 3:n (NLRP3) monosyyttisolutyyppispesifisen DNA-metylaatioprofiilin vahvistamista ja ikään ja AF:hen liittyvien muutosten määrittämistä DNA-metylaatiossa ja NLRP3:n ilmentymisessä monosyyteissä. .
Tämä tutkimus antaa oivalluksia NLRP3:n epigeneettiseen säätelyyn nuorilla ja iäkkäillä potilailla sekä AF-potilailla vs. kontrollit, mikä auttaa suunnittelemaan menetelmiä NLRP3:n ilmentymisen moduloimiseksi ja sydänfibroosin etenemisen vähentämiseksi.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Valmis
Ehdot
Yksityiskohtainen kuvaus
Verinäytteet otetaan 120 osallistujalta seuraavasti: 10 50-80-vuotiasta naista, joilla on diagnosoitu AF rytmiliuskojen tai kirjallisten asiakirjojen perusteella; 10 tervettä naista iältään 50-80 vuotta ja 10 tervettä naista iältään 20-30 vuotta.
Osallistujat rekrytoidaan Tulanen yliopiston kardiologian klinikoista sekä vapaaehtoisten tutkimusrekistereistä. Näiltä osallistujilta pyydetään suostumus toisen 8 ml:n (1,5 teelusikallisen) ottamiseen rutiininomaisten diagnostisten verenoton yhteydessä. PI poistaa näiden verinäytteiden tunnistamisen niiden vastaanottamisen yhteydessä, eikä tunnistettavia tietoja säilytetä. Leukosyyttien alatyypit, mukaan lukien monosyytit, neutrofiilit ja B-solut, eristetään verestä ja DNA-uutto suoritetaan leukosyyttien alatyypeistä. Nämä leukosyytti-DNA-näytteet lähetetään New England Biolabsiin, Ipswichiin, Massachusettsiin DNA-metylaatioanalyysiä varten, jotta voidaan tunnistaa NLRP3-geenin ilmentymisen voimistumiseen liittyvien epigeneettisten elementtien kohdealueet, jotka saattavat liittyä taudin etenemiseen iän myötä. Reaaliaikainen polymeraasiketjureaktio (PCR) suoritetaan Tulane Research and Innovation for Arrhythmia Discoveries (TRIAD) -keskuksessa, Tulane University School of Medicineissa RNA:sta, joka on uutettu leukosyyttien alatyypistä, jotta voidaan tarkistaa NLRP3:n ilmentymistaso, joka liittyy voimakkaasti tulehdukseen AF.
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Todellinen)
29
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskelupaikat
-
-
Louisiana
-
New Orleans, Louisiana, Yhdysvallat, 70112
- Tulane University Medical Center
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
20 vuotta - 80 vuotta (Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Joo
Näytteenottomenetelmä
Todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
Osallistujat rekrytoidaan Tulane University Cardiology Clinicsista. Kontrollinalaiset terveet naiset ovat ne, jotka on määrä tehdä rutiininomaiseen vuosittaiseen terveystarkastukseen, ja terveet verenluovuttajat, joilla ei ole todisteita sydän- ja verisuonitaudeista tai muista vakavista immuunisairauksista, kuten diabetes, verenpainetauti, autoimmuuniartriitti jne.
Potilaspopulaatioon kuuluvat 50–80-vuotiaat naiset, joilla on diagnosoitu AF rytmiliuskojen tai kirjallisten asiakirjojen perusteella.
Rekrytointi tapahtuu myös vapaaehtoisten tutkimusrekisterien avulla.
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- 18-vuotiaat tai sitä vanhemmat,
Kontrolliryhmä on suunniteltu rutiininomaiseen vuosittaiseen terveystarkastukseen ja terveille verenluovuttajille ilman mitään todisteita sydän- ja verisuonitaudeista tai muista vakavista immuunisairauksista, kuten diabetes, verenpainetauti, autoimmuuni niveltulehdus jne.
- terveet 50–80-vuotiaat naiset
- terveet 20–30-vuotiaat naiset.
Tutkimuspotilaat – 50–80-vuotiaat naiset, joilla on diagnosoitu AF rytmiliuskojen tai kirjallisten asiakirjojen perusteella.
Poissulkemiskriteerit:
- Aiempi vasemman eteisen ablaatio tai minkä tahansa tyyppinen läppäleikkaus
- Potilaat, jotka käyttävät lääkkeitä, kuten ibuprofeenia, toradolia, naprokseenia ja muita yleisiä tulehduskipulääkkeitä.
- Raskaana olevat naiset
- Terminaalisairaat potilaat
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
|---|
|
Potilasryhmä
10 50-80-vuotiasta naista, joilla on diagnosoitu AF rytmiliuskojen tai kirjallisten asiakirjojen perusteella.
|
|
Valvontaryhmä 1
10 tervettä naista, iältään 50-80 vuotta
|
|
Valvontaryhmä 2
10 tervettä naista, iältään 20-30 vuotta
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Selvitä, onko eteisvärinään liittyvällä sydäntulehduksella taustalla oleva epigeneettinen syy
Aikaikkuna: Päivä 1
|
Tämä määritetään vahvistamalla NLRP3:n monosyyttisolutyyppispesifinen DNA-metylaatioprofiili.
|
Päivä 1
|
|
Määritä, onko DNA-metylaatiolla merkittäviä assosiaatioita NLRP3-ilmentymiseen monosyyteissä iän myötä.
Aikaikkuna: Päivä 1
|
Ikäsuhdetta tutkitaan vertaamalla ryhmäkohtaisesti nuorten ja vanhojen yksilöiden monosyyttien DNA-metylaatiotasoja.
NLRP3:n ilmentymistasoa verrataan DNA:n metylaatiotasoihin.
|
Päivä 1
|
|
Määritä, onko DNA-metylaatiolla merkittäviä assosiaatioita NLRP3-ilmentymiseen monosyyteissä eteisvärinän tilan kanssa.
Aikaikkuna: Päivä 1
|
Sairauksien assosiaatiot testataan vertaamalla ryhmäkohtaisesti AF-potilaiden monosyyttien DNA-metylaatiotasoja verrokkeihin.
Tutkijat testaavat myös NLRP3:n ilmentymisen merkittävää yhteyttä vastaavaan DNA-metylaatiostatukseen AF-potilailla.
|
Päivä 1
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Sruti Chandra, PhD, Tulane University School of Medicine
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.
Yleiset julkaisut
- Miyasaka Y, Barnes ME, Gersh BJ, Cha SS, Bailey KR, Abhayaratna WP, Seward JB, Tsang TS. Secular trends in incidence of atrial fibrillation in Olmsted County, Minnesota, 1980 to 2000, and implications on the projections for future prevalence. Circulation. 2006 Jul 11;114(2):119-25. doi: 10.1161/CIRCULATIONAHA.105.595140. Epub 2006 Jul 3. Erratum In: Circulation. 2006 Sep 12;114(11):e498.
- Chugh SS, Havmoeller R, Narayanan K, Singh D, Rienstra M, Benjamin EJ, Gillum RF, Kim YH, McAnulty JH Jr, Zheng ZJ, Forouzanfar MH, Naghavi M, Mensah GA, Ezzati M, Murray CJ. Worldwide epidemiology of atrial fibrillation: a Global Burden of Disease 2010 Study. Circulation. 2014 Feb 25;129(8):837-47. doi: 10.1161/CIRCULATIONAHA.113.005119. Epub 2013 Dec 17.
- Akoum N, Mahnkopf C, Kholmovski EG, Brachmann J, Marrouche NF. Age and sex differences in atrial fibrosis among patients with atrial fibrillation. Europace. 2018 Jul 1;20(7):1086-1092. doi: 10.1093/europace/eux260.
- Wagstaff AJ, Overvad TF, Lip GY, Lane DA. Is female sex a risk factor for stroke and thromboembolism in patients with atrial fibrillation? A systematic review and meta-analysis. QJM. 2014 Dec;107(12):955-67. doi: 10.1093/qjmed/hcu054. Epub 2014 Mar 14.
- Emdin CA, Wong CX, Hsiao AJ, Altman DG, Peters SA, Woodward M, Odutayo AA. Atrial fibrillation as risk factor for cardiovascular disease and death in women compared with men: systematic review and meta-analysis of cohort studies. BMJ. 2016 Jan 19;532:h7013. doi: 10.1136/bmj.h7013.
- Engelmann MD, Svendsen JH. Inflammation in the genesis and perpetuation of atrial fibrillation. Eur Heart J. 2005 Oct;26(20):2083-92. doi: 10.1093/eurheartj/ehi350. Epub 2005 Jun 23.
- Hohmann C, Pfister R, Mollenhauer M, Adler C, Kozlowski J, Wodarz A, Drebber U, Wippermann J, Michels G. Inflammatory cell infiltration in left atrial appendageal tissues of patients with atrial fibrillation and sinus rhythm. Sci Rep. 2020 Feb 3;10(1):1685. doi: 10.1038/s41598-020-58797-8.
- Liu Y, Shi Q, Ma Y, Liu Q. The role of immune cells in atrial fibrillation. J Mol Cell Cardiol. 2018 Oct;123:198-208. doi: 10.1016/j.yjmcc.2018.09.007. Epub 2018 Sep 26.
- Le Jemtel TH, Samson R, Ayinapudi K, Singh T, Oparil S. Epicardial Adipose Tissue and Cardiovascular Disease. Curr Hypertens Rep. 2019 Apr 5;21(5):36. doi: 10.1007/s11906-019-0939-6.
- Yamashita T, Sekiguchi A, Iwasaki YK, Date T, Sagara K, Tanabe H, Suma H, Sawada H, Aizawa T. Recruitment of immune cells across atrial endocardium in human atrial fibrillation. Circ J. 2010 Feb;74(2):262-70. doi: 10.1253/circj.cj-09-0644. Epub 2009 Dec 15.
- Shantsila E, Tapp LD, Wrigley BJ, Pamukcu B, Apostolakis S, Montoro-Garcia S, Lip GY. Monocyte subsets in coronary artery disease and their associations with markers of inflammation and fibrinolysis. Atherosclerosis. 2014 May;234(1):4-10. doi: 10.1016/j.atherosclerosis.2014.02.009. Epub 2014 Feb 20.
- Budai MM, Varga A, Milesz S, Tozser J, Benko S. Aloe vera downregulates LPS-induced inflammatory cytokine production and expression of NLRP3 inflammasome in human macrophages. Mol Immunol. 2013 Dec;56(4):471-9. doi: 10.1016/j.molimm.2013.05.005. Epub 2013 Aug 1.
- He G, Tan W, Wang B, Chen J, Li G, Zhu S, Xie J, Xu B. Increased M1 Macrophages Infiltration Is Associated with Thrombogenesis in Rheumatic Mitral Stenosis Patients with Atrial Fibrillation. PLoS One. 2016 Mar 1;11(3):e0149910. doi: 10.1371/journal.pone.0149910. eCollection 2016.
- Mazurek T, Zhang L, Zalewski A, Mannion JD, Diehl JT, Arafat H, Sarov-Blat L, O'Brien S, Keiper EA, Johnson AG, Martin J, Goldstein BJ, Shi Y. Human epicardial adipose tissue is a source of inflammatory mediators. Circulation. 2003 Nov 18;108(20):2460-6. doi: 10.1161/01.CIR.0000099542.57313.C5. Epub 2003 Oct 27.
- Nattel S. Molecular and Cellular Mechanisms of Atrial Fibrosis in Atrial Fibrillation. JACC Clin Electrophysiol. 2017 May;3(5):425-435. doi: 10.1016/j.jacep.2017.03.002. Epub 2017 May 15.
- Misialek JR, Bekwelem W, Chen LY, Loehr LR, Agarwal SK, Soliman EZ, Norby FL, Alonso A. Association of White Blood Cell Count and Differential with the Incidence of Atrial Fibrillation: The Atherosclerosis Risk in Communities (ARIC) Study. PLoS One. 2015 Aug 27;10(8):e0136219. doi: 10.1371/journal.pone.0136219. eCollection 2015.
- Van Wagoner DR, Chung MK. Inflammation, Inflammasome Activation, and Atrial Fibrillation. Circulation. 2018 Nov 13;138(20):2243-2246. doi: 10.1161/CIRCULATIONAHA.118.036143. No abstract available.
- Yao C, Veleva T, Scott L Jr, Cao S, Li L, Chen G, Jeyabal P, Pan X, Alsina KM, Abu-Taha I Dr, Ghezelbash S, Reynolds CL, Shen YH, LeMaire SA, Schmitz W, Muller FU, El-Armouche A, Tony Eissa N, Beeton C, Nattel S, Wehrens XHT, Dobrev D, Li N. Enhanced Cardiomyocyte NLRP3 Inflammasome Signaling Promotes Atrial Fibrillation. Circulation. 2018 Nov 13;138(20):2227-2242. doi: 10.1161/CIRCULATIONAHA.118.035202. Erratum In: Circulation. 2019 Apr 23;139(17):e889.
- Chen H, Zhang X, Liao N, Mi L, Peng Y, Liu B, Zhang S, Wen F. Enhanced Expression of NLRP3 Inflammasome-Related Inflammation in Diabetic Retinopathy. Invest Ophthalmol Vis Sci. 2018 Feb 1;59(2):978-985. doi: 10.1167/iovs.17-22816.
- Zhu J, Wu S, Hu S, Li H, Li M, Geng X, Wang H. NLRP3 inflammasome expression in peripheral blood monocytes of coronary heart disease patients and its modulation by rosuvastatin. Mol Med Rep. 2019 Aug;20(2):1826-1836. doi: 10.3892/mmr.2019.10382. Epub 2019 Jun 13.
- Johansson A, Enroth S, Gyllensten U. Continuous Aging of the Human DNA Methylome Throughout the Human Lifespan. PLoS One. 2013 Jun 27;8(6):e67378. doi: 10.1371/journal.pone.0067378. Print 2013.
- Levine ME, Lu AT, Quach A, Chen BH, Assimes TL, Bandinelli S, Hou L, Baccarelli AA, Stewart JD, Li Y, Whitsel EA, Wilson JG, Reiner AP, Aviv A, Lohman K, Liu Y, Ferrucci L, Horvath S. An epigenetic biomarker of aging for lifespan and healthspan. Aging (Albany NY). 2018 Apr 18;10(4):573-591. doi: 10.18632/aging.101414.
- Lio CJ, Rao A. TET Enzymes and 5hmC in Adaptive and Innate Immune Systems. Front Immunol. 2019 Feb 12;10:210. doi: 10.3389/fimmu.2019.00210. eCollection 2019.
- Heinzmann D, Bangert A, Muller AM, von Ungern-Sternberg SN, Emschermann F, Schonberger T, Chatterjee M, Mack AF, Klingel K, Kandolf R, Malesevic M, Borst O, Gawaz M, Langer HF, Katus H, Fischer G, May AE, Kaya Z, Seizer P. The Novel Extracellular Cyclophilin A (CyPA) - Inhibitor MM284 Reduces Myocardial Inflammation and Remodeling in a Mouse Model of Troponin I -Induced Myocarditis. PLoS One. 2015 Apr 20;10(4):e0124606. doi: 10.1371/journal.pone.0124606. eCollection 2015.
- Sun Z, Vaisvila R, Hussong LM, Yan B, Baum C, Saleh L, Samaranayake M, Guan S, Dai N, Correa IR Jr, Pradhan S, Davis TB, Evans TC Jr, Ettwiller LM. Nondestructive enzymatic deamination enables single-molecule long-read amplicon sequencing for the determination of 5-methylcytosine and 5-hydroxymethylcytosine at single-base resolution. Genome Res. 2021 Feb;31(2):291-300. doi: 10.1101/gr.265306.120. Epub 2021 Jan 19.
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Perjantai 22. lokakuuta 2021
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Perjantai 16. helmikuuta 2024
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Perjantai 16. helmikuuta 2024
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Maanantai 8. helmikuuta 2021
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Perjantai 19. helmikuuta 2021
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tiistai 23. helmikuuta 2021
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Torstai 25. huhtikuuta 2024
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Tiistai 23. huhtikuuta 2024
Viimeksi vahvistettu
Maanantai 1. huhtikuuta 2024
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 2020-561
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .