Seuraavan sukupolven sekvensointi keuhkosiirtopotilaiden akuutin hylkimisen havaitsemiseksi. (NGS-ACRL)
lauantai 19. helmikuuta 2022 päivittänyt: Mario Nosotti, Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico
Seuraavan sukupolven sekvensointi akuutin hyljintäreaktion diagnosoimiseksi potilailla, joille tehdään keuhkosiirto. Pilottitutkimus vertailevaa pitkittäistä kuvaavaa tutkimusta varten.
Keuhkonsiirto on yhdistetty hoito valituille potilaille, joilla on loppuvaiheen hengityselinsairauksia; akuutti hyljintäreaktio on kuitenkin edelleen tärkeä syy keuhkojen allograftin menetykseen ja kroonisen allograftin toimintahäiriön riskitekijä.
Keuhkokudoksen histopatologinen tutkimus on kultainen standardi akuutin hyljintäreaktion diagnosoinnissa, joten vastaanottajille tehdään transbronkiaalinen biopsia ja bronkoalveolaarinen huuhtelu transplantaation jälkeen.
Saatu kudos on kuitenkin joskus riittämätön histopatologiaan, ja endoskooppinen toimenpide voi johtaa komplikaatioihin (verenvuoto, ilmarinta).
Luovuttajaperäisen soluvapaan DNA:n (ddcfDNA) kvantifiointi vastaanottajan plasmassa on osoitettu lisääntyneen akuutin hylkimisreaktion tapauksessa, ja se voisi edustaa varhaista ja ei-invasiivista diagnostista merkkiä akuutin hylkimisen havaitsemiseksi.
Suunnittelimme ottavamme kaikki 18–65-vuotiaat keuhkonsiirtoon hakeutuvat keskukseemme.
Potilaat, joille tehtiin uudelleensiirto, ja potilaat, joille oli aiemmin tehty kiinteä elinsiirto, jätettiin pois.
Luovuttajaperäisen soluvapaan DNA:n kvantifiointi suoritettiin 15 päivää ja 3, 6 ja 12 kuukautta transplantaation jälkeen, samanaikaisesti rutiinivalvonta bronkoskopioiden kanssa protokollamme mukaisesti; sama analyysi tehtiin myös kliinisen hylkimisreaktion epäilyn yhteydessä.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Aktiivinen, ei rekrytointi
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Tutkimuksen tarkoituksena on tunnistaa ei-invasiivinen transplantaation jälkeinen akuutin keuhkojen hylkimisen seurantamenetelmä tunnistamalla luovuttajaperäinen soluvapaa DNA (ddcf-DNA) vastaanottajan plasmasta. Siirron aikana luovuttajan ja vastaanottajan ääreisveressä olevista lymfosyyteistä peräisin oleva ddcf-DNA genotyypitetään analysoimalla noin 300 yhden nukleotidin polymorfismia (SNP) suurella todennäköisyydellä, että se on erilainen homotsygoottinen luovuttajan ja vastaanottajan välillä, genomitietokantoihin raportoitujen populaatioiden frekvenssien mukaan. Transplantation jälkeisen seurannan aikana ddcf-DNA:n läsnäoloa seurataan tunnistamalla luovuttajan SNP vastaanottajan plasmasta uutetusta vapaasta DNA:sta seuraavan sukupolven sekvensointimenetelmällä (NGS). Vastaanottajan ddcfDNA:n tasot korreloidaan kliinisten ja histologisten tietojen kanssa, jotka on saatu rutiininomaisista 3, 6 ja 12 kuukauden transplantaation jälkeisistä keuhkobiopsioista. Kaikki tutkimukseen osallistuvat potilaat allekirjoittavat tutkimuskohtaisen kirjallisen suostumuksen.
-Aikajana: T-1 (ennen keuhkosiirtoa): vastaanottajan DNA-genotyypitys; T0 (keuhkonsiirto): luovuttajan DNA:n genotyypitys; T1, T2, T3, T4 (15 päivää, 3, 6, 12 kuukautta keuhkonsiirron jälkeen): ddcfDNA-tutkimus vastaanottajan seerumilla; Tr: kaikissa tapauksissa, joissa kliinisesti epäillään akuuttia solujen hylkimistä. T2:n, T3:n, T4:n ja Tr:n kohdalla suoritetaan myös valvontakeuhkojen trans-bronkiaaliset biopsiat (TBB:t) keskuksemme standardin siirron jälkeisen keuhkojen seurantaprotokollan mukaisesti.
-Näytekoko ja tilastollinen analyysi: ddcfDNA:n/vastaanottaja-DNA:n osuus: vakaat potilaat (pA): 0,01, potilaat, joilla on siirteen vaurio (pB): 0,30, suhde nA/nB: 3, teho (1-beta): 0,80, alfa: 5 %, ei-alempi marginaali δ: 0,05. Väkiluku (A+B): 48; Mahdollista tutkimuksesta poistumista varten lisäämme 7 tapausta yhteensä 55 potilaalla.
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Odotettu)
55
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskelupaikat
-
-
-
Milan, Italia, 20122
- Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
18 vuotta - 65 vuotta (Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Ei
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Kaikki
Näytteenottomenetelmä
Todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
Potilaat, joille tehdään keuhkonsiirto Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinicossa, Milanossa, Italiassa
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Potilaat, joille tehdään keuhkonsiirto keskuksessamme
- 18–65-vuotiaat potilaat
- Kirjallinen tietoinen suostumus osallistua tutkimukseen
Poissulkemiskriteerit:
- Potilaat, joille tehdään uudelleensiirto
- Potilaat, joille on aiemmin tehty kiinteä elinsiirto
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Keuhkonsiirron saajat
18–65-vuotiaat vastaanottajat, joille tehdään keuhkonsiirto Fondazione IRCCS Ospedale Policlinico Milanossa ja joille suoritetaan luovuttajaperäisen soluttoman DNA:n kvantifiointi sarjaplasmanäytteistä
|
DdcfDNA:n kvantifiointi sarjaplasmanäytteissä keuhkonsiirron jälkeisen seurannan aikana
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Suhde ddcfDNA
Aikaikkuna: 1 vuosi
|
DdcfDNA:n osuus vastaanottajan plasmasoluvapaassa DNA:ssa
|
1 vuosi
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
ddcfDNA-kliinisen tiedon korrelaatio
Aikaikkuna: 1 vuosi
|
Kliiniset tiedot transbronkiaalisista keuhkobiopsioista, keuhkojen toimintakokeista, bronkoalveolaarisen huuhtelunesteen viljelystä, luovuttajaspesifisistä ihmisen leukosyyttiantigeenivasta-aineista.
|
1 vuosi
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Mario Nosotti, MD, Professor, Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.
Yleiset julkaisut
- De Vlaminck I, Martin L, Kertesz M, Patel K, Kowarsky M, Strehl C, Cohen G, Luikart H, Neff NF, Okamoto J, Nicolls MR, Cornfield D, Weill D, Valantine H, Khush KK, Quake SR. Noninvasive monitoring of infection and rejection after lung transplantation. Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 Oct 27;112(43):13336-41. doi: 10.1073/pnas.1517494112. Epub 2015 Oct 12.
- De Vlaminck I, Valantine HA, Snyder TM, Strehl C, Cohen G, Luikart H, Neff NF, Okamoto J, Bernstein D, Weisshaar D, Quake SR, Khush KK. Circulating cell-free DNA enables noninvasive diagnosis of heart transplant rejection. Sci Transl Med. 2014 Jun 18;6(241):241ra77. doi: 10.1126/scitranslmed.3007803.
- Chambers DC, Yusen RD, Cherikh WS, Goldfarb SB, Kucheryavaya AY, Khusch K, Levvey BJ, Lund LH, Meiser B, Rossano JW, Stehlik J; International Society for Heart and Lung Transplantation. The Registry of the International Society for Heart and Lung Transplantation: Thirty-fourth Adult Lung And Heart-Lung Transplantation Report-2017; Focus Theme: Allograft ischemic time. J Heart Lung Transplant. 2017 Oct;36(10):1047-1059. doi: 10.1016/j.healun.2017.07.016. Epub 2017 Jul 19. No abstract available.
- Report CRT, Italy, Rete nazionale trapianti, 2017
- Lande JD, Patil J, Li N, Berryman TR, King RA, Hertz MI. Novel insights into lung transplant rejection by microarray analysis. Proc Am Thorac Soc. 2007 Jan;4(1):44-51. doi: 10.1513/pats.200605-110JG.
- Tosi D, Carrinola R, Morlacchi LC, Tarsia P, Rossetti V, Mendogni P, Rosso L, Righi I, Damarco F, Nosotti M. Surveillance Transbronchial Biopsy Program to Evaluate Acute Rejection After Lung Transplantation: A Single Institution Experience. Transplant Proc. 2019 Jan-Feb;51(1):198-201. doi: 10.1016/j.transproceed.2018.04.073. Epub 2018 Jun 28.
- Rademacher J, Suhling H, Greer M, Haverich A, Welte T, Warnecke G, Gottlieb J. Safety and efficacy of outpatient bronchoscopy in lung transplant recipients - a single centre analysis of 3,197 procedures. Transplant Res. 2014 May 27;3:11. doi: 10.1186/2047-1440-3-11. eCollection 2014.
- Agbor-Enoh S, Jackson AM, Tunc I, Berry GJ, Cochrane A, Grimm D, Davis A, Shah P, Brown AW, Wang Y, Timofte I, Shah P, Gorham S, Wylie J, Goodwin N, Jang MK, Marishta A, Bhatti K, Fideli U, Yang Y, Luikart H, Cao Z, Pirooznia M, Zhu J, Marboe C, Iacono A, Nathan SD, Orens J, Valantine HA, Khush K. Late manifestation of alloantibody-associated injury and clinical pulmonary antibody-mediated rejection: Evidence from cell-free DNA analysis. J Heart Lung Transplant. 2018 Jul;37(7):925-932. doi: 10.1016/j.healun.2018.01.1305. Epub 2018 Jan 31.
- Rizopoulos, D. Joint Models for Longitudinal and Time-to-Event Data, with Applications in R. Boca Raton: Chapman & Hall/CRC. 2012.
- Wu, L. Mixed Effects Models for Complex Data. Boca Raton: Chapman & Hall/CRC, Chapter 8. 2009
- Rizopoulos, D. The R package JMbayes for fitting joint models for longitudinal and timeto-event data using MCMC. Journal of Statistical Software 72(7), 1-45. doi:10.18637/jss.v072.i07. 2016
- Rizopoulos D. Dynamic predictions and prospective accuracy in joint models for longitudinal and time-to-event data. Biometrics. 2011 Sep;67(3):819-29. doi: 10.1111/j.1541-0420.2010.01546.x. Epub 2011 Feb 9.
- R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria(2015)
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Torstai 4. lokakuuta 2018
Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)
Tiistai 1. marraskuuta 2022
Opintojen valmistuminen (Odotettu)
Torstai 1. joulukuuta 2022
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Lauantai 19. helmikuuta 2022
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Lauantai 19. helmikuuta 2022
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Keskiviikko 2. maaliskuuta 2022
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Keskiviikko 2. maaliskuuta 2022
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Lauantai 19. helmikuuta 2022
Viimeksi vahvistettu
Tiistai 1. helmikuuta 2022
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muut tutkimustunnusnumerot
- 1883/2018
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
PÄÄTTÄMÄTÖN
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .