Neste generasjons sekvensering for å oppdage akutt avstøtning hos lungetransplanterte pasienter. (NGS-ACRL)

Formålet med studien er identifisering av en ikke-invasiv post-transplantasjon akutt lungeavstøtingsovervåkingsmetode, ved identifisering av donoravledet cellefritt DNA (ddcf-DNA) i mottakerens plasma. På tidspunktet for transplantasjon vil ddcf-DNA avledet fra lymfocytter som er tilstede i det perifere blodet til giveren og mottakeren genotypes ved analyse av rundt 300 enkeltnukleotidpolymorfismer (SNP) med høy sannsynlighet for å være forskjellig homozygot mellom giver og mottaker, i henhold til frekvensene i befolkningen rapportert på genomiske databaser. Under oppfølgingen etter transplantasjon vil tilstedeværelsen av ddcf-DNA overvåkes ved identifikasjon av donorens SNP i det frie DNAet ekstrahert fra mottakerens plasma ved hjelp av neste generasjons sekvenseringsmetode (NGS). Nivåer av ddcfDNA i mottakeren vil være korrelert med kliniske og histologiske data innhentet fra rutinemessige 3, 6 og 12 måneder post-transplantasjon overvåking lungebiopsier. Alle pasienter som er registrert i studien vil signere et studiespesifikt skriftlig informert samtykke.

-Tidslinje: T-1 (før lungetransplantasjon): DNA-genotyping av mottakeren; T0 (lungetransplantasjon): genotyping av donor-DNA; T1, T2, T3, T4 (15 dager, 3, 6, 12 måneder etter lungetransplantasjon): ddcfDNA-forskning på mottakerserum; Tr: i alle tilfeller ved klinisk mistanke om akutt cellulær avvisning. Ved T2, T3, T4 og Tr utføres også transbronkiale lungebiopsier (TBB) overvåking, i henhold til vårt senters standard protokoll for lungeoppfølging etter transplantasjon.

-Prøvestørrelse og statistisk analyse: Andel ddcfDNA/mottaker-DNA: stabile pasienter (pA): 0,01, pasienter med graftskade (pB): 0,30, andel nA/nB: 3, Power (1-beta): 0,80, alfa: 5 %, margin av ikke-mindreverdighet δ: 0,05. Befolkning (A+B): 48; for mulig utgang fra studien legger vi til 7 tilfeller for totalt 55 pasienter.