Næste generations sekvensering til at detektere akut afstødning hos lungetransplantationspatienter. (NGS-ACRL)
19. februar 2022 opdateret af: Mario Nosotti, Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico
Næste generations sekvensering til diagnosticering af akut afstødning hos patienter, der gennemgår lungetransplantation. Pilotundersøgelse til sammenlignende longitudinelle beskrivende forsøg.
Lungetransplantation er en konsolideret behandling hos udvalgte patienter med luftvejssygdomme i slutstadiet; dog er akut afstødning fortsat en vigtig årsag til tab af lunge-allotransplantat og en risikofaktor for kronisk allograft-dysfunktion.
Histopatologisk undersøgelse af lungevæv er guldstandarden for diagnosticering af akut afstødning, derfor gennemgår modtagerne transbronchial biopsi og bronkoalveolær lavage efter transplantation.
Imidlertid er det opnåede væv undertiden utilstrækkeligt til histopatologi, og den endoskopiske procedure kan føre til komplikationer (blødning, pneumothorax).
Kvantificeringen af donorafledt cellefrit DNA (ddcfDNA) i modtagerplasmaet har vist sig at være øget i tilfælde af akut afstødning og kunne repræsentere en tidlig og ikke-invasiv diagnostisk markør til at påvise akut afstødning.
Vi planlagde at indskrive alle patienter i alderen 18 til 65 år, der var optaget til lungetransplantation på vores center.
Patienter, der gentransplanteredes, og patienter med tidligere solid organtransplantation i anamnesen blev udelukket.
Kvantificeringen af donorafledt cellefrit DNA blev udført 15 dage og 3, 6 og 12 måneder efter transplantation, samtidig med de rutinemæssige overvågningsbronkoskopier i henhold til vores protokol; samme analyse blev også udført i tilfælde af mistanke om klinisk afvisning.
Studieoversigt
Status
Aktiv, ikke rekrutterende
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Formålet med undersøgelsen er identifikation af en ikke-invasiv post-transplantations metode til overvågning af akut lungeafstødning ved identifikation af donorafledt cellefrit DNA (ddcf-DNA) i modtagerens plasma. På tidspunktet for transplantation vil ddcf-DNA'et afledt af lymfocytter til stede i donorens og modtagerens perifere blod blive genotypet ved analyse af omkring 300 enkeltnukleotidpolymorfier (SNP'er) med stor sandsynlighed for at være forskelligt homozygote mellem donor og modtager, i henhold til frekvenserne i populationen rapporteret på genomiske databaser. Under post-transplantationsopfølgningen vil tilstedeværelsen af ddcf-DNA blive overvåget ved identifikation af donorens SNP i det frie DNA ekstraheret fra modtagerens plasma ved hjælp af næste generations sekventeringsmetoden (NGS). Niveauer af ddcfDNA i recipienten vil være korreleret med kliniske og histologiske data opnået fra rutinemæssige 3, 6 og 12 måneder post-transplantation overvågning lungebiopsier. Alle patienter, der er tilmeldt undersøgelsen, vil underskrive et studiespecifikt skriftligt informeret samtykke.
-Tidslinje: T-1 (før lungetransplantation): DNA-genotypebestemmelse af modtageren; T0 (lungetransplantation): genotypebestemmelse af donor-DNA; T1, T2, T3, T4 (15 dage, 3, 6, 12 måneder efter lungetransplantation): ddcfDNA-forskning i recipientserum; Tr: i alle tilfælde af klinisk mistanke om akut cellulær afstødning. Ved T2, T3, T4 og Tr udføres der også overvågning af trans-bronchiale lungebiopsier (TBB'er) i henhold til vores centers standard lungeopfølgningsprotokol efter transplantation.
-Prøvestørrelse og statistisk analyse: Andel af ddcfDNA/recipient-DNA: stabile patienter (pA): 0,01, patienter med transplantatskade (pB): 0,30, andel nA/nB: 3, Power (1-beta): 0,80, Alpha: 5 %, margin for ikke-mindreværd δ: 0,05. Befolkning (A+B): 48; for eventuel udtræden af undersøgelsen tilføjer vi 7 tilfælde til i alt 55 patienter.
Undersøgelsestype
Observationel
Tilmelding (Forventet)
55
Kontakter og lokationer
Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.
Studiesteder
-
-
-
Milan, Italien, 20122
- Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico
-
-
Deltagelseskriterier
Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
18 år til 65 år (Voksen, Ældre voksen)
Tager imod sunde frivillige
Ingen
Køn, der er berettiget til at studere
Alle
Prøveudtagningsmetode
Sandsynlighedsprøve
Studiebefolkning
Patienter, der gennemgår lungetransplantation på Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico, Milano, Italien
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Patienter under lungetransplantation på vores center
- Patienter i alderen 18 til 65 år
- Skriftligt informeret samtykke til at deltage i undersøgelsen
Ekskluderingskriterier:
- Patienter under retransplantation
- Patienter med tidligere solid organtransplantation i anamnesen
Studieplan
Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Lungetransplantationsmodtagere
Recipienter i alderen 18 til 65 år, der gennemgår lungetransplantation på Fondazione IRCCS Ospedale Policlinico Milano, der gennemgår kvantificering af donorafledt cellefrit DNA på serielle plasmaprøver
|
Kvantificering af ddcfDNA på serielle plasmaprøver under opfølgning efter lungetransplantation
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Andel ddcfDNA
Tidsramme: 1 år
|
Andel af ddcfDNA'et på modtagerens plasmacellefrie DNA
|
1 år
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
ddcfDNA-klinisk datakorrelation
Tidsramme: 1 år
|
Kliniske data om trans-bronchiale lungebiopsier, lungefunktionstest, kultur af bronkoalveolær skyllevæske, donorspecifikke anti-humane leukocytantigenantistoffer.
|
1 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.
Samarbejdspartnere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Mario Nosotti, MD, Professor, Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico
Publikationer og nyttige links
Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.
Generelle publikationer
- De Vlaminck I, Martin L, Kertesz M, Patel K, Kowarsky M, Strehl C, Cohen G, Luikart H, Neff NF, Okamoto J, Nicolls MR, Cornfield D, Weill D, Valantine H, Khush KK, Quake SR. Noninvasive monitoring of infection and rejection after lung transplantation. Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 Oct 27;112(43):13336-41. doi: 10.1073/pnas.1517494112. Epub 2015 Oct 12.
- De Vlaminck I, Valantine HA, Snyder TM, Strehl C, Cohen G, Luikart H, Neff NF, Okamoto J, Bernstein D, Weisshaar D, Quake SR, Khush KK. Circulating cell-free DNA enables noninvasive diagnosis of heart transplant rejection. Sci Transl Med. 2014 Jun 18;6(241):241ra77. doi: 10.1126/scitranslmed.3007803.
- Chambers DC, Yusen RD, Cherikh WS, Goldfarb SB, Kucheryavaya AY, Khusch K, Levvey BJ, Lund LH, Meiser B, Rossano JW, Stehlik J; International Society for Heart and Lung Transplantation. The Registry of the International Society for Heart and Lung Transplantation: Thirty-fourth Adult Lung And Heart-Lung Transplantation Report-2017; Focus Theme: Allograft ischemic time. J Heart Lung Transplant. 2017 Oct;36(10):1047-1059. doi: 10.1016/j.healun.2017.07.016. Epub 2017 Jul 19. No abstract available.
- Report CRT, Italy, Rete nazionale trapianti, 2017
- Lande JD, Patil J, Li N, Berryman TR, King RA, Hertz MI. Novel insights into lung transplant rejection by microarray analysis. Proc Am Thorac Soc. 2007 Jan;4(1):44-51. doi: 10.1513/pats.200605-110JG.
- Tosi D, Carrinola R, Morlacchi LC, Tarsia P, Rossetti V, Mendogni P, Rosso L, Righi I, Damarco F, Nosotti M. Surveillance Transbronchial Biopsy Program to Evaluate Acute Rejection After Lung Transplantation: A Single Institution Experience. Transplant Proc. 2019 Jan-Feb;51(1):198-201. doi: 10.1016/j.transproceed.2018.04.073. Epub 2018 Jun 28.
- Rademacher J, Suhling H, Greer M, Haverich A, Welte T, Warnecke G, Gottlieb J. Safety and efficacy of outpatient bronchoscopy in lung transplant recipients - a single centre analysis of 3,197 procedures. Transplant Res. 2014 May 27;3:11. doi: 10.1186/2047-1440-3-11. eCollection 2014.
- Agbor-Enoh S, Jackson AM, Tunc I, Berry GJ, Cochrane A, Grimm D, Davis A, Shah P, Brown AW, Wang Y, Timofte I, Shah P, Gorham S, Wylie J, Goodwin N, Jang MK, Marishta A, Bhatti K, Fideli U, Yang Y, Luikart H, Cao Z, Pirooznia M, Zhu J, Marboe C, Iacono A, Nathan SD, Orens J, Valantine HA, Khush K. Late manifestation of alloantibody-associated injury and clinical pulmonary antibody-mediated rejection: Evidence from cell-free DNA analysis. J Heart Lung Transplant. 2018 Jul;37(7):925-932. doi: 10.1016/j.healun.2018.01.1305. Epub 2018 Jan 31.
- Rizopoulos, D. Joint Models for Longitudinal and Time-to-Event Data, with Applications in R. Boca Raton: Chapman & Hall/CRC. 2012.
- Wu, L. Mixed Effects Models for Complex Data. Boca Raton: Chapman & Hall/CRC, Chapter 8. 2009
- Rizopoulos, D. The R package JMbayes for fitting joint models for longitudinal and timeto-event data using MCMC. Journal of Statistical Software 72(7), 1-45. doi:10.18637/jss.v072.i07. 2016
- Rizopoulos D. Dynamic predictions and prospective accuracy in joint models for longitudinal and time-to-event data. Biometrics. 2011 Sep;67(3):819-29. doi: 10.1111/j.1541-0420.2010.01546.x. Epub 2011 Feb 9.
- R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria(2015)
Datoer for undersøgelser
Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
4. oktober 2018
Primær færdiggørelse (Forventet)
1. november 2022
Studieafslutning (Forventet)
1. december 2022
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
19. februar 2022
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
19. februar 2022
Først opslået (Faktiske)
2. marts 2022
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
2. marts 2022
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
19. februar 2022
Sidst verificeret
1. februar 2022
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Andre undersøgelses-id-numre
- 1883/2018
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
UBESLUTET
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Ingen
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Ingen
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Afvisning af lungetransplantation
-
University of California, Los AngelesNIH T32 Human and Molecular Development Training GrantAfsluttetTarmtransplantation | Cellular RejectionForenede Stater
-
University of OxfordUkendtPancreas Transplant AfvisningDet Forenede Kongerige
-
Abramson Cancer Center of the University of PennsylvaniaTrukket tilbageKræftpatienter, der gennemgår stamcelletransplantation (RCT of ACP for Transplant)
-
Rush University Medical CenterCareDxAfsluttetAfvisning af nyretransplantation | Pancreas Transplant AfvisningForenede Stater
-
Seoul National University HospitalAfsluttet
-
Seoul National University HospitalAfsluttet
-
Yonsei UniversityAfsluttetOne Lung VentilationKorea, Republikken
-
Sichuan UniversityWest China HospitalMidlertidigt ikke tilgængeligOne Lung Ventilation
-
Chinese Chronic Respiratory Disease Research NetworkRekruttering
-
Mansoura UniversityAfsluttetOne Lung VentilationEgypten