Nästa generations sekvensering för att upptäcka akut avstötning hos lungtransplantationspatienter. (NGS-ACRL)

Syftet med studien är identifiering av en icke-invasiv posttransplantationsmetod för akut lungavstötning, genom identifiering av donatorhärlett cellfritt DNA (ddcf-DNA) i mottagarens plasma. Vid tidpunkten för transplantation kommer ddcf-DNA härrörande från lymfocyter som finns i det perifera blodet hos givaren och mottagaren att genotypas genom analys av cirka 300 singelnukleotidpolymorfier (SNP) med en hög sannolikhet att vara olika homozygot mellan givare och mottagare, enligt de frekvenser i populationen som rapporterats på genomiska databaser. Under uppföljningen efter transplantationen kommer närvaron av ddcf-DNA att övervakas genom identifiering av donatorns SNP i det fria DNA som extraherats från mottagarens plasma med hjälp av nästa generations sekvenseringsmetod (NGS). Nivåer av ddcfDNA hos mottagaren kommer att korreleras med kliniska och histologiska data erhållna från rutinmässiga 3, 6 och 12 månader efter transplantation av lungbiopsier. Alla patienter som ingår i studien kommer att underteckna ett studiespecifikt skriftligt informerat samtycke.

-Tidslinje: T-1 (före lungtransplantation): DNA-genotypning av mottagaren; T0 (lungtransplantation): genotypning av donator-DNA; T1, T2, T3, T4 (15 dagar, 3, 6, 12 månader efter lungtransplantation): ddcfDNA-forskning på recipientserum; Tr: i alla fall av klinisk misstanke om akut cellulär avstötning. Vid T2, T3, T4 och Tr utförs också övervakningstransbronkiala lungbiopsier (TBB), enligt vårt centers standardprotokoll för lunguppföljning efter transplantation.

-Provstorlek och statistisk analys: Andel ddcfDNA/recipient-DNA: stabila patienter (pA): 0,01, patienter med transplantatskada (pB): 0,30, proportion nA/nB: 3, Power (1-beta): 0,80, alfa: 5 %, icke underlägsenhetsmarginal δ: 0,05. Population (A+B): 48; för eventuellt utträde ur studien lägger vi till 7 fall för totalt 55 patienter.