Sekwencjonowanie nowej generacji w celu wykrycia ostrego odrzucenia u pacjentów po przeszczepie płuc. (NGS-ACRL)
19 lutego 2022 zaktualizowane przez: Mario Nosotti, Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico
Sekwencjonowanie nowej generacji w diagnostyce ostrego odrzucenia przeszczepu u pacjentów poddawanych przeszczepowi płuc. Badanie pilotażowe dla porównawczej podłużnej próby opisowej.
Przeszczep płuc jest leczeniem skonsolidowanym u wybranych pacjentów ze schyłkową niewydolnością układu oddechowego; jednak ostre odrzucenie pozostaje ważną przyczyną utraty alloprzeszczepu płuc i czynnikiem ryzyka przewlekłej dysfunkcji alloprzeszczepu.
Badanie histopatologiczne tkanki płucnej jest złotym standardem w diagnostyce ostrego odrzucania, dlatego biorcy poddawani są kontrolnej biopsji przezoskrzelowej i płukaniu oskrzelowo-pęcherzykowemu po przeszczepie.
Czasami jednak uzyskana tkanka jest niewystarczająca do histopatologii, a zabieg endoskopowy może prowadzić do powikłań (krwawienia, odmy opłucnowej).
Wykazano, że oznaczanie ilościowe wolnego DNA pochodzącego od dawcy (ddcfDNA) w osoczu biorcy jest zwiększone w przypadku ostrego odrzucenia i może stanowić wczesny i nieinwazyjny marker diagnostyczny do wykrywania ostrego odrzucenia.
Zaplanowaliśmy objęcie programem wszystkich pacjentów w wieku od 18 do 65 lat, zgłoszonych do przeszczepu płuc w naszym ośrodku.
Z badania wykluczono pacjentów poddawanych retransplantacji oraz pacjentów po wcześniejszym przeszczepieniu narządu miąższowego.
Ocenę ilościową wolnego od komórek DNA pochodzącego od dawcy przeprowadzono 15 dni oraz 3, 6 i 12 miesięcy po przeszczepie, równolegle z rutynowymi bronchoskopiami kontrolnymi zgodnie z naszym protokołem; taką samą analizę przeprowadzono również w przypadku podejrzenia odrzucenia klinicznego.
Przegląd badań
Status
Aktywny, nie rekrutujący
Warunki
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Celem pracy jest identyfikacja nieinwazyjnej metody monitorowania ostrego odrzucenia płuca po przeszczepie, poprzez identyfikację wolnego DNA pochodzącego od dawcy (ddcf-DNA) w osoczu biorcy. W czasie przeszczepu DNA ddcf pochodzące z limfocytów obecnych we krwi obwodowej dawcy i biorcy zostanie poddane genotypowaniu poprzez analizę około 300 polimorfizmów pojedynczych nukleotydów (SNP) z dużym prawdopodobieństwem bycia różną homozygotą między dawcą a biorcą, zgodnie z częstotliwościami w populacji zgłoszonymi w genomowych bazach danych. Podczas obserwacji po przeszczepie obecność ddcf-DNA będzie monitorowana poprzez identyfikację SNP dawcy w wolnym DNA wyekstrahowanym z osocza biorcy metodą sekwencjonowania nowej generacji (NGS). Poziomy ddcfDNA u biorcy będą skorelowane z danymi klinicznymi i histologicznymi uzyskanymi z rutynowych biopsji płuc po 3, 6 i 12 miesiącach po przeszczepie. Wszyscy pacjenci włączeni do badania podpiszą pisemną świadomą zgodę dotyczącą danego badania.
-Oś czasu: T-1 (przed przeszczepem płuc): genotypowanie DNA biorcy; T0 (przeszczep płuc): genotypowanie DNA dawcy; T1, T2, T3, T4 (15 dni, 3, 6, 12 miesięcy po przeszczepie płuc): badanie ddcfDNA na surowicy biorcy; Tr: w każdym przypadku klinicznego podejrzenia ostrego odrzucenia komórkowego. W T2, T3, T4 i Tr wykonywane są również kontrolne biopsje przezoskrzelowe płuc (TBB), zgodnie ze standardowym protokołem obserwacji płuc po przeszczepie w naszym ośrodku.
-Wielkość próbki i analiza statystyczna: Proporcja ddcfDNA/DNA biorcy: stabilni pacjenci (pA): 0,01, pacjenci z uszkodzeniem przeszczepu (pB): 0,30, proporcja nA/nB: 3, Moc (1-beta): 0,80, Alfa: 5%, Margines braku niższości δ: 0,05. Populacja (A+B): 48; dla ewentualnego wyjścia z badania dodajemy 7 przypadków dla łącznie 55 pacjentów.
Typ studiów
Obserwacyjny
Zapisy (Oczekiwany)
55
Kontakty i lokalizacje
Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.
Lokalizacje studiów
-
-
-
Milan, Włochy, 20122
- Fondazione IRCCS CA' Granda Ospedale Maggiore Policlinico
-
-
Kryteria uczestnictwa
Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
18 lat do 65 lat (Dorosły, Starszy dorosły)
Akceptuje zdrowych ochotników
Nie
Płeć kwalifikująca się do nauki
Wszystko
Metoda próbkowania
Próbka prawdopodobieństwa
Badana populacja
Pacjenci poddawani przeszczepowi płuc w Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico, Mediolan, Włochy
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Pacjenci poddawani transplantacji płuc w naszym ośrodku
- Pacjenci w wieku od 18 do 65 lat
- Pisemna świadoma zgoda na udział w badaniu
Kryteria wyłączenia:
- Pacjenci poddawani retransplantacji
- Pacjenci z historią wcześniejszego przeszczepu narządu miąższowego
Plan studiów
Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Biorcy przeszczepów płuc
Biorcy w wieku od 18 do 65 lat poddawani przeszczepowi płuc w Fondazione IRCCS Ospedale Policlinico Milano poddawani oznaczaniu ilościowemu wolnego od komórek DNA pochodzącego od dawcy w seryjnych próbkach osocza
|
Kwantyfikacja ddcfDNA na seryjnych próbkach osocza podczas obserwacji po przeszczepie płuc
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Proporcja ddcfDNA
Ramy czasowe: 1 rok
|
Proporcja ddcfDNA w wolnym DNA komórek plazmatycznych biorcy
|
1 rok
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Korelacja danych klinicznych z ddcfDNA
Ramy czasowe: 1 rok
|
Dane kliniczne dotyczące przezoskrzelowych biopsji płuc, testów czynnościowych płuc, posiewu płynu z popłuczyn oskrzelowo-pęcherzykowych, swoistych dla dawcy przeciwciał przeciwko antygenowi ludzkich leukocytów.
|
1 rok
|
Współpracownicy i badacze
Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.
Współpracownicy
Śledczy
- Główny śledczy: Mario Nosotti, MD, Professor, Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico
Publikacje i pomocne linki
Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.
Publikacje ogólne
- De Vlaminck I, Martin L, Kertesz M, Patel K, Kowarsky M, Strehl C, Cohen G, Luikart H, Neff NF, Okamoto J, Nicolls MR, Cornfield D, Weill D, Valantine H, Khush KK, Quake SR. Noninvasive monitoring of infection and rejection after lung transplantation. Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 Oct 27;112(43):13336-41. doi: 10.1073/pnas.1517494112. Epub 2015 Oct 12.
- De Vlaminck I, Valantine HA, Snyder TM, Strehl C, Cohen G, Luikart H, Neff NF, Okamoto J, Bernstein D, Weisshaar D, Quake SR, Khush KK. Circulating cell-free DNA enables noninvasive diagnosis of heart transplant rejection. Sci Transl Med. 2014 Jun 18;6(241):241ra77. doi: 10.1126/scitranslmed.3007803.
- Chambers DC, Yusen RD, Cherikh WS, Goldfarb SB, Kucheryavaya AY, Khusch K, Levvey BJ, Lund LH, Meiser B, Rossano JW, Stehlik J; International Society for Heart and Lung Transplantation. The Registry of the International Society for Heart and Lung Transplantation: Thirty-fourth Adult Lung And Heart-Lung Transplantation Report-2017; Focus Theme: Allograft ischemic time. J Heart Lung Transplant. 2017 Oct;36(10):1047-1059. doi: 10.1016/j.healun.2017.07.016. Epub 2017 Jul 19. No abstract available.
- Report CRT, Italy, Rete nazionale trapianti, 2017
- Lande JD, Patil J, Li N, Berryman TR, King RA, Hertz MI. Novel insights into lung transplant rejection by microarray analysis. Proc Am Thorac Soc. 2007 Jan;4(1):44-51. doi: 10.1513/pats.200605-110JG.
- Tosi D, Carrinola R, Morlacchi LC, Tarsia P, Rossetti V, Mendogni P, Rosso L, Righi I, Damarco F, Nosotti M. Surveillance Transbronchial Biopsy Program to Evaluate Acute Rejection After Lung Transplantation: A Single Institution Experience. Transplant Proc. 2019 Jan-Feb;51(1):198-201. doi: 10.1016/j.transproceed.2018.04.073. Epub 2018 Jun 28.
- Rademacher J, Suhling H, Greer M, Haverich A, Welte T, Warnecke G, Gottlieb J. Safety and efficacy of outpatient bronchoscopy in lung transplant recipients - a single centre analysis of 3,197 procedures. Transplant Res. 2014 May 27;3:11. doi: 10.1186/2047-1440-3-11. eCollection 2014.
- Agbor-Enoh S, Jackson AM, Tunc I, Berry GJ, Cochrane A, Grimm D, Davis A, Shah P, Brown AW, Wang Y, Timofte I, Shah P, Gorham S, Wylie J, Goodwin N, Jang MK, Marishta A, Bhatti K, Fideli U, Yang Y, Luikart H, Cao Z, Pirooznia M, Zhu J, Marboe C, Iacono A, Nathan SD, Orens J, Valantine HA, Khush K. Late manifestation of alloantibody-associated injury and clinical pulmonary antibody-mediated rejection: Evidence from cell-free DNA analysis. J Heart Lung Transplant. 2018 Jul;37(7):925-932. doi: 10.1016/j.healun.2018.01.1305. Epub 2018 Jan 31.
- Rizopoulos, D. Joint Models for Longitudinal and Time-to-Event Data, with Applications in R. Boca Raton: Chapman & Hall/CRC. 2012.
- Wu, L. Mixed Effects Models for Complex Data. Boca Raton: Chapman & Hall/CRC, Chapter 8. 2009
- Rizopoulos, D. The R package JMbayes for fitting joint models for longitudinal and timeto-event data using MCMC. Journal of Statistical Software 72(7), 1-45. doi:10.18637/jss.v072.i07. 2016
- Rizopoulos D. Dynamic predictions and prospective accuracy in joint models for longitudinal and time-to-event data. Biometrics. 2011 Sep;67(3):819-29. doi: 10.1111/j.1541-0420.2010.01546.x. Epub 2011 Feb 9.
- R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria(2015)
Daty zapisu na studia
Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
4 października 2018
Zakończenie podstawowe (Oczekiwany)
1 listopada 2022
Ukończenie studiów (Oczekiwany)
1 grudnia 2022
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
19 lutego 2022
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
19 lutego 2022
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
2 marca 2022
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
2 marca 2022
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
19 lutego 2022
Ostatnia weryfikacja
1 lutego 2022
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Inne numery identyfikacyjne badania
- 1883/2018
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
NIEZDECYDOWANY
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Nie
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Nie
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .