Секвенирование нового поколения для выявления острого отторжения у пациентов с трансплантацией легкого. (NGS-ACRL)
19 февраля 2022 г. обновлено: Mario Nosotti, Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico
Секвенирование следующего поколения для диагностики острого отторжения у пациентов, перенесших трансплантацию легких. Пилотное исследование для сравнительного продольного описательного испытания.
Трансплантация легких является консолидированным лечением у отдельных пациентов с терминальной стадией респираторных заболеваний; однако острое отторжение остается важной причиной потери легочного аллотрансплантата и фактором риска хронической дисфункции аллотрансплантата.
Гистопатологическое исследование легочной ткани является золотым стандартом диагностики острого отторжения, поэтому реципиентам после трансплантации проводят контрольную трансбронхиальную биопсию и бронхоальвеолярный лаваж.
Однако полученная ткань иногда неадекватна для гистопатологии, а эндоскопическая процедура может привести к осложнениям (кровотечение, пневмоторакс).
Было показано, что количественное определение донорской бесклеточной ДНК (ddcfDNA) в плазме реципиента увеличивается в случае острого отторжения и может представлять собой ранний и неинвазивный диагностический маркер для выявления острого отторжения.
Мы планировали включить в наш центр всех пациентов в возрасте от 18 до 65 лет, поступающих на трансплантацию легких.
Пациенты, перенесшие ретрансплантацию, и пациенты с предшествующей трансплантацией паренхиматозных органов были исключены.
Количественное определение донорской бесклеточной ДНК проводили через 15 дней и через 3, 6 и 12 месяцев после трансплантации одновременно с рутинной контрольной бронхоскопией в соответствии с нашим протоколом; такой же анализ проводился и при подозрении на клиническое отторжение.
Обзор исследования
Статус
Активный, не рекрутирующий
Условия
Вмешательство/лечение
Подробное описание
Целью исследования является определение неинвазивного метода мониторинга острого отторжения легкого после трансплантации путем идентификации донорской бесклеточной ДНК (ddcf-ДНК) в плазме реципиента. Во время трансплантации ddcf-ДНК, полученная из лимфоцитов, присутствующих в периферической крови донора и реципиента, будет генотипирована путем анализа около 300 однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) с высокой вероятностью гомозиготности по-разному между донором и реципиентом. в соответствии с частотами в популяции, зарегистрированными в геномных базах данных. Во время наблюдения после трансплантации присутствие ddcf-ДНК будет контролироваться путем идентификации SNP донора в свободной ДНК, извлеченной из плазмы реципиента, с использованием метода секвенирования следующего поколения (NGS). Уровни ddcfDNA у реципиента будут коррелировать с клиническими и гистологическими данными, полученными при рутинных биопсиях легких через 3, 6 и 12 месяцев после трансплантации. Все пациенты, включенные в исследование, должны подписать письменное информированное согласие для конкретного исследования.
-Временная шкала: Т-1 (до трансплантации легких): ДНК-генотипирование реципиента; T0 (трансплантация легких): генотипирование донорской ДНК; Т1, Т2, Т3, Т4 (15 сут, 3, 6, 12 мес после трансплантации легких): исследование ddcfДНК в сыворотке крови реципиента; Tr: при любом клиническом подозрении на острое клеточное отторжение. На T2, T3, T4 и Tr также выполняется контрольная трансбронхиальная биопсия легкого (TBB) в соответствии со стандартным протоколом наблюдения за легкими после трансплантации нашего центра.
- Размер выборки и статистический анализ: доля ddcfDNA/ДНК реципиента: стабильные пациенты (pA): 0,01, пациенты с повреждением трансплантата (pB): 0,30, пропорция nA/nB: 3, мощность (1-бета): 0,80, альфа: 5%, Маржа неполноценности δ: 0,05. Население (А+В): 48; для возможного выхода из исследования мы добавляем 7 случаев для всего 55 пациентов.
Тип исследования
Наблюдательный
Регистрация (Ожидаемый)
55
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Места учебы
-
-
-
Milan, Италия, 20122
- Fondazione IRCCS CA' Granda Ospedale Maggiore Policlinico
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
От 18 лет до 65 лет (Взрослый, Пожилой взрослый)
Принимает здоровых добровольцев
Нет
Полы, имеющие право на обучение
Все
Метод выборки
Вероятностная выборка
Исследуемая популяция
Пациенты, перенесшие трансплантацию легких в Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico, Милан, Италия
Описание
Критерии включения:
- Пациенты, перенесшие трансплантацию легких в нашем центре
- Пациенты в возрасте от 18 до 65 лет
- Письменное информированное согласие на участие в исследовании
Критерий исключения:
- Пациенты, перенесшие ретрансплантацию
- Пациенты с предшествующей трансплантацией паренхиматозных органов
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Реципиенты трансплантации легких
Реципиенты в возрасте от 18 до 65 лет, перенесшие трансплантацию легких в Fondazione IRCCS Ospedale Policlinico Milano, проходят количественный анализ донорской бесклеточной ДНК в серийных образцах плазмы
|
Количественное определение ddcfDNA в серийных образцах плазмы во время наблюдения после трансплантации легких
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Доля ddcfДНК
Временное ограничение: 1 год
|
Доля ddcfDNA на свободной ДНК плазматических клеток реципиента
|
1 год
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
ddcfДНК-корреляция клинических данных
Временное ограничение: 1 год
|
Клинические данные трансбронхиальной биопсии легкого, функциональные пробы легких, посев жидкости бронхоальвеолярного лаважа, донор-специфические антитела к человеческому лейкоцитарному антигену.
|
1 год
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Соавторы
Следователи
- Главный следователь: Mario Nosotti, MD, Professor, Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico
Публикации и полезные ссылки
Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.
Общие публикации
- De Vlaminck I, Martin L, Kertesz M, Patel K, Kowarsky M, Strehl C, Cohen G, Luikart H, Neff NF, Okamoto J, Nicolls MR, Cornfield D, Weill D, Valantine H, Khush KK, Quake SR. Noninvasive monitoring of infection and rejection after lung transplantation. Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 Oct 27;112(43):13336-41. doi: 10.1073/pnas.1517494112. Epub 2015 Oct 12.
- De Vlaminck I, Valantine HA, Snyder TM, Strehl C, Cohen G, Luikart H, Neff NF, Okamoto J, Bernstein D, Weisshaar D, Quake SR, Khush KK. Circulating cell-free DNA enables noninvasive diagnosis of heart transplant rejection. Sci Transl Med. 2014 Jun 18;6(241):241ra77. doi: 10.1126/scitranslmed.3007803.
- Chambers DC, Yusen RD, Cherikh WS, Goldfarb SB, Kucheryavaya AY, Khusch K, Levvey BJ, Lund LH, Meiser B, Rossano JW, Stehlik J; International Society for Heart and Lung Transplantation. The Registry of the International Society for Heart and Lung Transplantation: Thirty-fourth Adult Lung And Heart-Lung Transplantation Report-2017; Focus Theme: Allograft ischemic time. J Heart Lung Transplant. 2017 Oct;36(10):1047-1059. doi: 10.1016/j.healun.2017.07.016. Epub 2017 Jul 19. No abstract available.
- Report CRT, Italy, Rete nazionale trapianti, 2017
- Lande JD, Patil J, Li N, Berryman TR, King RA, Hertz MI. Novel insights into lung transplant rejection by microarray analysis. Proc Am Thorac Soc. 2007 Jan;4(1):44-51. doi: 10.1513/pats.200605-110JG.
- Tosi D, Carrinola R, Morlacchi LC, Tarsia P, Rossetti V, Mendogni P, Rosso L, Righi I, Damarco F, Nosotti M. Surveillance Transbronchial Biopsy Program to Evaluate Acute Rejection After Lung Transplantation: A Single Institution Experience. Transplant Proc. 2019 Jan-Feb;51(1):198-201. doi: 10.1016/j.transproceed.2018.04.073. Epub 2018 Jun 28.
- Rademacher J, Suhling H, Greer M, Haverich A, Welte T, Warnecke G, Gottlieb J. Safety and efficacy of outpatient bronchoscopy in lung transplant recipients - a single centre analysis of 3,197 procedures. Transplant Res. 2014 May 27;3:11. doi: 10.1186/2047-1440-3-11. eCollection 2014.
- Agbor-Enoh S, Jackson AM, Tunc I, Berry GJ, Cochrane A, Grimm D, Davis A, Shah P, Brown AW, Wang Y, Timofte I, Shah P, Gorham S, Wylie J, Goodwin N, Jang MK, Marishta A, Bhatti K, Fideli U, Yang Y, Luikart H, Cao Z, Pirooznia M, Zhu J, Marboe C, Iacono A, Nathan SD, Orens J, Valantine HA, Khush K. Late manifestation of alloantibody-associated injury and clinical pulmonary antibody-mediated rejection: Evidence from cell-free DNA analysis. J Heart Lung Transplant. 2018 Jul;37(7):925-932. doi: 10.1016/j.healun.2018.01.1305. Epub 2018 Jan 31.
- Rizopoulos, D. Joint Models for Longitudinal and Time-to-Event Data, with Applications in R. Boca Raton: Chapman & Hall/CRC. 2012.
- Wu, L. Mixed Effects Models for Complex Data. Boca Raton: Chapman & Hall/CRC, Chapter 8. 2009
- Rizopoulos, D. The R package JMbayes for fitting joint models for longitudinal and timeto-event data using MCMC. Journal of Statistical Software 72(7), 1-45. doi:10.18637/jss.v072.i07. 2016
- Rizopoulos D. Dynamic predictions and prospective accuracy in joint models for longitudinal and time-to-event data. Biometrics. 2011 Sep;67(3):819-29. doi: 10.1111/j.1541-0420.2010.01546.x. Epub 2011 Feb 9.
- R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria(2015)
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
4 октября 2018 г.
Первичное завершение (Ожидаемый)
1 ноября 2022 г.
Завершение исследования (Ожидаемый)
1 декабря 2022 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
19 февраля 2022 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
19 февраля 2022 г.
Первый опубликованный (Действительный)
2 марта 2022 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
2 марта 2022 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
19 февраля 2022 г.
Последняя проверка
1 февраля 2022 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Другие идентификационные номера исследования
- 1883/2018
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
НЕ РЕШЕНО
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Нет
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Нет
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .