Séquençage de nouvelle génération pour détecter le rejet aigu chez les patients transplantés pulmonaires. (NGS-ACRL)
Séquençage de nouvelle génération pour le diagnostic du rejet aigu chez les patients subissant une transplantation pulmonaire. Étude pilote pour un essai descriptif longitudinal comparatif.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
Le but de l'étude est l'identification d'une méthode non invasive de surveillance du rejet pulmonaire aigu post-transplantation, par identification de l'ADN sans cellule dérivé du donneur (ddcf-ADN) dans le plasma du receveur. Au moment de la transplantation, le ddcf-ADN issu des lymphocytes présents dans le sang périphérique du donneur et du receveur sera génotypé par analyse d'environ 300 polymorphismes mononucléotidiques (SNP) avec une forte probabilité d'être différemment homozygotes entre donneur et receveur, selon les fréquences dans la population rapportées sur les bases de données génomiques. Lors du suivi post-transplantation, la présence de ddcf-DNA sera surveillée par identification du SNP du donneur dans l'ADN libre extrait du plasma du receveur par la méthode de séquençage de nouvelle génération (NGS). Les niveaux de ddcfDNA chez le receveur seront corrélés avec les données cliniques et histologiques obtenues à partir des biopsies pulmonaires de surveillance de routine à 3, 6 et 12 mois après la greffe. Tous les patients inscrits à l'étude signeront un consentement éclairé écrit spécifique à l'étude.
-Timeline : T-1 (avant transplantation pulmonaire) : génotypage ADN du receveur ; T0 (transplantation pulmonaire) : génotypage de l'ADN donneur ; T1, T2, T3, T4 (15 jours, 3, 6, 12 mois après la transplantation pulmonaire) : recherche ddcfDNA sur le sérum du receveur ; Tr : en cas de suspicion clinique de rejet cellulaire aigu. Aux T2, T3, T4 et Tr, des biopsies pulmonaires trans-bronchiques (TBB) de surveillance sont également réalisées, selon le protocole standard de suivi pulmonaire post-greffe de notre centre.
-Taille de l'échantillon et analyse statistique : Proportion ddcfDNA/ADN receveur : patients stables (pA) : 0,01, patients avec greffe endommagée (pB) : 0,30, proportion nA/nB : 3, Puissance (1-beta) : 0,80, Alpha : 5%, Marge de non infériorité δ : 0,05. Population (A+B) : 48 ; pour une éventuelle sortie de l'étude nous ajoutons 7 cas pour un total de 55 patients.
Type d'étude
Inscription (Anticipé)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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Milan, Italie, 20122
- Fondazione IRCCS CA' Granda Ospedale Maggiore Policlinico
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- Patients subissant une transplantation pulmonaire dans notre centre
- Patients âgés de 18 à 65 ans
- Consentement éclairé écrit pour participer à l'étude
Critère d'exclusion:
- Patients subissant une retransplantation
- Patients ayant des antécédents de transplantation d'organe solide
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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Transplantés pulmonaires
Receveurs âgés de 18 à 65 ans subissant une transplantation pulmonaire à la Fondazione IRCCS Ospedale Policlinico Milano subissant une quantification de l'ADN acellulaire dérivé d'un donneur sur des échantillons de plasma en série
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Quantification du ddcfDNA sur des échantillons de plasma en série lors du suivi après une transplantation pulmonaire
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Proportion ddcfDNA
Délai: 1 an
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Proportion de ddcfDNA sur l'ADN sans cellules plasmatiques du receveur
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1 an
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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corrélation ddcfDNA-données cliniques
Délai: 1 an
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Données cliniques sur les biopsies pulmonaires transbronchiques, les tests fonctionnels pulmonaires, la culture du liquide de lavage bronchoalvéolaire, les anticorps anti-antigène leucocytaire humain spécifiques au donneur.
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1 an
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Collaborateurs et enquêteurs
Collaborateurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Mario Nosotti, MD, Professor, Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico
Publications et liens utiles
Publications générales
- De Vlaminck I, Martin L, Kertesz M, Patel K, Kowarsky M, Strehl C, Cohen G, Luikart H, Neff NF, Okamoto J, Nicolls MR, Cornfield D, Weill D, Valantine H, Khush KK, Quake SR. Noninvasive monitoring of infection and rejection after lung transplantation. Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 Oct 27;112(43):13336-41. doi: 10.1073/pnas.1517494112. Epub 2015 Oct 12.
- De Vlaminck I, Valantine HA, Snyder TM, Strehl C, Cohen G, Luikart H, Neff NF, Okamoto J, Bernstein D, Weisshaar D, Quake SR, Khush KK. Circulating cell-free DNA enables noninvasive diagnosis of heart transplant rejection. Sci Transl Med. 2014 Jun 18;6(241):241ra77. doi: 10.1126/scitranslmed.3007803.
- Chambers DC, Yusen RD, Cherikh WS, Goldfarb SB, Kucheryavaya AY, Khusch K, Levvey BJ, Lund LH, Meiser B, Rossano JW, Stehlik J; International Society for Heart and Lung Transplantation. The Registry of the International Society for Heart and Lung Transplantation: Thirty-fourth Adult Lung And Heart-Lung Transplantation Report-2017; Focus Theme: Allograft ischemic time. J Heart Lung Transplant. 2017 Oct;36(10):1047-1059. doi: 10.1016/j.healun.2017.07.016. Epub 2017 Jul 19. No abstract available.
- Report CRT, Italy, Rete nazionale trapianti, 2017
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- Rizopoulos, D. The R package JMbayes for fitting joint models for longitudinal and timeto-event data using MCMC. Journal of Statistical Software 72(7), 1-45. doi:10.18637/jss.v072.i07. 2016
- Rizopoulos D. Dynamic predictions and prospective accuracy in joint models for longitudinal and time-to-event data. Biometrics. 2011 Sep;67(3):819-29. doi: 10.1111/j.1541-0420.2010.01546.x. Epub 2011 Feb 9.
- R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria(2015)
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Anticipé)
Achèvement de l'étude (Anticipé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
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Termes liés à cette étude
Mots clés
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- 1883/2018
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Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
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