Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

Bakteerimetalloforit akuutin pyelonefriitin diagnosoinnissa

tiistai 3. tammikuuta 2023 päivittänyt: Jan Hrbacek, M.D., Thomayer University Hospital

Akuutin pyelonefriitin aiheuttajien havaitseminen bakteerimetalloforien avulla

Hankkeen tavoitteena on tutkia bakteerien metalloforeja mahdollisina akuutin pyelonefriitin ja komplisoituneiden virtsatieinfektioiden diagnostisina merkkiaineina. Patogeeniset mikro-organismit erittävät nämä sekundaariset metaboliitit infektion aikana raudan ja muiden metalli-ionien ottamiseksi isännästä. Ne ovat lajikohtaisia ja ne voidaan havaita kehon nesteistä (mukaan lukien virtsasta) massaspektrometrialla. Tämän projektin mahdollinen panos on viljelmästä riippumaton menetelmä taudinaiheuttajan mikrobiologisen tekijän diagnosoimiseksi.

Tutkimuksen yleiskatsaus

Tila

Rekrytointi

Ehdot

Yksityiskohtainen kuvaus

Akuutti pyelonefriitti (AP) on kliininen oireyhtymä, jolle on tunnusomaista kuume, vilunväristykset, pahoinvointi, oksentelu ja selkärankakulman arkuus, bakteriuria ja pyuria. Taustalla oleva patofysiologia perustuu mikrobien esiintymiseen munuaisen parenkyymassa, jotka voivat edetä sepsikseen. Komplisoituneeseen virtsatieinfektioon (cUTI) liittyy virtsateiden tai isäntätekijöiden poikkeavuuksia, jotka vaikeuttavat infektion hävittämistä.

Yleisimpiä etiologisia tekijöitä ovat gram-negatiiviset enteeriset sauvat, ts. E. coli, Klebsiella pneumoniae; ja Enterococcus spp. Empiirinen antibioottihoito tulee kohdistaa, kun viljely- ja herkkyystulokset ovat saatavilla. Tämä kestää yleensä 24-48 tuntia, joskus jopa 72 tuntia. Riittämätön antibioottihoito johtaa korkeampaan kuolleisuuteen, jos etiologinen tekijä on useille lääkkeille resistentti fenotyyppi.

Metalloforit ovat bakteeripatogeenien tärkein virulenssitekijä. Nämä ovat kelatoivia molekyylejä, joita mikrobi erittää raudan, kuparin ja muiden metallien ottamiseksi isännästä. Esim. sideroforit tähtäävät Fe3+-ionien poistamiseen isäntäproteiinimolekyyleistä; kompleksi kiinnittyy sitten spesifisiin ekstrasellulaarisiin reseptoreihin mikrobisolussa ja sisäistyy. Yersiniabaktiini on toinen metallofori, joka sitoo kuparia.

Massaspektrometriaa käyttävää proteomista analyysiä on käytetty biomarkkerien havaitsemisessa useille patologisille tiloille: munuaisten vajaatoiminta, transplantaation jälkeinen nefropatia, erilaiset pahanlaatuiset kasvaimet jne. Metalloforit voidaan havaita massaspektrometrialla.

Opintotyyppi

Havainnollistava

Ilmoittautuminen (Odotettu)

Yhteystiedot ja paikat

Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.

Opiskeluyhteys

Nimi: Jan Hrbacek, PhD.
Puhelinnumero: +420261083688
Sähköposti: honzahrbacek@gmail.com

Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi

Nimi: Roman Zachoval, Prof.
Puhelinnumero: +420261083688
Sähköposti: roman.zachoval@ftn.cz

Opiskelupaikat

Tšekki
- - Praha, Tšekki, 14059
    - Rekrytointi
    - Thomayer University Hospital
    - Ottaa yhteyttä:
      
      Jan Hrbacek, PhD.
      
      Puhelinnumero: +420261083688
      
      Sähköposti: jan.hrbacek@ftn.cz
    - Ottaa yhteyttä:
      
      Jiri Stejskal, M.D.
      
      Puhelinnumero: +420261083688
      
      Sähköposti: jiri.stejskal@ftn.cz
    - Päätutkija:
      
      Jan Hrbacek, PhD.
    - Alatutkija:
      
      Jiri Stejskal, M.D.

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

18 vuotta ja vanhemmat (Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Sukupuolet, jotka voivat opiskella

Kaikki

Näytteenottomenetelmä

Ei-todennäköisyysnäyte

Tutkimusväestö

Urologian osastolle saapuvat ja kelpoisuusvaatimukset täyttävät potilaat.

Kuvaus

Sisällyttämiskriteerit:

potilas, jolla on AP/cUTI:n kliinisiä merkkejä ja oireita, tai avopotilaalla, jolla on akuutin komplisoitumattoman pyelonefriitin kliinisiä merkkejä ja oireita, tai potilas, jolla ei ole virtsatieinfektion kliinisiä oireita ja negatiivinen standardivirtsaviljelytulos

Poissulkemiskriteerit:

kyvyttömyys suostua

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

Havaintomallit: Case-Control
Aikanäkymät: Tulevaisuuden

Ryhmien/kohorttien lukumäärä

Kohortit ja interventiot

Ryhmä/Kohortti
Tapaukset Potilaat, joilla on AP tai cUTI, otettu hoitoon sairaalaan.
Kontrolliryhmä 1 Avopotilaat, jotka hakevat hoitoa komplisoitumattomaan akuuttiin kystiittiin.
Kontrolliryhmä 2 Osastolle otetut potilaat ilman virtsatietulehduksen merkkejä ja oireita ja virtsanviljelyn negatiivinen tulos.

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus	Toimenpiteen kuvaus	Aikaikkuna
Metalloforien havaitseminen Aikaikkuna: opintojen päätyttyä keskimäärin 1 vuosi	Metalloforien havaitseminen virtsanäytteistä	opintojen päätyttyä keskimäärin 1 vuosi
Mikro-organismien luokitus Aikaikkuna: opintojen päätyttyä keskimäärin 1 vuosi	Patogeenisen mikro-organismin taksonominen luokitus käyttämällä sen metalloforeja	opintojen päätyttyä keskimäärin 1 vuosi

Toissijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus	Toimenpiteen kuvaus	Aikaikkuna
Metalloforit vs. kulttuuri Aikaikkuna: opintojen päätyttyä keskimäärin 1 vuosi	Standardien virtsaviljelytulosten vertailu massaspektrometrialla saatuihin tuloksiin	opintojen päätyttyä keskimäärin 1 vuosi
Tapaukset vs. kontrollit 1 vs. kontrollit 2 Aikaikkuna: 1 vuosi opintojen päättymisen jälkeen	Metaloforien havaitsemisen vertailu AP/cUTI-tapauksissa akuuttiin komplisoitumattomaan kystiittiin verrattuna virtsatieinfektiovapaisiin henkilöihin	1 vuosi opintojen päättymisen jälkeen

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Sponsori

Thomayer University Hospital

Yhteistyökumppanit

Czech Academy of Sciences

Tutkijat

Opintojohtaja: Jan Hrbacek, PhD., Thomayer University Hospital

Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä

Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.

Yleiset julkaisut

Bonkat G, Bartoletti R, Bruyère F, Cai T, Geerlings SE, Köves B, et al. Guidelines on Urological Infections. 2020. Vallejo-Torres L, Pujol M, Shaw E, Wiegand I, Vigo JM, Stoddart M, et al. Cost of hospitalised patients due to complicated urinary tract infections: A retrospective observational study in countries with high prevalence of multidrug-resistant Gram-negative bacteria: The COMBACTE-MAGNET, RESCUING study. BMJ Open 2018;8:1-9. https://doi.org/10.1136/bmjopen-2017-020251. Hrbacek J, Cermak P, Zachoval R. Current antibiotic resistance trends of uropathogens in central europe: Survey from a tertiary hospital urology department 2011-2019. Antibiotics 2020;9:1-11. https://doi.org/10.3390/antibiotics9090630. Hyun M, Noh CI, Ryu SY, Kim HA. Changing trends in clinical characteristics and antibiotic susceptibility of Klebsiella pneumoniae bacteremia. Korean J Intern Med 2018;33:595-603. Caza M, Kronstad J. Shared and distinct mechanisms of iron acquisition by bacterial and fungal pathogens of humans. Front Cell Infect Microbiol 2013;4:1-23. https://doi.org/10.3389/fcimb.2013.00080. Prichystal J, Schug K, Lemr K, Novak J, Havlicek V. Structural analysis of natural products. Anal Chem 2016;88:10338-46. Václavková J, Ozdian T, Hajdúch M, Džubák P. Body fluids as a source of prote-omic biomarkers of various diseases. Chem List 2020;114:209-15 Skriba A, Pluhacek T, Palyzova A, Novy Z, Lemr K, Hajduch M, et al. Early and non-invasive diagnosis of aspergillosis revealed by infection kinetics monitored in a rat model. Front Microbiol 2018;9:1-7. https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.02356. Hrbacek J, Morais D, Cermak P, Hanacek V, Zachoval R. Alpha-diversity and microbial community structure of the male urinary microbiota depend on urine sampling method. Sci Rep 2021;11. https://doi.org/10.1038/s41598-021-03292-x.

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus (Todellinen)

Keskiviikko 24. kesäkuuta 2020

Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)

Sunnuntai 1. joulukuuta 2024

Opintojen valmistuminen (Odotettu)