Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Bakterielle metalloforer i diagnostisering av akutt pyelonefritt

3. januar 2023 oppdatert av: Jan Hrbacek, M.D., Thomayer University Hospital

Påvisning av forårsakende midler til akutt pyelonefritt ved bruk av bakterielle metalloforer

Prosjektet tar sikte på å undersøke bakterielle metalloforer som potensielle diagnostiske markører for akutt pyelonefritt og kompliserte urinveisinfeksjoner. Disse sekundære metabolittene skilles ut av patogene mikroorganismer i løpet av infeksjonen for opptak av jern og andre metalliske ioner fra verten. De er artsspesifikke og kan påvises i kroppsvæsker (inkludert urin) ved massespektrometri. Det potensielle bidraget til dette prosjektet er en kulturuavhengig metode for diagnostisering av det forårsakende mikrobiologiske middelet.

Studieoversikt

Status

Rekruttering

Forhold

Detaljert beskrivelse

Akutt pyelonefritt (AP) er et klinisk syndrom preget av feber, frysninger, kvalme oppkast og ømhet i costovertebral vinkel, bakteriuri og pyuri. Den underliggende patofysiologien er basert på tilstedeværelsen av mikrober i nyreparenkymet som kan utvikle seg til sepsis. Komplisert urinveisinfeksjon (cUTI) er en infeksjon ledsaget av abnormiteter i urinveiene eller vertsfaktorer som gjør det vanskelig å utrydde infeksjonen.

De vanligste etiologiske midlene inkluderer gramnegative enteriske staver, dvs. E. coli, Klebsiella pneumoniae; og Enterococcus spp. Empirisk antibiotikabehandling bør målrettes når kultur- og sensitivitetsresultater blir tilgjengelige. Dette tar vanligvis 24-48 timer, noen ganger til og med 72 timer. Utilstrekkelig antibiotikabehandling fører til høyere dødelighet dersom det etiologiske middelet er av en multiresistent fenotype.

Metalloforer er en viktig virulensfaktor for bakterielle patogener. Dette er chelaterende molekyler som skilles ut av mikroben for opptak av jern, kobber og andre metaller fra verten. Sideroforer tar for eksempel sikte på å fjerne Fe3+ ioner fra vertsproteinmolekylene; komplekset fester seg deretter til spesifikke ekstracellulære reseptorer på den mikrobielle cellen og blir internalisert. Yersiniabactin er en annen metallofor som binder kobber.

Proteomisk analyse ved bruk av massespektrometri har blitt brukt til påvisning av biomarkører for flere patologiske tilstander: nyresvikt, post-transplantasjon nefropati, ulike maligniteter etc. Metalloforer kan påvises ved massespektrometri.

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Forventet)

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiekontakt

Navn: Jan Hrbacek, PhD.
Telefonnummer: +420261083688
E-post: honzahrbacek@gmail.com

Studer Kontakt Backup

Navn: Roman Zachoval, Prof.
Telefonnummer: +420261083688
E-post: roman.zachoval@ftn.cz

Studiesteder

Tsjekkia
- - Praha, Tsjekkia, 14059
    - Rekruttering
    - Thomayer University Hospital
    - Ta kontakt med:
      
      Jan Hrbacek, PhD.
      
      Telefonnummer: +420261083688
      
      E-post: jan.hrbacek@ftn.cz
    - Ta kontakt med:
      
      Jiri Stejskal, M.D.
      
      Telefonnummer: +420261083688
      
      E-post: jiri.stejskal@ftn.cz
    - Hovedetterforsker:
      
      Jan Hrbacek, PhD.
    - Underetterforsker:
      
      Jiri Stejskal, M.D.

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

18 år og eldre (Voksen, Eldre voksen)

Tar imot friske frivillige

Nei

Kjønn som er kvalifisert for studier

Alle

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Pasienter som møter til urologisk avdeling og oppfyller kvalifikasjonskriteriene.

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

inneliggende pasient med kliniske tegn og symptomer på AP/cUTI eller poliklinisk pasient med kliniske tegn og symptomer på akutt ukomplisert pyelonefritt eller inneliggende pasient uten kliniske tegn på UVI og et negativt standard urinkulturresultat

Ekskluderingskriterier:

manglende evne til å samtykke

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

Observasjonsmodeller: Case-Control
Tidsperspektiver: Potensielle

Antall grupper / kohorter

Kohorter og intervensjoner

Gruppe / Kohort
Saker Innlagte pasienter med AP eller cUTI innlagt for behandling på sykehus.
Kontrollgruppe 1 Polikliniske pasienter som søker behandling for ukomplisert akutt blærebetennelse.
Kontrollgruppe 2 Innlagte pasienter innlagt i avdelingen uten tegn og symptomer på urinveisinfeksjon og med negativt urindyrkingsresultat.

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål	Tiltaksbeskrivelse	Tidsramme
Påvisning av metalloforer Tidsramme: gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 1 år	Påvisning av metalloforer i urinprøver	gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 1 år
Klassifisering av mikroorganismer Tidsramme: gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 1 år	Taksonomisk klassifisering av den patogene mikroorganismen ved bruk av metalloforene	gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 1 år

Sekundære resultatmål

Resultatmål	Tiltaksbeskrivelse	Tidsramme
Metalloforer versus kultur Tidsramme: gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 1 år	Sammenligningen av standard urinkulturresultater med de oppnådd fra massespektrometrianalyse	gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 1 år
Cases versus Controls 1 versus Controls 2 Tidsramme: 1 år etter avsluttet studie	Sammenligningen av påvisning av metalloforer i tilfeller med AP/cUTI versus akutt ukomplisert blærebetennelse versus urinveisinfeksjonsfrie individer	1 år etter avsluttet studie

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Sponsor

Thomayer University Hospital

Samarbeidspartnere

Czech Academy of Sciences

Etterforskere

Studieleder: Jan Hrbacek, PhD., Thomayer University Hospital

Publikasjoner og nyttige lenker

Den som er ansvarlig for å legge inn informasjon om studien leverer frivillig disse publikasjonene. Disse kan handle om alt relatert til studiet.

Generelle publikasjoner

Bonkat G, Bartoletti R, Bruyère F, Cai T, Geerlings SE, Köves B, et al. Guidelines on Urological Infections. 2020. Vallejo-Torres L, Pujol M, Shaw E, Wiegand I, Vigo JM, Stoddart M, et al. Cost of hospitalised patients due to complicated urinary tract infections: A retrospective observational study in countries with high prevalence of multidrug-resistant Gram-negative bacteria: The COMBACTE-MAGNET, RESCUING study. BMJ Open 2018;8:1-9. https://doi.org/10.1136/bmjopen-2017-020251. Hrbacek J, Cermak P, Zachoval R. Current antibiotic resistance trends of uropathogens in central europe: Survey from a tertiary hospital urology department 2011-2019. Antibiotics 2020;9:1-11. https://doi.org/10.3390/antibiotics9090630. Hyun M, Noh CI, Ryu SY, Kim HA. Changing trends in clinical characteristics and antibiotic susceptibility of Klebsiella pneumoniae bacteremia. Korean J Intern Med 2018;33:595-603. Caza M, Kronstad J. Shared and distinct mechanisms of iron acquisition by bacterial and fungal pathogens of humans. Front Cell Infect Microbiol 2013;4:1-23. https://doi.org/10.3389/fcimb.2013.00080. Prichystal J, Schug K, Lemr K, Novak J, Havlicek V. Structural analysis of natural products. Anal Chem 2016;88:10338-46. Václavková J, Ozdian T, Hajdúch M, Džubák P. Body fluids as a source of prote-omic biomarkers of various diseases. Chem List 2020;114:209-15 Skriba A, Pluhacek T, Palyzova A, Novy Z, Lemr K, Hajduch M, et al. Early and non-invasive diagnosis of aspergillosis revealed by infection kinetics monitored in a rat model. Front Microbiol 2018;9:1-7. https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.02356. Hrbacek J, Morais D, Cermak P, Hanacek V, Zachoval R. Alpha-diversity and microbial community structure of the male urinary microbiota depend on urine sampling method. Sci Rep 2021;11. https://doi.org/10.1038/s41598-021-03292-x.

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

24. juni 2020

Primær fullføring (Forventet)

1. desember 2024

Studiet fullført (Forventet)