Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Bakteriella metalloforer vid diagnos av akut pyelonefrit

3 januari 2023 uppdaterad av: Jan Hrbacek, M.D., Thomayer University Hospital

Detektering av orsakande medel för akut pyelonefrit med hjälp av bakteriella metalloforer

Projektet syftar till att undersöka bakteriella metalloforer som potentiella diagnostiska markörer för akut pyelonefrit och komplicerade urinvägsinfektioner. Dessa sekundära metaboliter utsöndras av patogena mikroorganismer under infektionsförloppet för upptag av järn och andra metalljoner från värden. De är artspecifika och kan detekteras i kroppsvätskor (inklusive urin) med masspektrometri. Det potentiella bidraget från detta projekt är en odlingsoberoende metod för diagnos av det orsakande mikrobiologiska medlet.

Studieöversikt

Status

Rekrytering

Betingelser

Detaljerad beskrivning

Akut pyelonefrit (AP) är ett kliniskt syndrom som kännetecknas av feber, frossa, illamående kräkningar och ömhet i övertebral vinkel, bakteriuri och pyuri. Den underliggande patofysiologin är baserad på närvaron av mikrober i njurparenkymet som kan utvecklas till sepsis. Komplicerad urinvägsinfektion (cUTI) är en som åtföljs av avvikelser i urinvägarna eller värdfaktorer som gör det svårt att utrota infektionen.

De vanligaste etiologiska medlen inkluderar gramnegativa enteriska stavar, dvs. E. coli, Klebsiella pneumoniae; och Enterococcus spp. Empirisk antibiotikabehandling bör målinriktas när odlings- och känslighetsresultat blir tillgängliga. Detta tar vanligtvis 24-48 timmar, ibland till och med 72 timmar. Otillräcklig antibiotikabehandling leder till högre dödlighet om det etiologiska medlet är av en multi-läkemedelsresistent fenotyp.

Metalloforer är en viktig virulensfaktor hos bakteriella patogener. Dessa är kelatbildande molekyler som utsöndras av mikroben för upptag av järn, koppar och andra metaller från värden. Exempelvis syftar sideroforer på att avlägsna Fe3+-joner från värdproteinmolekylerna; komplexet fäster sedan vid specifika extracellulära receptorer på den mikrobiella cellen och internaliseras. Yersiniabactin är en annan metallofor som binder koppar.

Proteomanalys med masspektrometri har använts för att detektera biomarkörer för flera patologiska tillstånd: njursvikt, post-transplantation nefropati, olika maligniteter etc. Metalloforer kan detekteras med masspektrometri.

Studietyp

Observationell

Inskrivning (Förväntat)

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studiekontakt

Namn: Jan Hrbacek, PhD.
Telefonnummer: +420261083688
E-post: honzahrbacek@gmail.com

Studera Kontakt Backup

Namn: Roman Zachoval, Prof.
Telefonnummer: +420261083688
E-post: roman.zachoval@ftn.cz

Studieorter

Tjeckien
- - Praha, Tjeckien, 14059
    - Rekrytering
    - Thomayer University Hospital
    - Kontakt:
      
      Jan Hrbacek, PhD.
      
      Telefonnummer: +420261083688
      
      E-post: jan.hrbacek@ftn.cz
    - Kontakt:
      
      Jiri Stejskal, M.D.
      
      Telefonnummer: +420261083688
      
      E-post: jiri.stejskal@ftn.cz
    - Huvudutredare:
      
      Jan Hrbacek, PhD.
    - Underutredare:
      
      Jiri Stejskal, M.D.

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

18 år och äldre (Vuxen, Äldre vuxen)

Tar emot friska volontärer

Nej

Kön som är behöriga för studier

Allt

Testmetod

Icke-sannolikhetsprov

Studera befolkning

Patienter som presenterar sig för urologiska avdelningen och uppfyller behörighetskriterierna.

Beskrivning

Inklusionskriterier:

inlagd med kliniska tecken och symtom på AP/cUTI eller poliklinisk patient med kliniska tecken och symtom på akut okomplicerad pyelonefrit eller sluten patient utan kliniska tecken på UVI och ett negativt standard urinodlingsresultat

Exklusions kriterier:

oförmåga att samtycka

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

Observationsmodeller: Case-Control
Tidsperspektiv: Blivande

Antal grupper/kohorter

Kohorter och interventioner

Grupp / Kohort
Fall Inlagda patienter med AP eller cUTI inlagda för behandling på sjukhuset.
Kontrollgrupp 1 Polispatienter som söker behandling för okomplicerad akut cystit.
Kontrollgrupp 2 Inlagda patienter inlagda på avdelningen utan tecken och symtom på urinvägsinfektion och med negativt urinodlingsresultat.

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått	Åtgärdsbeskrivning	Tidsram
Detektion av metalloforer Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 1 år	Detektering av metalloforer i urinprover	genom avslutad studie, i genomsnitt 1 år
Klassificering av mikroorganismer Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 1 år	Taxonomisk klassificering av den patogena mikroorganismen med hjälp av dess metalloforer	genom avslutad studie, i genomsnitt 1 år

Sekundära resultatmått

Resultatmått	Åtgärdsbeskrivning	Tidsram
Metalloforer kontra kultur Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 1 år	Jämförelsen av standard urinodlingsresultat med de erhållna från masspektrometrianalys	genom avslutad studie, i genomsnitt 1 år
Fall kontra kontroller 1 kontra kontroller 2 Tidsram: 1 år efter avslutad studie	Jämförelsen av detektion av metalloforer i fall med AP/cUTI kontra akut okomplicerad cystit mot urinvägsinfektionsfria individer	1 år efter avslutad studie

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Sponsor

Thomayer University Hospital

Samarbetspartners

Czech Academy of Sciences

Utredare

Studierektor: Jan Hrbacek, PhD., Thomayer University Hospital

Publikationer och användbara länkar

Den som ansvarar för att lägga in information om studien tillhandahåller frivilligt dessa publikationer. Dessa kan handla om allt som har med studien att göra.

Allmänna publikationer

Bonkat G, Bartoletti R, Bruyère F, Cai T, Geerlings SE, Köves B, et al. Guidelines on Urological Infections. 2020. Vallejo-Torres L, Pujol M, Shaw E, Wiegand I, Vigo JM, Stoddart M, et al. Cost of hospitalised patients due to complicated urinary tract infections: A retrospective observational study in countries with high prevalence of multidrug-resistant Gram-negative bacteria: The COMBACTE-MAGNET, RESCUING study. BMJ Open 2018;8:1-9. https://doi.org/10.1136/bmjopen-2017-020251. Hrbacek J, Cermak P, Zachoval R. Current antibiotic resistance trends of uropathogens in central europe: Survey from a tertiary hospital urology department 2011-2019. Antibiotics 2020;9:1-11. https://doi.org/10.3390/antibiotics9090630. Hyun M, Noh CI, Ryu SY, Kim HA. Changing trends in clinical characteristics and antibiotic susceptibility of Klebsiella pneumoniae bacteremia. Korean J Intern Med 2018;33:595-603. Caza M, Kronstad J. Shared and distinct mechanisms of iron acquisition by bacterial and fungal pathogens of humans. Front Cell Infect Microbiol 2013;4:1-23. https://doi.org/10.3389/fcimb.2013.00080. Prichystal J, Schug K, Lemr K, Novak J, Havlicek V. Structural analysis of natural products. Anal Chem 2016;88:10338-46. Václavková J, Ozdian T, Hajdúch M, Džubák P. Body fluids as a source of prote-omic biomarkers of various diseases. Chem List 2020;114:209-15 Skriba A, Pluhacek T, Palyzova A, Novy Z, Lemr K, Hajduch M, et al. Early and non-invasive diagnosis of aspergillosis revealed by infection kinetics monitored in a rat model. Front Microbiol 2018;9:1-7. https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.02356. Hrbacek J, Morais D, Cermak P, Hanacek V, Zachoval R. Alpha-diversity and microbial community structure of the male urinary microbiota depend on urine sampling method. Sci Rep 2021;11. https://doi.org/10.1038/s41598-021-03292-x.

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

24 juni 2020

Primärt slutförande (Förväntat)

1 december 2024

Avslutad studie (Förväntat)