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Métallophores bactériens dans le diagnostic de la pyélonéphrite aiguë

3 janvier 2023 mis à jour par: Jan Hrbacek, M.D., Thomayer University Hospital

Détection des agents responsables de la pyélonéphrite aiguë à l'aide de métallophores bactériens

Le projet vise à étudier les métallophores bactériens en tant que marqueurs diagnostiques potentiels de la pyélonéphrite aiguë et des infections compliquées des voies urinaires. Ces métabolites secondaires sont excrétés par des micro-organismes pathogènes au cours de l'infection pour l'absorption de fer et d'autres ions métalliques de l'hôte. Ils sont spécifiques à l'espèce et peuvent être détectés dans les fluides corporels (y compris l'urine) par spectrométrie de masse. La contribution potentielle de ce projet est une méthode indépendante de la culture pour le diagnostic de l'agent microbiologique responsable.

Aperçu de l'étude

Statut

Recrutement

Les conditions

Description détaillée

La pyélonéphrite aiguë (AP) est un syndrome clinique caractérisé par de la fièvre, des frissons, des nausées, des vomissements et une sensibilité de l'angle costo-vertébral, une bactériurie et une pyurie. La physiopathologie sous-jacente est basée sur la présence de microbes dans le parenchyme rénal pouvant évoluer vers une septicémie. L'infection urinaire compliquée (cUTI) s'accompagne d'anomalies des voies urinaires ou de facteurs de l'hôte qui rendent difficile l'éradication de l'infection.

Les agents étiologiques les plus courants comprennent les bâtonnets entériques gram-négatifs, c'est-à-dire E. coli, Klebsiella pneumoniae; et Enterococcus spp. Le traitement antibiotique empirique doit être ciblé une fois que les résultats de la culture et de la sensibilité sont disponibles. Cela prend généralement 24 à 48 heures, parfois même 72 heures. Un traitement antibiotique inadéquat entraîne une mortalité plus élevée si l'agent étiologique est de phénotype multirésistant.

Les métallophores sont un facteur de virulence majeur des pathogènes bactériens. Ce sont des molécules chélatrices sécrétées par le microbe pour l'absorption du fer, du cuivre et d'autres métaux de l'hôte. Par exemple, les sidérophores visent à éliminer les ions Fe3+ des molécules de protéines hôtes ; le complexe adhère alors à des récepteurs extracellulaires spécifiques sur la cellule microbienne et est internalisé. La yersiniabactine est un autre métallophore qui lie le cuivre.

L'analyse protéomique par spectrométrie de masse a été utilisée dans la détection de biomarqueurs pour plusieurs états pathologiques : insuffisance rénale, néphropathie post-transplantation, diverses malignités, etc. Les métallophores peuvent être détectés par spectrométrie de masse.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Anticipé)

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

Nom: Jan Hrbacek, PhD.
Numéro de téléphone: +420261083688
E-mail: honzahrbacek@gmail.com

Sauvegarde des contacts de l'étude

Nom: Roman Zachoval, Prof.
Numéro de téléphone: +420261083688
E-mail: roman.zachoval@ftn.cz

Lieux d'étude

Tchéquie
- - Praha, Tchéquie, 14059
    - Recrutement
    - Thomayer University Hospital
    - Contact:
      
      Jan Hrbacek, PhD.
      
      Numéro de téléphone: +420261083688
      
      E-mail: jan.hrbacek@ftn.cz
    - Contact:
      
      Jiri Stejskal, M.D.
      
      Numéro de téléphone: +420261083688
      
      E-mail: jiri.stejskal@ftn.cz
    - Chercheur principal:
      
      Jan Hrbacek, PhD.
    - Sous-enquêteur:
      
      Jiri Stejskal, M.D.

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

18 ans et plus (Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Non

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Patients se présentant au service d'urologie et remplissant les critères d'éligibilité.

La description

Critère d'intégration:

patient hospitalisé présentant des signes cliniques et des symptômes de PA/IUc ou patient ambulatoire présentant des signes cliniques et des symptômes de pyélonéphrite aiguë non compliquée ou patient hospitalisé sans signes cliniques d'IU et un résultat de culture d'urine standard négatif

Critère d'exclusion:

incapacité de consentir

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Modèles d'observation: Cas-témoins
Perspectives temporelles: Éventuel

Nombre de groupes / cohortes

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Cas Patients hospitalisés avec AP ou cUTI admis pour traitement à l'hôpital.
Groupe témoin 1 Patients ambulatoires cherchant un traitement pour une cystite aiguë non compliquée.
Groupe témoin 2 Patients hospitalisés admis dans le service sans signes et symptômes d'infection des voies urinaires et avec un résultat de culture d'urine négatif.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats	Description de la mesure	Délai
Détection des métallophores Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an	La détection des métallophores dans les échantillons d'urine	jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an
Classification des micro-organismes Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an	Classification taxonomique du microorganisme pathogène à l'aide de ses métallophores	jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats	Description de la mesure	Délai
Métallophores versus culture Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an	La comparaison des résultats de culture urinaire standard avec ceux obtenus à partir de l'analyse par spectrométrie de masse	jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an
Cas versus Témoins 1 versus Témoins 2 Délai: 1 an après la fin des études	La comparaison de la détection des métalophores dans les cas de PA/cUTI par rapport à la cystite aiguë non compliquée par rapport aux individus sans infection des voies urinaires	1 an après la fin des études

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Thomayer University Hospital

Collaborateurs

Czech Academy of Sciences

Les enquêteurs

Directeur d'études: Jan Hrbacek, PhD., Thomayer University Hospital

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Bonkat G, Bartoletti R, Bruyère F, Cai T, Geerlings SE, Köves B, et al. Guidelines on Urological Infections. 2020. Vallejo-Torres L, Pujol M, Shaw E, Wiegand I, Vigo JM, Stoddart M, et al. Cost of hospitalised patients due to complicated urinary tract infections: A retrospective observational study in countries with high prevalence of multidrug-resistant Gram-negative bacteria: The COMBACTE-MAGNET, RESCUING study. BMJ Open 2018;8:1-9. https://doi.org/10.1136/bmjopen-2017-020251. Hrbacek J, Cermak P, Zachoval R. Current antibiotic resistance trends of uropathogens in central europe: Survey from a tertiary hospital urology department 2011-2019. Antibiotics 2020;9:1-11. https://doi.org/10.3390/antibiotics9090630. Hyun M, Noh CI, Ryu SY, Kim HA. Changing trends in clinical characteristics and antibiotic susceptibility of Klebsiella pneumoniae bacteremia. Korean J Intern Med 2018;33:595-603. Caza M, Kronstad J. Shared and distinct mechanisms of iron acquisition by bacterial and fungal pathogens of humans. Front Cell Infect Microbiol 2013;4:1-23. https://doi.org/10.3389/fcimb.2013.00080. Prichystal J, Schug K, Lemr K, Novak J, Havlicek V. Structural analysis of natural products. Anal Chem 2016;88:10338-46. Václavková J, Ozdian T, Hajdúch M, Džubák P. Body fluids as a source of prote-omic biomarkers of various diseases. Chem List 2020;114:209-15 Skriba A, Pluhacek T, Palyzova A, Novy Z, Lemr K, Hajduch M, et al. Early and non-invasive diagnosis of aspergillosis revealed by infection kinetics monitored in a rat model. Front Microbiol 2018;9:1-7. https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.02356. Hrbacek J, Morais D, Cermak P, Hanacek V, Zachoval R. Alpha-diversity and microbial community structure of the male urinary microbiota depend on urine sampling method. Sci Rep 2021;11. https://doi.org/10.1038/s41598-021-03292-x.

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

24 juin 2020

Achèvement primaire (Anticipé)

1 décembre 2024

Achèvement de l'étude (Anticipé)