Uusi biomarkkeri HBV:hen liittyvän hepatosellulaarisen karsinooman vasteelle ja ennusteelle

Jäljelle jääneet kasvaimet ja varhainen uusiutuminen/metastaasi sädehoidon (RT) jälkeen vaarantavat potilaan eloonjäämisen hepatosellulaarisen karsinooman (HCC) kanssa. Residuaalin / uusiutumisen / etäpesäkkeiden ja kloonaalisuuden oikea-aikainen havaitseminen tarvitaan pelastushoitojen asianmukaiseen toteuttamiseen. HCC:n sädehoidon suurimmat tyydyttämättömät tarpeet ovat vaikeudet arvioida vastetta varhaisessa vaiheessa kuvien avulla ja havaita ajoissa intrahepaattinen uusiutuminen ja ekstrahepaattinen etäpesäke. Näin ollen tarvitaan tarkka ja henkilökohtainen biomarkkeri vasteen ennustamiseen ja sairauksien seurantaan. Soluton kasvainspesifinen DNA (ctDNA) on herättänyt huomiota lupaavana biomarkkerina syöpäpotilailla. HCC:ssä havaitsemisaste on kuitenkin alhainen (9-21,2 %), johtuen pääasiassa perinteisten somaattisten mutaatioiden rajallisesta esiintyvyydestä ja ctDNA-fragmenttien vaikeasta erottamisesta normaaleista soluista. Tutkijat pyrkivät kehittämään uuden ctDNA:n, virusisäntäkimeeran DNA:n (vh-DNA), biomarkkeriksi hepatiitti B -virukseen (HBV) liittyville HCC-potilaille, jotka saavat RT:tä. HBV vh-DNA:ta esiintyy ~ 90 %:lla HBV:hen liittyvistä HCC-potilaista, ja se voidaan erottaa normaaleista soluista vapautuneesta DNA:sta rikastamalla HBV-koettimilla. vh-DNA saattaa olla edullinen ctDNA:n perinteiselle somaattiselle mutaatiotyypille. Tutkijat olettavat, että HBV vh-DNA pystyisi diagnosoimaan jäännöskasvaimen tarkasti 6-12 kuukautta aikaisemmin kuin nykyiset kuvat ja ennustamaan varhaisen uusiutumisen/metastaasien, mikä mahdollistaa pelastushoitojen varhaisen puuttumisen.

Tutkijat käyttävät ensin aiemmin keräämiämme seeruminäytteitä ja kirurgisia/biopsiakudoksista HBV:hen liittyvistä HCC-potilaista, jotka saavat sädehoitoa. Capture NGS:n liitoskloonien johdonmukaisuus on testattava sekä pre- että post-RT-seerumien välillä, ja vh-DNA:n kopiomäärän sarjamuutokset ddPCR:llä kvantifioidaan edustavissa tapauksissa. Samat liitoskloonit pre-post-RT-seerumeista ja kirurgisista kudoksista varmistetaan ja vh-DNA:n kopiomäärän muutokset korreloidaan RT-vasteen ja sairauden hallintatilan kanssa.

Tutkijat suunnittelevat tunnistavansa HBV-integraatiot Capture NGS:n avulla ja kvantifioivansa spesifisen vh-DNA:n ddPCR:llä yksilöllisinä biomarkkereina saman potilaan seeruminäytteistä. Tutkijat korreloivat edelleen kliinisen vasteen ja uusiutumisen/metastaasin vh-DNA-kopiolukujen sarjamuutosten kanssa. Tutkijat ovat ottaneet prospektiivisesti plasmanäytteitä HBV:hen liittyvistä HCC-potilaista ennen/jälkeen RT:n, 1, 4 ja 7 kuukauden kohdalla ja uusiutumisen/etäpesäkkeiden yhteydessä. Tutkijat suunnittelevat vahvistavansa saman liitoskloonin plasman vh-DNA-kopioiden RT:tä edeltävien/jälkeisten muutosten elinkelpoisen roolin post-RT-vasteessa ja -ennusteessa. Lisäksi tutkijat tutkivat toistuvia/metastaattisia kasvaimia, jotka johtuvat alkuperäisestä tai de novo kasvaimesta tunnistamalla niiden kloonisuuden HBV-integraatiokuvioiden kanssa. Tämän uuden HBV-kimeeran vh-DNA:n todellinen arvo paljastetaan. Tulokset tukevat myös personoidun vh-DNA:n konsolidoivaa käyttöä hoitovasteen arvioimiseksi aikaisemmassa vaiheessa RT:n jälkeen, RT:n jälkeiseen sairauden seurantaan ja kloonaalisuuden erottamiseen uusiutuessa suunniteltaessa tulevaa yhdistelmähoitoa koskevaa kliinistä tutkimusta.