En ny biomarkör för svar och prognos av HBV-relaterat leverkarcinom

Kvarvarande tumörer och tidig recidiv/metastasering efter strålbehandling (RT) äventyrar patientens överlevnad med hepatocellulärt karcinom (HCC). Snabb detektering av kvarvarande/återfall/metastaser och klonalitet krävs för att implementera räddningsterapier korrekt. De största otillfredsställda behoven av strålbehandling mot HCC är svårigheterna med att tidigt utvärdera respons genom bilder och snabb upptäckt av intrahepatisk recidiv och extrahepatisk metastasering. Därför krävs en korrekt och personlig biomarkör för svarsförutsägelse och sjukdomsövervakning. Cellfritt tumörspecifikt DNA (ctDNA) har fått uppmärksamhet som en lovande biomarkör hos cancerpatienter. Men i HCC är detektionsgraden låg (9-21,2%), främst på grund av den begränsade förekomsten av traditionella somatiska mutationer och den svåra separationen av ctDNA-fragment från normala celler. Utredarna strävar efter att utveckla ett nytt ctDNA, virus-värd-chimär-DNA (vh-DNA), som en biomarkör för hepatit B-virus (HBV)-relaterade HCC-patienter som genomgår RT. HBV vh-DNA finns i ~90% av HBV-relaterade HCC-patienter och kan differentieras från DNA som frisätts från de normala cellerna genom anrikning genom att fånga med HBV-sonder. vh-DNA kan vara fördelaktigt för den traditionella somatiska mutationstypen av ctDNA. Utredarna antar att HBV vh-DNA exakt kunde diagnostisera kvarvarande tumör 6-12 månader tidigare än samtida bilder och förutsäga tidigt återfall/metastaser, vilket möjliggör tidig intervention av räddningsterapier.

Utredarna kommer först att använda våra tidigare insamlade serumprover och kirurgiska/biopsierade vävnader från HBV-relaterade HCC-patienter som genomgår strålbehandling. Konsistensen av junctional kloner av Capture NGS måste testas mellan både pre- och post-RT-serum, och serieändringar i antal kopior av vh-DNA genom ddPCR kvantifieras i de representativa fallen. Samma kopplingskloner från pre-post-RT-serum och kirurgiska vävnader kommer att bekräftas och kopieantalförändringarna av vh-DNA korreleras med RT-svar och sjukdomskontrollstatus.

Utredarna planerar att identifiera HBV-integrationer med Capture NGS och kvantifiera det specifika vh-DNA:t med ddPCR som personliga biomarkörer från samma patientserumprover. Utredarna kommer ytterligare att korrelera kliniskt svar och återfall/metastaser med seriella förändringar av vh-DNA-kopiantal. Utredarna har prospektivt samlat in plasmaprover från HBV-relaterade HCC-patienter före/efter RT, vid 1, 4, 7 månader och vid återfall/metastasering. Utredarna planerar att bekräfta den livskraftiga rollen av pre-/post-RT förändringar av plasma vh-DNA kopior av samma junction klon i post-RT svar och prognos. Dessutom kommer utredarna att utforska de återkommande/metastaserande tumörerna som härrör från originalet eller de novo genom att identifiera deras klonalitet med HBV-integrationsmönster. Det verkliga värdet av detta nya HBV chimär vh-DNA kommer att avslöjas. Resultaten kommer också att stödja den konsoliderade användningen av personlig vh-DNA för tidigare utvärdering av behandlingssvar efter RT, för övervakning av sjukdomar efter RT och för differentiering av klonalitet vid återfall för att utforma framtida kliniska prövningar på kombinationsbehandling.