En ny biomarkør for respons og prognose av HBV-relatert hepatocellulært karsinom

Resterende svulster og tidlig residiv/metastase etter strålebehandling (RT) kompromitterer pasientens overlevelse med hepatocellulært karsinom (HCC). Rettidig påvisning av gjenværende/residiv/metastaser og klonalitet er nødvendig for å implementere bergingsterapier riktig. De største udekkede behovene for strålebehandling mot HCC er vanskelighetene med tidlig evaluering av respons ved bilder og rettidig påvisning av intrahepatisk tilbakefall og ekstrahepatisk metastaser. Det kreves derfor en nøyaktig og personlig biomarkør for responsprediksjon og sykdomsovervåking. Cellefritt tumorspesifikk DNA (ctDNA) har fått oppmerksomhet som en lovende biomarkør hos kreftpasienter. Men i HCC er deteksjonsraten lav (9-21,2 %), hovedsakelig på grunn av den begrensede utbredelsen av tradisjonelle somatiske mutasjoner og den vanskelige separasjonen av ctDNA-fragmenter fra normale celler. Etterforskerne tar sikte på å utvikle et nytt ctDNA, virusvert-kimær-DNA (vh-DNA), som en biomarkør for hepatitt B-virus (HBV)-relaterte HCC-pasienter som gjennomgår RT. HBV vh-DNA presenteres i ~90 % av HBV-relaterte HCC-pasienter og kan differensieres fra DNA frigjort fra de normale cellene gjennom anrikning ved å fange med HBV-prober. vh-DNA kan være fordelaktig for den tradisjonelle somatiske mutasjonstypen av ctDNA. Etterforskerne antar at HBV vh-DNA nøyaktig kan diagnostisere gjenværende svulst 6-12 måneder tidligere enn moderne bilder og forutsi tidlig tilbakefall/metastatisering, og tillater dermed tidlig intervensjon av bergingsterapier.

Etterforskerne vil først bruke våre tidligere innsamlede serumprøver og kirurgisk/biopsiert vev fra HBV-relaterte HCC-pasienter som gjennomgår strålebehandling. Konsistensen av koblingskloner av Capture NGS må testes mellom både pre- og post-RT-serum, og serieendringer i kopiantall av vh-DNA ved ddPCR kvantifiseres i de representative tilfellene. De samme koblingsklonene fra pre-post-RT-serum og kirurgisk vev vil bli bekreftet og kopiantallsendringene av vh-DNA korreleres med RT-respons og sykdomskontrollstatus.

Etterforskerne planlegger å identifisere HBV-integrasjoner av Capture NGS og kvantifisere det spesifikke vh-DNA ved ddPCR som personaliserte biomarkører fra samme pasientserumprøver. Etterforskerne vil videre korrelere klinisk respons og residiv/metastase med serielle endringer av vh-DNA kopitall. Etterforskerne har prospektivt samlet inn plasmaprøver fra HBV-relaterte HCC-pasienter før/etter RT, ved 1, 4, 7 måneder og ved tilbakefall/metastase. Etterforskerne planlegger å bekrefte den levedyktige rollen til pre-/post-RT-endringer av plasma vh-DNA-kopier av den samme koblingsklonen i post-RT-respons og prognose. Videre vil etterforskerne utforske de tilbakevendende/metastatiske svulstene som oppstår fra den opprinnelige eller en de novo ved å identifisere deres klonalitet med HBV-integrasjonsmønstre. Den sanne verdien av dette nye HBV chimera vh-DNAet vil bli avslørt. Resultatene vil også støtte konsolidert bruk av personlig vh-DNA for tidligere evaluering av behandlingsrespons etter RT, for post-RT sykdomsovervåking, og for å differensiere klonalitet ved tilbakefall for å designe fremtidige kliniske studier på kombinasjonsbehandling.