En ny biomarkør for respons og prognose af HBV-relateret hepatocellulært karcinom

Resterende tumorer og tidligt tilbagefald/metastaser efter strålebehandling (RT) kompromitterer patientens overlevelse med hepatocellulært karcinom (HCC). Rettidig påvisning af rest/tilbagevendende/metastase og klonalitet er påkrævet for at implementere redningsterapier korrekt. De største udækkede behov for strålebehandling til HCC er vanskelighederne med tidlig evaluering af respons ved billeder og rettidig påvisning af intrahepatisk tilbagefald og ekstrahepatisk metastaser. Der kræves således en nøjagtig og personlig biomarkør til responsforudsigelse og sygdomsovervågning. Cellefrit tumorspecifikt DNA (ctDNA) har fået opmærksomhed som en lovende biomarkør hos cancerpatienter. I HCC er detektionsraten dog lav (9-21,2 %), hovedsageligt på grund af den begrænsede forekomst af traditionelle somatiske mutationer og den vanskelige adskillelse af ctDNA-fragmenter fra normale celler. Efterforskerne sigter mod at udvikle et nyt ctDNA, virusværtskimær-DNA (vh-DNA), som en biomarkør for hepatitis B-virus (HBV)-relaterede HCC-patienter, der gennemgår RT. HBV vh-DNA findes i ~90% af HBV-relaterede HCC-patienter og kan differentieres fra DNA frigivet fra de normale celler gennem berigelse ved indfangning med HBV-prober. vh-DNA kan være fordelagtigt for den traditionelle somatiske mutationstype af ctDNA. Efterforskerne antager, at HBV vh-DNA nøjagtigt kunne diagnosticere resterende tumor med 6-12 måneder tidligere end nutidige billeder og forudsige tidligt tilbagefald/metastatisering, hvilket muliggør tidlig intervention af redningsterapier.

Efterforskerne vil først bruge vores tidligere indsamlede serumprøver og kirurgisk/biopsieret væv fra HBV-relaterede HCC-patienter, der gennemgår strålebehandling. Konsistensen af ​​junctional kloner af Capture NGS skal testes mellem både præ- og post-RT-serum, og serielle ændringer i kopiantal af vh-DNA ved ddPCR kvantificeres i de repræsentative tilfælde. De samme junction-kloner fra præ-post-RT-serum og kirurgisk væv vil blive bekræftet, og kopiantalændringerne af vh-DNA vil blive korreleret med RT-respons og sygdomskontrolstatus.

Efterforskerne planlægger at identificere HBV-integrationer ved Capture NGS og kvantificere det specifikke vh-DNA ved ddPCR som personaliserede biomarkører fra serumprøver fra samme patient. Efterforskerne vil yderligere korrelere klinisk respons og recidiv/metastase med serielle ændringer af vh-DNA kopital. Efterforskerne har prospektivt indsamlet plasmaprøver fra HBV-relaterede HCC-patienter før/efter RT, efter 1, 4, 7 måneder og ved recidiv/metastase. Efterforskerne planlægger at bekræfte den levedygtige rolle af præ-/post-RT-ændringer af plasma vh-DNA-kopier af den samme junction-klon i post-RT-respons og prognose. Desuden vil efterforskerne udforske de tilbagevendende/metastatiske tumorer, der stammer fra den oprindelige eller en de novo, ved at identificere deres klonalitet med HBV-integrationsmønstre. Den sande værdi af dette nye HBV-kimær vh-DNA vil blive afsløret. Resultaterne vil også understøtte den konsoliderede brug af personlig vh-DNA til tidligere evaluering af behandlingsrespons efter RT, til post-RT sygdomsmonitorering og til differentiering af klonalitet ved tilbagefald for at designe fremtidige kliniske forsøg med kombinationsbehandling.