Nowy biomarker odpowiedzi i prognozy raka wątrobowokomórkowego związanego z HBV

Resztkowe guzy i wczesne nawroty/przerzuty po radioterapii (RT) zagrażają przeżywalności pacjentów z rakiem wątrobowokomórkowym (HCC). Terminowe wykrywanie resztek/nawrotów/przerzutów i klonalności jest wymagane do prawidłowego wdrożenia terapii ratunkowych. Główne niezaspokojone potrzeby związane z radioterapią HCC to trudności we wczesnej ocenie odpowiedzi za pomocą obrazów oraz wykrywaniu nawrotu wewnątrzwątrobowego i przerzutów pozawątrobowych w odpowiednim czasie. W związku z tym wymagany jest dokładny i spersonalizowany biomarker do przewidywania odpowiedzi i monitorowania choroby. Wolny od komórek DNA specyficzny dla nowotworu (ctDNA) zyskał zainteresowanie jako obiecujący biomarker u pacjentów z rakiem. Jednak w przypadku HCC wykrywalność jest niska (9-21,2%), głównie z powodu ograniczonej częstości występowania tradycyjnych mutacji somatycznych oraz trudnej separacji fragmentów ctDNA z prawidłowych komórek. Celem badaczy jest opracowanie nowego ctDNA, chimerowego DNA wirus-gospodarz (vh-DNA), jako biomarkera dla pacjentów z HCC związanych z wirusem zapalenia wątroby typu B (HBV) poddawanych RT. HBV vh-DNA występuje u około 90% pacjentów z HCC związanych z HBV i można go odróżnić od DNA uwolnionego z normalnych komórek poprzez wzbogacenie przez wychwytywanie sondami HBV. vh-DNA może być korzystne dla tradycyjnego typu mutacji somatycznej ctDNA. Badacze postawili hipotezę, że HBV vh-DNA może dokładnie zdiagnozować resztkowy guz o 6-12 miesięcy wcześniej niż współczesne obrazy i przewidzieć wczesny nawrót/przerzuty, co pozwala na wczesną interwencję terapii ratunkowych.

Badacze najpierw wykorzystają nasze wcześniej pobrane próbki surowicy i tkanki chirurgiczne/biopsyjne od pacjentów HCC związanych z HBV poddawanych radioterapii. Konsystencja klonów łączących z Capture NGS musi zostać przetestowana pomiędzy surowicami przed i po RT, a seryjne zmiany liczby kopii vh-DNA za pomocą ddPCR są określane ilościowo w reprezentatywnych przypadkach. Te same klony połączeń z surowic przed RT i tkanek chirurgicznych zostaną potwierdzone, a zmiany liczby kopii vh-DNA zostaną skorelowane z odpowiedzią RT i statusem kontroli choroby.

Badacze planują zidentyfikować integracje HBV za pomocą Capture NGS i określić ilościowo specyficzny vh-DNA za pomocą ddPCR jako spersonalizowane biomarkery z próbek surowicy tego samego pacjenta. Badacze będą dalej skorelować odpowiedź kliniczną i nawrót/przerzuty z seryjnymi zmianami liczby kopii vh-DNA. Badacze prospektywnie zbierali próbki osocza od pacjentów z HCC związanych z HBV przed/po RT, po 1, 4, 7 miesiącach oraz przy nawrocie/przerzutach. Badacze planują potwierdzić realną rolę zmian przed i po RT w osoczowych kopiach vh-DNA tego samego klonu łączącego w odpowiedzi i rokowaniu po RT. Ponadto badacze zbadają guzy nawracające/przerzutowe powstające z pierwotnego lub de novo, identyfikując ich klonalność z wzorcami integracji HBV. Prawdziwa wartość tego nowego DNA chimery HBV vh-DNA zostanie ujawniona. Wyniki będą również wspierać konsolidację wykorzystania spersonalizowanego vh-DNA do wcześniejszej oceny odpowiedzi na leczenie po RT, do monitorowania choroby po RT oraz do różnicowania klonalności przy nawrocie w celu zaprojektowania przyszłych badań klinicznych dotyczących leczenia skojarzonego.