Nový biomarker pro odpověď a prognózu hepatocelulárního karcinomu souvisejícího s HBV

Reziduální nádory a časná recidiva/metastázy po radioterapii (RT) omezují přežití pacienta s hepatocelulárním karcinomem (HCC). Včasná detekce reziduí/recidivy/metastázy a klonality je nutná pro správné zavedení záchranných terapií. Hlavními nenaplněnými potřebami radioterapie na HCC jsou potíže s časným vyhodnocením odpovědi pomocí obrázků a včasnou detekcí intrahepatální recidivy a extrahepatálních metastáz. Je tedy vyžadován přesný a personalizovaný biomarker pro predikci odezvy a monitorování onemocnění. Bezbuněčná nádorově specifická DNA (ctDNA) si získala pozornost jako slibný biomarker u pacientů s rakovinou. U HCC je však míra detekce nízká (9–21,2 %), především kvůli omezenému výskytu tradičních somatických mutací a obtížné separaci fragmentů ctDNA od normálních buněk. Cílem výzkumných pracovníků je vyvinout novou ctDNA, chimérní DNA hostitele viru (vh-DNA), jako biomarker pro pacienty s HCC související s virem hepatitidy B (HBV), kteří podstupují RT. HBV vh-DNA se vyskytuje u ~ 90 % pacientů HCC souvisejících s HBV a lze ji odlišit od DNA uvolněné z normálních buněk obohacením zachycením sondami HBV. vh-DNA může být výhodná pro tradiční typ somatických mutací ctDNA. Vyšetřovatelé předpokládají, že HBV vh-DNA by mohla přesně diagnostikovat reziduální nádor o 6–12 měsíců dříve než současné obrazy a předpovídat časnou recidivu/metastázii, což umožňuje včasnou intervenci záchranných terapií.

Vyšetřovatelé nejprve použijí naše dříve odebrané vzorky séra a chirurgické/biopsiované tkáně od pacientů HCC souvisejících s HBV, kteří podstupují radioterapii. Konzistenci junkčních klonů pomocí Capture NGS je třeba testovat mezi séry před a po RT a v reprezentativních případech jsou kvantifikovány sériové změny v počtu kopií vh-DNA pomocí ddPCR. Budou potvrzeny stejné spojovací klony ze sér a chirurgických tkání před post-RT a změny počtu kopií vh-DNA budou korelovány s odpovědí RT a stavem kontroly onemocnění.

Výzkumníci plánují identifikovat integrace HBV pomocí Capture NGS a kvantifikovat specifickou vh-DNA pomocí ddPCR jako personalizované biomarkery ze vzorků séra stejného pacienta. Výzkumníci budou dále korelovat klinickou odpověď a recidivu/metastázu se sériovými změnami počtu kopií vh-DNA. Vyšetřovatelé prospektivně odebírali vzorky plazmy od pacientů HCC souvisejících s HBV před/po RT, po 1, 4, 7 měsících a při recidivě/metastáze. Výzkumníci plánují potvrdit životaschopnou roli pre-/post-RT změn plazmatických kopií vh-DNA stejného spojovacího klonu v post-RT odpovědi a prognóze. Kromě toho vyšetřovatelé prozkoumají recidivující/metastatické nádory vznikající z původního nebo de novo nádoru identifikací jejich klonality se vzory integrace HBV. Skutečná hodnota této nové HBV chiméry vh-DNA bude odhalena. Výsledky také podpoří konsolidační použití personalizované vh-DNA pro dřívější vyhodnocení léčebné odpovědi po RT, pro sledování onemocnění po RT a pro odlišení klonality při recidivě pro navržení budoucí klinické studie kombinační léčby.