Suoliston mikrobiotan karakterisointi ja kliininen vaikutus lymfoomassa

Mikrobiotalla tarkoitetaan kommensaalisten, symbioottisten ja patogeenisten mikro-organismien ekologista yhteisöä, joka kolonisoi ihmiskehon eri osia, mukaan lukien maha-suolikanava. Koostumuksella on osoitettu olevan tärkeä rooli monien sairauksien patofysiologiassa sekä vaikuttavan isännän homeostaattisiin prosesseihin, kuten aineenvaihduntaprosessien säätelyyn, patogeenejä vastaan ​​suojautumiseen, immuunijärjestelmän kehitykseen, immuunivasteen ja tulehduksen säätelyyn. Suoliston mikrobiotan ja lymfooman välinen yhteys on kuitenkin edelleen huonosti ymmärretty.

Tämän tutkimuksen tarkoituksena on arvioida suoliston mikrobiomin koostumusta ja monimuotoisuutta suuressa homogeenisessa potilasryhmässä, jolla on äskettäin diagnosoitu ja aiemmin hoitamaton diffuusi suuri B-solulymfooma (DLBCL). Tutkijat pyrkivät tunnistamaan suoliston mikrobiotan, DLBCL:n kliinisten ja molekyylien alatyyppien ja taudin lopputuloksen välisen suhteen. Myös ravinnon, fyysisen aktiivisuuden, kehon koostumuksen, antineoplastisen hoidon toksisuuden, infektioiden, antibioottien käytön, komorbiditeetin ja kasvaimen genetiikan yhteyttä suoliston mikrobiotan koostumukseen ja monimuotoisuuteen tutkitaan.

Hanke toteutetaan yhteistyössä kliinisten osastojen, laitosten ja laboratorioiden kanssa, joilla on mikrobiologian, hematologian, patologian, ravitsemuksen, molekyylibiologian, immunologian ja bioinformatiikan asiantuntemusta.

Tutkimuksen hypoteesi ovat:

1. DLBCL-potilailla on selkeät lähtötason mikrobiotan tunnusmerkit, jotka eroavat terveistä koehenkilöistä.
2. Merkittäviä muutoksia mikrobiotan koostumuksessa ja monimuotoisuudessa voidaan tunnistaa DLBCL:n hoidon (immunokemoterapia) aikana ja sen jälkeen.
3. DLBCL-mikrobiotan koostumus ja monimuotoisuus vaikuttavat lymfoomavasteeseen ja lopputulokseen.
4. Suoliston mikrobiota muuttuu kohti mikrobiotaa, joka muistuttaa enemmän terveiden kontrollien mikrobiota potilailla, jotka pysyvät lymfooman remissiossa vuoden kuluttua hoidon päättymisestä.
5. Selkeät DLBCL-mikrobiotaprofiilit liittyvät hoitoon liittyvään toksisuuteen.
6. Suoliston mikrobisto vaikuttaa infektioriskiin (kliinisesti ja/tai mikrobiologisesti dokumentoitu).
7. Suoliston mikrobiotaan vaikuttaa käyttämällä antibiootteja sekä infektioiden ennaltaehkäisynä että hoitona.
8. DLBCL-mikrobiota riippuu ravinnon saannista, tupakoinnista, fyysisestä aktiivisuudesta ja kehon koostumuksesta.
9. Selkeät suoliston mikrobiotan allekirjoitukset voidaan yhdistää DLBCL:n molekyylialatyyppeihin (tai päinvastoin)
10. JAK2V617F-, TET2-, DNMT3A- ja ASXL1-mutaatiot vaikuttavat suoliston mikrobiotan allekirjoitukseen ja liittyvät DLBCL:n komorbiditeettiin ja lopputulokseen.
11. Suoliston dysbioosin ja lymfooman välillä vallitsee noidankehä, jossa suoliston mikrobiston ja syövän välinen ylikuuluminen ilmenee sytokiinien, kemokiinien ja kasvutekijöiden profiilin muutoksina; immuunivaste, jota heijastavat perifeerisen veren mononukleaarisolujen immunofenotyyppiset profiilit; ja tyypilliset aineenvaihduntatuotteiden allekirjoitukset veressä.