Karakterisering og klinisk effekt af tarmmikrobiotaen i lymfom

Mikrobiota refererer til et økologisk samfund af kommensale, symbiotiske og patogene mikroorganismer, der koloniserer de forskellige rum i den menneskelige krop, herunder mave-tarmkanalen. Sammensætningen har vist sig at spille en vigtig rolle i patofysiologien af ​​mange sygdomme samt påvirke værtens homøostatiske processer såsom regulering af metaboliske processer, forsvar mod patogener, immunsystemudvikling, regulering af immunrespons og inflammation. Forbindelsen mellem tarmmikrobiota og lymfom er dog stadig dårligt forstået.

Formålet med denne undersøgelse er at evaluere sammensætningen og diversiteten af ​​tarmmikrobiomet i en stor homogen gruppe af patienter med nyligt diagnosticeret og behandlingsnaive diffust stort B-cellet lymfom (DLBCL). Efterforskerne sigter mod at identificere forholdet mellem tarmmikrobiotaen, kliniske og molekylære undertyper af DLBCL og udfaldet af sygdommen. Forbindelsen mellem ernæring, fysisk aktivitet, kropssammensætning, toksicitet over for antineoplastisk behandling, infektioner, brug af antibiotika, komorbiditet og tumorgenetik versus tarmmikrobiotasammensætning og mangfoldighed undersøges også.

Projektet udføres i samarbejde mellem kliniske afdelinger, institutter og laboratorier med ekspertise inden for mikrobiologi, hæmatologi, patologi, ernæring, molekylærbiologi, immunologi og bioinformatik.

Hypoteserne for undersøgelsen er:

1. Patienter med DLBCL har distinkte baseline mikrobiota-signaturer, der adskiller sig fra raske forsøgspersoner.
2. Betydelige ændringer i mikrobiotaens sammensætning og mangfoldighed kan identificeres under og efter behandling (immunokemoterapi) af DLBCL.
3. Lymfomrespons og resultat påvirkes af sammensætningen og diversiteten af ​​DLBCL-mikrobiotaen.
4. Tarmmikrobiotaen ændrer sig i retning af en mikrobiota, der ligner mikrobiotaen hos raske kontroller hos patienter, der forbliver i lymfomremission et år efter afslutningen af ​​behandlingen.
5. Distinkte DLBCL-mikrobiotaprofiler er forbundet med behandlingsrelateret toksicitet.
6. Tarmmikrobiotaen påvirker risikoen for infektioner (klinisk og/eller mikrobiologisk dokumenteret).
7. Tarmmikrobiotaen påvirkes ved hjælp af antibiotika både som profylakse og behandling af infektioner.
8. DLBCL-mikrobiotaen afhænger af kostens indtag, rygning, fysisk aktivitet og kropssammensætning.
9. Distinkte tarmmikrobiota-signaturer kan associeres med molekylære undertyper af DLBCL (eller omvendt)
10. JAK2V617F, TET2, DNMT3A og ASXL1 mutationerne påvirker tarmens mikrobiota signatur og er forbundet med komorbiditet og udfald i DLBCL
11. Der er en ond cirkel mellem intestinal dysbiose og lymfom, hvor krydstale mellem tarmmikrobiotaen og kræften udtrykkes som ændringer i profilen af ​​cytokiner, kemokiner og vækstfaktorer; et immunrespons afspejlet af immunfænotypiske profiler af perifere blodmononukleære celler; og karakteristiske metabolitsignaturer i blodet.