Charakterizace a klinický dopad střevní mikrobioty u lymfomu

Mikrobiota označuje ekologické společenství komenzálních, symbiotických a patogenních mikroorganismů, které kolonizují různé kompartmenty v lidském těle včetně gastrointestinálního traktu. Bylo prokázáno, že kompozice hraje důležitou roli v patofyziologii mnoha onemocnění a také ovlivňuje hostitelské homeostatické procesy, jako je regulace metabolických procesů, obrana proti patogenům, vývoj imunitního systému, regulace imunitní odpovědi a zánětu. Spojení mezi střevní mikrobiotou a lymfomem však zůstává nedostatečně pochopeno.

Účelem této studie je zhodnotit složení a diverzitu střevního mikrobiomu u velké homogenní skupiny pacientů s nově diagnostikovaným a dosud neléčeným difuzním velkobuněčným B-lymfomem (DLBCL). Cílem výzkumníků je identifikovat vztah mezi střevní mikrobiotou, klinickými a molekulárními podtypy DLBCL a výsledkem onemocnění. Je také zkoumána souvislost mezi výživou, fyzickou aktivitou, tělesným složením, toxicitou pro antineoplastickou terapii, infekcemi, užíváním antibiotik, komorbiditou a genetikou nádorů versus složení a rozmanitost střevní mikroflóry.

Projekt je realizován ve spolupráci mezi klinickými pracovišti, ústavy a laboratořemi s odbornými znalostmi v oblasti mikrobiologie, hematologie, patologie, výživy, molekulární biologie, imunologie a bioinformatiky.

Hypotézy studie jsou:

1. Pacienti s DLBCL mají odlišné základní mikrobioty, které se liší od zdravých jedinců.
2. Významné změny ve složení a diverzitě mikrobioty lze identifikovat během a po léčbě (imunochemoterapie) DLBCL.
3. Odpověď a výsledek lymfomu je ovlivněn složením a diverzitou mikrobioty DLBCL.
4. Střevní mikroflóra se u pacientů, kteří zůstávají v remisi lymfomu jeden rok po ukončení terapie, mění směrem k mikrobiotě, která se více podobá mikrobiotě zdravých kontrol.
5. Odlišné profily mikrobioty DLBCL jsou spojeny s toxicitou související s léčbou.
6. Střevní mikroflóra ovlivňuje riziko infekcí (klinicky a/nebo mikrobiologicky doloženo).
7. Střevní mikroflóra je ovlivněna antibiotiky jako profylaxe i léčba infekcí.
8. Mikrobiota DLBCL závisí na příjmu potravy, kouření, fyzické aktivitě a složení těla.
9. Výrazné signatury střevní mikroflóry mohou být spojeny s molekulárními podtypy DLBCL (nebo naopak)
10. Mutace JAK2V617F, TET2, DNMT3A a ASXL1 ovlivňují signaturu střevní mikroflóry a jsou spojeny s komorbiditou a výsledkem v DLBCL
11. Mezi střevní dysbiózou a lymfomem existuje začarovaný kruh, přičemž přeslechy mezi střevní mikroflórou a rakovinou se projevují jako změny v profilu cytokinů, chemokinů a růstových faktorů; imunitní odpověď odrážená imunofenotypovými profily mononukleárních buněk periferní krve; a charakteristické metabolitové podpisy v krvi.