Charakterystyka i wpływ kliniczny mikroflory jelitowej w chłoniaku

Mikrobiota odnosi się do ekologicznej społeczności komensalnych, symbiotycznych i patogennych mikroorganizmów, które kolonizują różne przedziały w organizmie człowieka, w tym przewód pokarmowy. Wykazano, że kompozycja odgrywa ważną rolę w patofizjologii wielu chorób, a także wpływa na procesy homeostatyczne gospodarza, takie jak regulacja procesów metabolicznych, obrona przed patogenami, rozwój układu odpornościowego, regulacja odpowiedzi immunologicznej i stanu zapalnego. Jednakże związek między mikroflorą jelitową a chłoniakiem pozostaje słabo poznany.

Celem tego badania jest ocena składu i różnorodności mikrobiomu jelitowego w dużej, jednorodnej grupie pacjentów z nowo zdiagnozowanym i nieleczonym chłoniakiem rozlanym z dużych komórek B (DLBCL). Celem badaczy jest określenie związku między mikroflorą jelitową, podtypami klinicznymi i molekularnymi DLBCL a przebiegiem choroby. Badany jest także związek między odżywianiem, aktywnością fizyczną, składem ciała, toksycznością terapii przeciwnowotworowej, infekcjami, stosowaniem antybiotyków, chorobami współistniejącymi i genetyką nowotworu a składem i różnorodnością mikroflory jelitowej.

Projekt realizowany jest we współpracy wydziałów klinicznych, instytutów i laboratoriów specjalizujących się w mikrobiologii, hematologii, patologii, żywieniu, biologii molekularnej, immunologii i bioinformatyce.

Hipotezy badania to:

1. Pacjenci z DLBCL mają wyraźne wyjściowe sygnatury mikroflory, które różnią się od zdrowych osób.
2. Podczas leczenia (immunochemioterapii) DLBCL i po jego zakończeniu można zidentyfikować istotne zmiany w składzie i różnorodności mikroflory.
3. Na odpowiedź i wynik leczenia chłoniaka wpływa skład i różnorodność mikroflory DLBCL.
4. Mikroflora jelitowa zmienia się w mikroflorę bardziej przypominającą mikroflorę zdrowych osób z grupy kontrolnej u pacjentów, u których po roku od zakończenia leczenia chłoniak pozostaje w remisji.
5. Odrębne profile mikroflory DLBCL są powiązane z toksycznością związaną z leczeniem.
6. Mikroflora jelitowa wpływa na ryzyko infekcji (udokumentowane klinicznie i/lub mikrobiologicznie).
7. Antybiotyki wpływają na mikroflorę jelitową zarówno w ramach profilaktyki, jak i leczenia infekcji.
8. Mikrobiota DLBCL zależy od sposobu żywienia, palenia tytoniu, aktywności fizycznej i składu ciała.
9. Wyraźne sygnatury mikroflory jelitowej można powiązać z podtypami molekularnymi DLBCL (lub odwrotnie)
10. Mutacje JAK2V617F, TET2, DNMT3A i ASXL1 wpływają na sygnaturę mikroflory jelitowej i są powiązane z chorobami współistniejącymi i wynikami w DLBCL
11. Istnieje błędne koło pomiędzy dysbiozą jelitową a chłoniakiem, w którym powiązanie między mikroflorą jelitową a nowotworem objawia się zmianami w profilu cytokin, chemokin i czynników wzrostu; odpowiedź immunologiczna odzwierciedlona w profilach immunofenotypowych komórek jednojądrzastych krwi obwodowej; i charakterystyczne sygnatury metabolitów we krwi.