Karakterisering og klinisk effekt av tarmmikrobiotaen i lymfom

Mikrobiota refererer til et økologisk samfunn av kommensale, symbiotiske og patogene mikroorganismer som koloniserer de forskjellige avdelingene i menneskekroppen, inkludert mage-tarmkanalen. Sammensetningen har vist seg å spille en viktig rolle i patofysiologien til mange sykdommer, samt påvirke vertens homeostatiske prosesser som regulering av metabolske prosesser, forsvar mot patogener, immunsystemutvikling, regulering av immunrespons og betennelse. Imidlertid er sammenhengen mellom tarmmikrobiota og lymfom fortsatt dårlig forstått.

Formålet med denne studien er å evaluere sammensetningen og mangfoldet av tarmmikrobiomet i en stor homogen gruppe pasienter med nylig diagnostisert og behandlingsnaive diffust stort B-cellet lymfom (DLBCL). Etterforskerne tar sikte på å identifisere forholdet mellom tarmmikrobiota, kliniske og molekylære subtyper av DLBCL og utfallet av sykdommen. Sammensetningen mellom ernæring, fysisk aktivitet, kroppssammensetning, toksisitet til antineoplastisk terapi, infeksjoner, bruk av antibiotika, komorbiditet og tumorgenetikk versus sammensetning og mangfold av tarmmikrobiota er også utforsket.

Prosjektet gjennomføres i samarbeid mellom kliniske avdelinger, institutter og laboratorier med kompetanse innen mikrobiologi, hematologi, patologi, ernæring, molekylærbiologi, immunologi og bioinformatikk.

Hypotesene til studien er:

1. Pasienter med DLBCL har distinkte baseline mikrobiotasignaturer som skiller seg fra friske personer.
2. Betydelige endringer i mikrobiotasammensetningen og mangfoldet kan identifiseres under og etter behandling (immunkjemoterapi) av DLBCL.
3. Lymfomrespons og utfall påvirkes av sammensetningen og mangfoldet av DLBCL-mikrobiotaen.
4. Tarmmikrobiotaen endres mot en mikrobiota mer lik mikrobiotaen til friske kontroller hos pasienter som forblir i lymfomremisjon ett år etter fullført behandling.
5. Distinkte DLBCL-mikrobiotaprofiler er assosiert med behandlingsrelatert toksisitet.
6. Tarmmikrobiotaen påvirker risikoen for infeksjoner (klinisk og/eller mikrobiologisk dokumentert).
7. Tarmmikrobiotaen påvirkes ved bruk av antibiotika både som profylakse og behandling av infeksjoner.
8. DLBCL-mikrobiotaen avhenger av kostinntaket, røyking, fysisk aktivitet og kroppssammensetningen.
9. Distinkte intestinale mikrobiota-signaturer kan assosieres med molekylære undertyper av DLBCL (eller omvendt)
10. JAK2V617F, TET2, DNMT3A og ASXL1 mutasjonene påvirker tarmmikrobiotasignaturen og er assosiert med komorbiditet og utfall i DLBCL
11. Det er en ond sirkel mellom intestinal dysbiose og lymfom, hvor krysstalen mellom tarmmikrobiotaen og kreften uttrykkes som endringer i profilen til cytokiner, kjemokiner og vekstfaktorer; en immunrespons reflektert av immunfenotypiske profiler av mononukleære celler fra perifert blod; og karakteristiske metabolittsignaturer i blodet.