Karakterisering och klinisk effekt av tarmmikrobiotan vid lymfom

Mikrobiota hänvisar till en ekologisk gemenskap av kommensala, symbiotiska och patogena mikroorganismer som koloniserar de olika avdelningarna i människokroppen inklusive mag-tarmkanalen. Kompositionen har visat sig spela en viktig roll i patofysiologin för många sjukdomar samt påverka värdhomeostatiska processer såsom reglering av metaboliska processer, försvar mot patogener, immunsystemutveckling, reglering av immunsvar och inflammation. Men sambandet mellan tarmmikrobiotan och lymfom är fortfarande dåligt förstått.

Syftet med denna studie är att utvärdera sammansättningen och mångfalden av tarmmikrobiomet i en stor homogen grupp patienter med nydiagnostiserade och behandlingsnaiva Diffuse Large B-cell Lymfom (DLBCL). Utredarna syftar till att identifiera sambandet mellan tarmmikrobiotan, kliniska och molekylära subtyper av DLBCL och sjukdomens utfall. Sambandet mellan näring, fysisk aktivitet, kroppssammansättning, toxicitet för antineoplastisk behandling, infektioner, användning av antibiotika, samsjuklighet och tumörgenetik kontra tarmmikrobiotans sammansättning och mångfald undersöks också.

Projektet genomförs i samarbete mellan kliniska avdelningar, institut och laboratorier med expertis inom mikrobiologi, hematologi, patologi, nutrition, molekylärbiologi, immunologi och bioinformatik.

Hypoteserna för studien är:

1. Patienter med DLBCL har distinkta mikrobiotasignaturer vid baslinjen som skiljer sig från friska försökspersoner.
2. Signifikanta förändringar i mikrobiotans sammansättning och mångfald kan identifieras under och efter behandling (immunokemoterapi) av DLBCL.
3. Lymfomsvar och resultat påverkas av DLBCL-mikrobiotans sammansättning och mångfald.
4. Den intestinala mikrobiotan förändras mot en mikrobiota som mer liknar mikrobiotan hos friska kontroller hos patienter som förblir i lymfomremission ett år efter avslutad terapi.
5. Distinkta DLBCL-mikrobiotaprofiler är associerade med behandlingsrelaterad toxicitet.
6. Tarmmikrobiotan påverkar risken för infektioner (kliniskt och/eller mikrobiologiskt dokumenterat).
7. Tarmmikrobiotan påverkas med antibiotika både som profylax och behandling av infektioner.
8. DLBCL-mikrobiotan beror på kostintaget, rökning, fysisk aktivitet och kroppssammansättningen.
9. Distinkta tarmmikrobiotasignaturer kan associeras med molekylära subtyper av DLBCL (eller vice versa)
10. JAK2V617F-, TET2-, DNMT3A- och ASXL1-mutationerna påverkar tarmens mikrobiotasignatur och är associerade med samsjuklighet och utfall i DLBCL
11. Det finns en ond cirkel mellan intestinal dysbios och lymfom där överhörningen mellan tarmmikrobiotan och cancern uttrycks som förändringar i profilen av cytokiner, kemokiner och tillväxtfaktorer; ett immunsvar reflekterat av immunfenotypiska profiler av perifera mononukleära blodceller; och karakteristiska metabolitsignaturer i blodet.