Suoliston mikrobiotan koostumuksen ja kasvainvasteen välinen yhteys paikallisesti edenneessä peräsuolen syövässä (Neo-Flo-Rect)

Päätavoite: Päätavoitteena on testata yhteyttä seuraavien välillä:

• toisaalta ulostenäytteestä arvioitu suoliston mikrobisto ennen potilaiden neoadjuvanttihoidon aloittamista (T0) ja toisaalta
• täydellinen histologinen vaste, joka on arvioitu kirurgisesta resektionäytteestä potilailla, joilla on histologisesti todistettuja vaiheen II ja III peräsuolen kasvaimia, joita hoidettiin neoadjuvanttikemoterapialla ja jota seurasi tai ei ollut Cap50-sädekemoterapiaa ennen leikkausta.

Ensisijainen päätetapahtuma: Ensisijainen päätetapahtuma on täydellinen histologinen vaste, joka arvioidaan kirurgisesta näytteestä neoadjuvanttihoidon jälkeen. Tämä arviointi suoritetaan tavanomaisten standardien mukaisesti ja sokeutuu kaikkiin suoliston mikrobiotoja ja lyhytketjuisia rasvahappoja ja tryptofaanijohdannaisia ​​koskeviin tietoihin.

Toissijaiset tavoitteet:

• Tutkia suoliston mikrobiotan koostumuksen profiilia ja lyhytketjuisten rasvahappojen pitoisuutta kahdessa potilasryhmässä (täydellinen histologinen vaste tai ei), arvioituna ennen hoitoa (T0).
• Arvioida muutoksia suolistoflooran koostumuksessa ja lyhytketjuisten rasvahappojen pitoisuudessa induktiokemoterapian (T1) jälkeen, sen jälkeen tarvittaessa ennen leikkausta radiokemoterapiaa (T2) vertaamalla ennen leikkausta otettua näytettä alkunäytteeseen (T0) .
• Arvioi yhteys näiden taksonomisten ja metabolisten muutosten (T1-T0, T2-T0) ja toisaalta histologisen vasteen välillä.
• Arvioida suoliston mikrobiotan koostumuksen profiilin ja lyhytketjuisten rasvahappojen sekä kalprotektiinin (luotettava ja herkkä suoliston tulehduksen ei-invasiivinen merkkiaine) välistä yhteyttä, joka on arvioitu ennen minkäänlaista hoitoa (T0) toisaalta, ja toksisuuden esiintyminen hoidon aikana, erityisesti ruoansulatuskanavan myrkyllisyys.

Toissijaiset päätepisteet:

• Erilaisten bakteerien tai bakteeriperheiden prosenttiosuus (ylimäärä), kuten Ruminococcaceae, suolistofloorassa ja lyhytketjuisten rasvahappojen annostus;
• Harvinaisuuskäyrät;
• Taksonomiset indikaattorit;
• Mikrobiootan koostumuksen alfa- ja beeta-diversiteettiindeksit;
• Kalprotektiinin määritys ELISA:lla ulostenäytteestä.
• Toksisuus on arvioitu keräämällä haitallisia tapahtumia FOLFIRINOX-hoidon aikana ja joillekin potilaille sädekemoterapian aikana, luokiteltu NCI CTCAE v5 -asteikon mukaan ja luokiteltu MEDDRA-sanakirjan mukaan;