Związek między składem mikroflory jelitowej a reakcją nowotworu na miejscowo zaawansowanego raka odbytnicy (Neo-Flo-Rect)

Cel główny: Głównym celem jest przetestowanie powiązania pomiędzy:

• z jednej strony mikroflora jelitowa oceniona na podstawie próbki kału przed rozpoczęciem leczenia neoadjuwantowego pacjentów (T0), oraz
• całkowita odpowiedź histologiczna oceniana na wycinku po resekcji chirurgicznej u pacjentów z histologicznie potwierdzonym guzem odbytnicy w stopniu II i III, leczonych chemioterapią neoadjuwantową, po której przed zabiegiem zastosowano radiochemioterapię Cap50 lub nie.

Pierwszorzędowy punkt końcowy: Pierwszorzędowym punktem końcowym będzie całkowita odpowiedź histologiczna oceniana na materiale chirurgicznym po schemacie leczenia neoadjuwantowego. Ocena ta zostanie przeprowadzona zgodnie ze zwykłymi standardami i nie będzie uwzględniała żadnych informacji na temat mikroflory jelitowej oraz zawartości krótkołańcuchowych kwasów tłuszczowych i pochodnych tryptofanu.

Cele drugorzędne:

• Zbadanie profilu składu mikroflory jelitowej i zawartości krótkołańcuchowych kwasów tłuszczowych w dwóch grupach pacjentów (pełna odpowiedź histologiczna lub jej brak), ocenianych przed jakimkolwiek leczeniem (T0).
• Ocena zmian w składzie flory jelitowej i zawartości krótkołańcuchowych kwasów tłuszczowych po leczeniu chemioterapią indukcyjną (T1), a następnie radiochemioterapią przedoperacyjną (T2), jeśli ma to zastosowanie, poprzez porównanie próbki przedoperacyjnej z próbką wyjściową (T0) .
• Ocenić związek pomiędzy tymi zmianami taksonomicznymi i metabolicznymi (T1-T0, T2-T0) z jednej strony, a odpowiedzią histologiczną, z drugiej.
• Ocena związku profilu składu mikrobioty jelitowej z zawartością krótkołańcuchowych kwasów tłuszczowych i kalprotektyny (pewnego i czułego nieinwazyjnego markera stanu zapalnego jelit) oznaczanej przed każdym leczeniem (T0) na z jednej strony oraz występowanie toksyczności podczas leczenia, w szczególności toksyczności trawiennej.

Drugorzędowe punkty końcowe:

• Procent różnych bakterii lub rodzin bakterii (obfitość), takich jak Ruminococcaceae, we florze jelitowej i dawkowanie krótkołańcuchowych kwasów tłuszczowych;
• Krzywe rozrzedzenia;
• Wskaźniki taksonomiczne;
• Wskaźniki różnorodności alfa i beta składu mikroflory;
• Oznaczanie kalprotektyny metodą ELISA w próbce kału.
• Toksyczność oceniana poprzez zbieranie zdarzeń niepożądanych podczas leczenia FOLFIRINOX i u niektórych pacjentów podczas radiochemioterapii, oceniana według skali NCI CTCAE v5 i klasyfikowana według słownika MEDDRA;