Assosiasjon mellom sammensetningen av tarmmikrobiota og tumorrespons i lokalt avansert rektalkreft (Neo-Flo-Rect)

Hovedmål: Hovedmålet er å teste sammenhengen mellom:

• tarmmikrobiotaen vurdert fra en avføringsprøve før oppstart av neoadjuvant behandling av pasienter (T0) på den ene siden, og
• fullstendig histologisk respons vurdert på den kirurgiske reseksjonsprøven hos pasienter med histologisk påvist stadium II og III rektale svulster behandlet med neo-adjuvant kjemoterapi etterfulgt eller ikke av Cap50 radiokjemoterapi før operasjon.

Primært endepunkt: Det primære endepunktet vil være fullstendig histologisk respons vurdert på den kirurgiske prøven etter neoadjuvant terapiregime. Denne vurderingen vil bli utført i henhold til vanlige standarder og blindet for all informasjon om tarmmikrobiota og om innholdet av kortkjedede fettsyrer og tryptofanderivater.

Sekundære mål:

• For å utforske profilen til tarmmikrobiotasammensetning og kortkjedet fettsyreinnhold i de to gruppene av pasienter (fullstendig histologisk respons eller ikke), vurdert før enhver behandling (T0).
• For å vurdere endringene i sammensetningen av tarmfloraen og innholdet av kortkjedede fettsyrer etter behandling med induksjonskjemoterapi (T1), deretter preoperativ radiokjemoterapi (T2) hvis aktuelt, ved sammenligning av den preoperative prøven med den initiale prøven (T0) .
• Vurder sammenhengen mellom disse taksonomiske og metabolske endringene (T1-T0, T2-T0) på den ene siden og den histologiske responsen på den andre.
• For å evaluere sammenhengen mellom profilen til sammensetningen av tarmmikrobiotaen og innholdet av kortkjedede fettsyrer, samt calprotectin (en pålitelig og sensitiv ikke-invasiv markør for tarmbetennelse) vurdert før enhver behandling (T0) på den ene hånden, og forekomsten av toksisitet under behandling, spesielt fordøyelsestoksisitet.

Sekundære endepunkter:

• Prosentandel av forskjellige bakterier eller familier av bakterier (overflod) som Ruminococcaceae i tarmfloraen og dosering av kortkjedede fettsyrer;
• sjeldne reaksjonskurver;
• Taksonomiske indikatorer;
• Alfa- og beta-diversitetsindekser for mikrobiotasammensetning;
• Bestemmelse av kalprotektin ved ELISA på avføringsprøve.
• Toksisitet vurdert ved å samle bivirkninger under behandling med FOLFIRINOX og for noen pasienter under radiokjemoterapi, gradert i henhold til NCI CTCAE v5-skalaen og klassifisert i henhold til MEDDRA-ordboken;