Asociace mezi složením střevní mikrobioty a odpovědí nádoru u lokálně pokročilého karcinomu rekta (Neo-Flo-Rect)

Hlavní cíl: Hlavním cílem je otestovat spojení mezi:

• střevní mikroflóra hodnocená ze vzorku stolice před zahájením neoadjuvantní léčby pacientů (T0) na jedné straně a
• kompletní histologická odpověď hodnocená na chirurgickém resekčním vzorku u pacientů s histologicky prokázanými rektálními tumory stadia II a III léčených neoadjuvantní chemoterapií následovanou nebo nenásledovanou radiochemoterapií Cap50 před operací.

Primární cílový ukazatel: Primárním cílovým parametrem bude kompletní histologická odpověď hodnocená na chirurgickém vzorku po režimu neoadjuvantní terapie. Toto hodnocení bude prováděno podle obvyklých standardů a bez ohledu na jakékoli informace o střevní mikrobiotě a obsahu mastných kyselin s krátkým řetězcem a derivátů tryptofanu.

Sekundární cíle:

• Prozkoumat profil složení střevní mikroflóry a obsah mastných kyselin s krátkým řetězcem u dvou skupin pacientů (kompletní histologická odpověď nebo ne), hodnocené před jakoukoli léčbou (T0).
• Posoudit změny ve složení střevní flóry a obsahu mastných kyselin s krátkým řetězcem po léčbě indukční chemoterapií (T1), případně předoperační radiochemoterapií (T2), porovnáním předoperačního vzorku s výchozím vzorkem (T0) .
• Posuďte souvislost mezi těmito taxonomickými a metabolickými změnami (T1-T0, T2-T0) na jedné straně a histologickou odpovědí na straně druhé.
• Vyhodnotit souvislost mezi profilem složení střevní mikroflóry a obsahem mastných kyselin s krátkým řetězcem a také kalprotektinu (spolehlivý a citlivý neinvazivní marker střevního zánětu) hodnoceného před jakoukoliv léčbou (T0) na na jedné straně a výskyt toxicity během léčby, zejména zažívací toxicity.

Sekundární koncové body:

• Procento různých bakterií nebo rodin bakterií (početnost), jako je Ruminococcaceae, ve střevní flóře a dávkování mastných kyselin s krátkým řetězcem;
• Vzácné křivky;
• Taxonomické ukazatele;
• Alfa a beta indexy diverzity složení mikrobioty;
• Stanovení kalprotektinu pomocí ELISA na vzorku stolice.
• Toxicita hodnocená sběrem nežádoucích účinků během léčby přípravkem FOLFIRINOX a u některých pacientů během radiochemoterapie, hodnocená podle stupnice NCI CTCAE v5 a klasifikovaná podle slovníku MEDDRA;