Sambandet mellan sammansättningen av tarmmikrobiotan och tumörrespons vid lokalt avancerad rektalcancer (Neo-Flo-Rect)

Huvudmål: Huvudsyftet är att testa sambandet mellan:

• tarmmikrobiotan bedömd från ett avföringsprov före starten av neoadjuvant behandling av patienter (T0) å ena sidan, och
• fullständigt histologiskt svar bedömt på det kirurgiska resektionsprovet hos patienter med histologiskt bevisade rektaltumörer i stadium II och III behandlade med neo-adjuvant kemoterapi följt eller inte följt av Cap50 radiokemoterapi före operation.

Primärt effektmått: Det primära effektmåttet kommer att vara fullständigt histologiskt svar bedömt på det kirurgiska provet efter den neoadjuvanta terapiregimen. Denna bedömning kommer att utföras enligt de vanliga standarderna och förblindas för all information om tarmmikrobiotan och om innehållet av kortkedjiga fettsyror och tryptofanderivat.

Sekundära mål:

• Att utforska profilen för tarmmikrobiotans sammansättning och kortkedjiga fettsyror i de två grupperna av patienter (fullständig histologisk respons eller inte), bedömd före någon behandling (T0).
• För att bedöma förändringarna i tarmflorans sammansättning och innehållet av kortkedjiga fettsyror efter behandling med induktionskemoterapi (T1), därefter preoperativ radiokemoterapi (T2) om tillämpligt, genom jämförelse av det preoperativa provet med det initiala provet (T0) .
• Bedöm sambandet mellan dessa taxonomiska och metabola förändringar (T1-T0, T2-T0) å ena sidan och det histologiska svaret å andra sidan.
• För att utvärdera sambandet mellan profilen av sammansättningen av tarmmikrobiotan och innehållet av kortkedjiga fettsyror, samt calprotectin (en pålitlig och känslig icke-invasiv markör för tarminflammation) bedömd före någon behandling (T0) på ena sidan, och förekomsten av toxicitet under behandling, i synnerhet matsmältningstoxicitet.

Sekundära slutpunkter:

• Andel av olika bakterier eller bakteriefamiljer (överflöd) såsom Ruminococcaceae i tarmfloran och dosering av kortkedjiga fettsyror;
• Sällsynthetskurvor;
• Taxonomiska indikatorer;
• Alfa- och betadiversitetsindex för mikrobiotasammansättning;
• Bestämning av kalprotektin med ELISA på avföringsprov.
• Toxicitet bedömd genom att samla in biverkningar under behandling med FOLFIRINOX och för vissa patienter under radiokemoterapi, graderad enligt NCI CTCAE v5-skalan och klassificerad enligt MEDDRA-ordboken;