Asociación entre la composición de la microbiota intestinal y la respuesta tumoral en el cáncer de recto localmente avanzado (Neo-Flo-Rect)

Objetivo principal: El objetivo principal es probar la asociación entre:

• la microbiota intestinal evaluada a partir de una muestra de heces antes del inicio del tratamiento neoadyuvante de los pacientes (T0), por un lado, y
• respuesta histológica completa evaluada en la muestra de resección quirúrgica en pacientes con tumores rectales en estadio II y III histológicamente probados tratados con quimioterapia neoadyuvante seguida o no de radioquimioterapia Cap50 antes de la cirugía.

Criterio de valoración principal: el criterio de valoración principal será la respuesta histológica completa evaluada en la muestra quirúrgica después del régimen de terapia neoadyuvante. Esta evaluación se realizará según los estándares habituales y ciega a cualquier información sobre la microbiota intestinal y sobre el contenido de ácidos grasos de cadena corta y derivados del triptófano.

Objetivos secundarios:

• Explorar el perfil de composición de la microbiota intestinal y contenido de ácidos grasos de cadena corta en los dos grupos de pacientes (respuesta histológica completa o no), evaluados antes de cualquier tratamiento (T0).
• Evaluar los cambios en la composición de la flora intestinal y el contenido de ácidos grasos de cadena corta después del tratamiento con quimioterapia de inducción (T1), luego radioquimioterapia preoperatoria (T2), si corresponde, mediante comparación de la muestra preoperatoria con la muestra inicial (T0) .
• Valorar la asociación entre estos cambios taxonómicos y metabólicos (T1-T0, T2-T0) por un lado y la respuesta histológica por otro.
• Evaluar la asociación entre el perfil de la composición de la microbiota intestinal y el contenido de ácidos grasos de cadena corta, así como de calprotectina (un marcador no invasivo fiable y sensible de inflamación intestinal) evaluado antes de cualquier tratamiento (T0) en el por un lado, y la aparición de toxicidad durante el tratamiento, en particular toxicidad digestiva.

Criterios de valoración secundarios:

• Porcentaje de diferentes bacterias o familias de bacterias (abundancia) como Ruminococcaceae en la flora intestinal y dosificación de ácidos grasos de cadena corta;
• Curvas de rarefacción;
• Indicadores taxonómicos;
• Índices de diversidad alfa y beta de la composición de la microbiota;
• Determinación de calprotectina mediante ELISA en muestra de heces.
• Toxicidad evaluada mediante la recopilación de eventos adversos durante el tratamiento con FOLFIRINOX y para algunos pacientes durante la radioquimioterapia, clasificada según la escala NCI CTCAE v5 y clasificada según el diccionario MEDDRA;