Forbindelse mellem sammensætningen af ​​tarmmikrobiota og tumorrespons i lokalt avanceret rektalcancer (Neo-Flo-Rect)

Hovedformål: Hovedformålet er at teste sammenhængen mellem:

• tarmmikrobiotaen vurderet fra en afføringsprøve før starten af ​​neoadjuverende behandling af patienter (T0) på den ene side, og
• komplet histologisk respons vurderet på den kirurgiske resektionsprøve hos patienter med histologisk påviste stadium II og III rektale tumorer behandlet med neo-adjuverende kemoterapi efterfulgt eller ej af Cap50 radiokemoterapi før operation.

Primært endepunkt: Det primære endepunkt vil være fuldstændig histologisk respons vurderet på den kirurgiske prøve efter neoadjuverende behandlingsregime. Denne vurdering vil blive udført i henhold til de sædvanlige standarder og blindet for enhver information om tarmmikrobiotaen og om indholdet af kortkædede fedtsyrer og tryptofanderivater.

Sekundære mål:

• At udforske profilen af ​​tarmmikrobiotasammensætning og kortkædet fedtsyreindhold i de to grupper af patienter (komplet histologisk respons eller ej), vurderet før enhver behandling (T0).
• For at vurdere ændringerne i sammensætningen af ​​tarmfloraen og indholdet af kortkædede fedtsyrer efter behandling med induktionskemoterapi (T1), derefter præoperativ radiokemoterapi (T2), hvis relevant, ved sammenligning af den præoperative prøve med den initiale prøve (T0) .
• Vurder sammenhængen mellem disse taksonomiske og metaboliske ændringer (T1-T0, T2-T0) på den ene side og den histologiske respons på den anden.
• At evaluere sammenhængen mellem profilen af ​​sammensætningen af ​​tarmmikrobiotaen og indholdet af kortkædede fedtsyrer samt calprotectin (en pålidelig og følsom ikke-invasiv markør for tarmbetændelse) vurderet før enhver behandling (T0) på den ene side, og forekomsten af ​​toksicitet under behandling, især fordøjelsestoksicitet.

Sekundære endepunkter:

• Procentdel af forskellige bakterier eller familier af bakterier (overflod) såsom Ruminococcaceae i tarmfloraen og dosering af kortkædede fedtsyrer;
• Sjældenhedskurver;
• Taksonomiske indikatorer;
• Alfa- og beta-diversitetsindekser for mikrobiotasammensætning;
• Bestemmelse af calprotectin ved ELISA på afføringsprøve.
• Toksicitet vurderet ved at indsamle bivirkninger under behandling med FOLFIRINOX og for nogle patienter under radiokemoterapi, klassificeret i henhold til NCI CTCAE v5-skalaen og klassificeret i henhold til MEDDRA-ordbogen;