Harvinaisiin sairauksiin sovellettu veripiste- ja virtsan metabolinen seulonta (BUSARD)
Tämän tutkimuksen ensisijainen tavoite on perustaa biopankki kuivatuista veripisteistä ja virtsasta suuresta kontrollikohortista ja kerätä mahdollisimman suuria kohortteja potilaista, joilla on tai epäillään sairastavan harvinaisia sairauksia (pääasiassa perinnöllisiä aineenvaihduntasairauksia) tai autismia. spektrin häiriöt.
Metabominen tietokanta, jossa käytetään korkearesoluutioista massaspektrometriä (eli "laitetta"), luodaan ja sairauksien spesifiset biomarkkerit vahvistetaan tai paljastetaan. Perimmäisenä tavoitteena on helpottaa ja parantaa näiden sairauksien sairastuneiden potilaiden diagnoosia ja seulontaa, mutta myös parantaa tietämystä valittujen patologioiden aikana mukana olevista biokemiallisista mekanismeista.
Korkean resoluution massaspektrometria mahdollistaa tuhansien metaboliittien mittaamisen yhdellä analyysillä. Nykyisissä perinnöllisten aineenvaihduntasairauksien diagnosointiin käytetyissä biokemiallisissa testeissä käytetään yhdessä analyysissä vain enintään muutaman kymmenen biomarkkerin yhdistelmää.
Tavoitteet Selvittää uusia biomarkkereita diagnoosia varten (+/- tutkia muuttuneita reittejä…) Paljasta ja/tai validoi vastasyntyneiden seulontabiomarkkereita todettujen potilaiden säilyneen vastasyntyneen DBS:n retrospektiivisen analyysin avulla (hyödyllinen ensimmäisen tai toisen tason biokemialliseen NBS-testaukseen!) LC-validointi MS qTOF metabolomiikkaseulontaan ensimmäisen linjan diagnostisena testinä (tuhansia metaboliitteja) käyttämällä diagnostisia algoritmeja (muokattuja z-pisteitä) ja jatkuvaa optimointia lisäämällä uusia tapauksia ja uusia kontrolleja tietokantaan Virtsan ja DBS:n biopankin luominen harvinaisista sairauksista (IEM) ) ja suuresta vertailujoukosta, joka on hyödyllinen muihin tutkimussovelluksiin
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
KLIINISEN TUTKIMUKSEN SUUNNITTELU
Interventionaalinen monikeskustutkimus, jossa käytettiin korkearesoluutioista massaspektrometriaa, jota sovellettiin kuivuneisiin veripisteisiin ja virtsanäytteisiin, tuottaen metabolomista tietoa.
Selvitys alkaa biopankin perustamisella ryhmäkuvauksen mukaisesti.
Näytteet (kuivatut veripisteet (DBS) ja virtsanäytteet kustakin koehenkilöstä) kerätään vastaavissa tutkijakeskuksissa, ennen kuin ne lähetetään Cliniques universitaires Saint Lucin (CUSL) keskusbiopankkiin. DBS:n annetaan säilyttää huoneenlämmössä (kuivassa ja valolta suojattuna), jos se lähetetään CUSL:lle 2 viikon sisällä näytteenoton jälkeen.
Näytteenottomenettely, joka suoritetaan kussakin yhteistutkintakeskuksessa, sisältää seuraavassa järjestyksessä:
- Tiedot tutkimuksesta (tutkijan tai hänen edustajansa selitykset)
- Tietoon perustuvien suostumuslomakkeiden kerääminen osallistumista varten, mukaan lukien osallistuminen/poistuminen
- Sopimus useasta näytteenotosta toisessa ajankohtana (vain ryhmät II ja III)
- Luottamuksellinen lääketieteellinen kysely/CRF kerätään (suunniteltu lomake ryhmän 1 kontrollin koehenkilöille)
- DBS ja virtsan näytteenotto. Aiheet, joille on saatavilla vain vastasyntyneiden DBS, hyväksytään myös.
Koehenkilöiden henkilöllisyys ja osallistuminen kokeeseen pysyvät tiukasti luottamuksellisina 27. huhtikuuta 2016 annetun Euroopan yleisen tietosuoja-asetuksen (sovellettu 25. toukokuuta 2018 alkaen), Belgian 30. heinäkuuta 2018 annetun lain mukaisesti. yksityisyyttä henkilötietojen käsittelyssä sekä 22. elokuuta 2002 annettu laki potilaiden oikeuksista. Henkilötiedot koodataan. Koehenkilöitä ei tunnisteta nimellä tai millään muulla tunnistettavissa olevalla tavalla missään kokeeseen liittyvissä tietueissa, tuloksissa tai julkaisuissa.
Tutkimuksen tutkijat tunnistavat mahdolliset tutkittavat, jotka näyttävät täyttävän kelpoisuusvaatimukset.
Lääkäri tai edustaja selittää tutkimuksen. Sitten, jos tutkittava ja/tai vanhemmat sopivat, tietoinen suostumus allekirjoitetaan ennen näytteenottoa.
Yhdelle tietoon perustuvalle suostumuslomakkeelle (ICF) voidaan ottaa useita näytteitä eri ajankohtina.
Osatutkijakeskukset säilyttävät väliaikaisesti pseudonyymejä näytteitä ja lähettävät määräajoin kerätyt näytteet (jäädytettyinä) CUSL-laboratorioon (biopankkia varten). Näytteet säilytetään -80°C:ssa CUSL-biopankissa ennen ja jälkeen analyysin. Vastaanotto- ja siirtoaika -80°C:ssa CUSL:ssa tallennetaan REDCAP:iin.
Myöhemmin luodaan datasarjat, jotka edustavat DBS:n metabolomia ja virtsanäytteitä nestekromatografialla yhdistettynä korkearesoluutioiseen massaspektrometriaan (LC-MS-q-TOF).
LC-MS-q-TOF:n metabolomiikka-analyysi käyttää Watersin SYNAPT-XS-laitetta. Useita sarakkeita käytetään negatiivisissa ja positiivisissa sähkösumutusmuodoissa, mikä mahdollistaa toisiaan täydentävien metabolomien tietokokonaisuuksien luomisen, jotka sisältävät useita tuhansia ominaisuuksia, jotka vaihtelevat tarkan massan (m/z) (mukaan lukien spektrit energian törmäyksen jälkeen) ja retentioajan mittausten mukaan. Laadunvalvonta ja yhdistetyt näytteet analysoidaan jokaisessa ajoerässä metabolomiikkatutkimuksen aikana.
Data-analyysin jälkeen käyttämällä progenesis QI:tä, Unifi- ja R-pakettia metabolomiikkaanalyysiin, tuloksista keskustellaan ja jaetaan tutkijoiden kanssa, ja odotetut tulokset julkaistaan toivottavasti vertaisarvioidussa lehdessä. Tarvittaessa (ts. geneettisesti epätavallisen metabolomisen profiilin tai toissijaisen löydön vahvistamiseksi) ja jos potilaalta on saatu suostumus, täydentävä biokemiallinen testaus alkuperäisillä DBS- ja/tai virtsanäytteillä; ja geneettinen testaus DBS:stä suoritetaan keskustelun ja sopimuksen mukaan tutkimuksen mukana olevien tutkijoiden kanssa. Tarvittaessa (eli jos uutta diagnoosia epäillään biokemiallisesti ja/tai geneettisesti), koehenkilöihin ollaan yhteydessä tutkimuksen avustavien tutkijoiden suostumuksella.
Tätä tutkimusta varten tarvittavat näytteet jaetaan kolmeen pääryhmään, jotka on kuvattu alla. Jokainen on jaettu ikäluokkien mukaan. ensimmäinen ryhmä on tärkein terve ryhmä (ryhmä 1), joka mahdollistaa metabolomisen vertailutietokannan luomisen. Kaksi muuta ryhmää vastaavat potilasryhmiä, joiden patologia on joko vahvistettu (ryhmä 2) tai epäilty (ryhmä 3).
Odotettu yhteensä: 3366 aihetta
- 30 teknistä optimointia varten (DBS:n ja virtsan lisäksi otetaan näytteet kokoveriputkista)
- 1080 ihmiskehon jäännösmateriaalia (RHBM) vastasyntyneiden seulontakeskuksista (ryhmä 1)
- 1056 kontrollia (ryhmä 1)
- 1200 potilasta (ryhmät 2 ja 3)
Vähimmäismäärä näytteitä, jotka tarvitaan referenssivälin luomiseen ei-parametrisella menetelmällä, on 120 näytettä CLSI28-A3C-ohjeiden mukaisesti (katso myös Y Ozarda et al. Clinical Chemistry and Labory Medicine 2018, Vol 57, Issue 1). Siksi tutkijat asettivat tavoitteeksi kerätä vähintään 120 näytettä ikäluokkaa kohden. Näytteet jaetaan tasapuolisesti sukupuolen, vuodenajan ja osallistumiskeskusten (siis maantieteellisen alkuperän) mukaan. Vastasyntyneiden luokkien osalta kontrollinäytteiden tavoitemäärä on suurempi, koska suuren määrän kontrollinäytteitä on helpompi saada käyttämällä vastasyntyneiden seulontakeskuksista peräisin olevia anonymisoituja jäännösnäytteitä. Toisaalta virtsanäytteitä ei kerätä vastasyntyneiden luokkien koehenkilöiltä.
Ryhmään 2 kuuluvat henkilöt, joilla on tunnettu patologia ja joiden diagnoosi vahvistetaan geneettisellä testillä (geenimuunnelmat, joita pidetään patogeenisina tai todennäköisesti patogeenisina American College of Human Geneticsin luokituksen mukaan) tai tyypilliseen kliiniseen ominaisuuteen liittyvällä biokemiallisella vertailutestillä. Autismikirjon häiriöissä rekrytoidut potilaat tulee ottaa mukaan Diagnostic and Statistical Manual (DSM) V -luokituksen mukaisesti. Alaryhmät määritellään kuhunkin yksilöön vaikuttavan patologian mukaan (luokittelu sairastuneen geenin, periytymistavan ja mutaation tyypin mukaan); ensisijaisesti kohdepatologiat ovat geneettisiä aineenvaihduntasairauksia, mutta kohteena ovat myös muut harvinaiset sairaudet ja autismikirjon häiriöt.
Ryhmään 3 kuuluvat henkilöt, joilla epäillään harvinaista sairautta kliinisen tiedon perusteella, mutta jota ei ole vahvistettu (mukaan lukien potilaat, joiden geneettiset ja biokemialliset testit ovat vielä kesken tai epäselviä). Jos henkilön tila muuttuu ennen tutkimuksen päättymistä rekrytoivan rinnakkaistutkijan anonyymisti ilmoittaman diagnoosin vahvistamisen jälkeen (tutkimuksen ulkopuolella itsenäisesti saatujen tulosten vuoksi) tai tutkimuksen tuloksista (spesifiset biomarkkerit ja/ tai pisteytyksen ja/tai geneettisen vahvistuksen avulla toisen tason testaus) koehenkilö siirretään sitten vastaavaan ryhmään 2. Nämä potilaat rekrytoidaan kaikkiin osallistuviin keskuksiin.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Vaihe
- Ei sovellettavissa
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Joseph P Dewulf, M.D., Ph.D.
- Puhelinnumero: 02/7646836
- Sähköposti: Etdclin.Busard@saintluc.uclouvain.be
Opiskelupaikat
-
-
-
Brussels, Belgia, B-1020
- Ei vielä rekrytointia
- Hôpital Universitaire des enfants Reine Fabiola (HUDERF-ULB)
-
Päätutkija:
- Lionel Marcélis, MSc, Ph.D.
-
Päätutkija:
- Aurélie Empain, M.D., Ph.D.
-
Alatutkija:
- Corinne De Laet, M.D., Ph.D.
-
Alatutkija:
- Ebru Surgun, M.D.
-
Alatutkija:
- Céline Morelli, M.D.
-
Brussels, Belgia, B-1200
- Rekrytointi
- Cliniques Universitaires Saint Luc
-
Päätutkija:
- Joseph P. Dewulf, M.D., Ph.D.
-
Päätutkija:
- Marie-Cécile Nassogne, M.D., Ph.D.
-
Alatutkija:
- Xavier Stephenne, M.D., Ph.D.
-
Alatutkija:
- Nicole Revencu, M.D., Ph.D.
-
Alatutkija:
- Stéphanie Paquay, M.D.
-
Charleroi, Belgia, B-6041
- Ei vielä rekrytointia
- Institut de Pathologie et de Génétique (IPG)
-
Päätutkija:
- Dominique Roland, M.D.
-
Alatutkija:
- Damien Lederer, M.D., Ph.D.
-
Alatutkija:
- Isabelle Maystadt, M.D., Ph.D.
-
Liège, Belgia, B-4000
- Ei vielä rekrytointia
- CHU Liège
-
Päätutkija:
- François-Guillaume Debray, MD PhD
-
Päätutkija:
- François Boemer, Pharm D PhD
-
Alatutkija:
- Caroline Dadoumont, MD
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Koehenkilöt vastasyntyneistä vanhuksiin, joilla ei oletettavasti ole harvinaista sairautta (ryhmä 1) (Vastasyntyneet: vain jäljellä oleva DBS vastasyntyneiden seulonnasta täysiaikaisista vastasyntyneistä ja negatiivinen virallinen vastasyntyneen seulontatesti, tunnistamattomat näytteet, jotka eivät vaadi ICF:ää, ei virtsanäyte tälle luokalle), TAI
- Potilaat vastasyntyneistä vanhuksiin, joilla on geneettinen aineenvaihduntasairaus (vaatii geneettisen vahvistuksen) tai muu vahvistettu harvinainen sairaus, johon epäillään aineenvaihduntahäiriötä (ryhmä 2), TAI
- Potilaat vastasyntyneistä vanhuksiin, joilla on autismikirjon häiriöt ja jotka on arvioitu DSMV-luokituksen mukaan (ryhmä 2), TAI
- Potilaat, joiden epäillään sairastavan geneettistä aineenvaihduntasairautta tai muuta harvinaista sairautta, johon liittyy mahdollinen aineenvaihduntahäiriö (eli joille geneettiset ja/tai biokemialliset testit eivät ole varmoja tai ovat kesken) (ryhmä 3)
Poissulkemiskriteerit:
- Koehenkilöt tai potilaat, joilta puuttuu analyysiin ja oikeaan alaryhmään jakamiseen tarvittavat tiedot
- Tietoista suostumusta ei ole allekirjoitettu
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Ensisijainen käyttötarkoitus: Diagnostiikka
- Jako: Ei käytössä
- Inventiomalli: Yksittäinen ryhmätehtävä
- Naamiointi: Ei mitään (avoin tarra)
Aseet ja interventiot
Osallistujaryhmä / Arm |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Kokeellinen: Metaboliikan arviointi
DBS:n ja virtsan LC-MS-qTOF-analyysi käyttämällä menetelmien yhdistelmää
|
Aineenvaihduntatutkimus
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Löydä uusia biomarkkereita kuivuneista veripisteistä ja virtsanäytteistä, jotka voivat parantaa harvinaisten sairauksien diagnosointia
Aikaikkuna: 4 Vuotta
|
LC-MS-qTOF-analyysillä saatujen tuhansia biomarkkeriehdokkaita sisältävien aineenvaihduntatietojen vertailu harvinaisten sairauksien kohorttien ja ikäsovitettujen kontrollinäytteiden välillä
|
4 Vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Tutkijat
- Päätutkija: Joseph P Dewulf, M.D., Ph.D., Cliniques universitaires Saint-Luc
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 2023/09AOU/346
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .