Blodfläcks- och urinmetabolomisk screening tillämpas på sällsynta sjukdomar (BUSARD)
Det primära målet med denna studie är att upprätta en biobank av torkade blodfläckar och urin från en stor kontrollkohort och samla in flera så stora kohorter som möjligt av patienter som är drabbade eller misstänks vara drabbade av sällsynta sjukdomar (främst ärftliga metabola sjukdomar) eller av autism spektrumstörningar.
En metabolomisk databas som använder en högupplöst masspektrometer (dvs "Enheten") kommer att genereras och specifika biomarkörer för sjukdomarna kommer att bekräftas eller avslöjas. Det slutliga målet är att underlätta och förbättra diagnostik och screening av patienter som drabbats av dessa störningar, men också att förbättra kunskapen om de biokemiska mekanismer som är involverade under loppet av de utvalda patologierna.
Högupplöst masspektrometri möjliggör mätning av tusentals metaboliter i en enda analys. De nuvarande biokemiska testerna som används för att diagnostisera ärftliga metabola sjukdomar använder endast en kombination av maximalt några dussintals biomarkörer i en analys.
Syfte Nytja upp nya biomarkörer för diagnos (+/- utforska de förändrade vägarna...) Upptäck och/eller validera biomarkörer för screening av nyfödda genom retrospektiv analys av konserverad nyfödd DBS från bekräftade patienter (användbart för biokemiska NBS-test på första eller andra nivån!) Validering av LC- MS qTOF för metabolomikscreening som första linjens diagnostiskt test (tusentals metaboliter) med diagnostiska algoritmer (modifierade z-poäng) & kontinuerlig optimering genom att lägga till nya fall och nya kontroller i databasen Generering av en biobank av urin och DBS från sällsynta sjukdomar (IEMs) ) & från en stor referenspopulation användbar för andra forskningsapplikationer
Studieöversikt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljerad beskrivning
DESIGN AV DEN KLINISKA UNDERSÖKNINGEN
Interventionell multicenterstudie med högupplöst masspektrometri applicerad på torkade blodfläckar och urinprover, vilket genererar metabolomiska data.
Studien inleds med att en biobank upprättas enligt gruppbeskrivning.
Proverna (torkade blodfläckar (DBS) och urinprover för varje försöksperson) kommer att samlas in i respektive co-investigator center, innan de skickas till den centrala biobanken Cliniques universitaires Saint Luc (CUSL). DBS får förvaras i rumstemperatur (torrt och skyddat från ljus) om det skickas till CUSL inom 2 veckor efter provtagning.
Provtagningsproceduren, som sker vid varje samutredningscentrum, kommer att omfatta i följande ordning:
- Information om studien (förklaringar från utredaren eller hans/hennes ombud)
- Insamling av formulär för informerat samtycke för att delta, inklusive att välja in/ut för
- Överenskommelse om flera provtagningar vid en annan tidpunkt (endast för grupp II och III)
- Ett konfidentiellt medicinskt frågeformulär/CRF kommer att samlas in (reducerad form för försökspersoner i grupp 1-kontrollen)
- DBS och urinprovtagning. Ämnen för vilka endast neonatal DBS är tillgänglig kommer också att accepteras.
Försökspersonernas identitet och deltagande i experimentet kommer att förbli strikt konfidentiellt i enlighet med den europeiska allmänna dataskyddsförordningen av den 27 april 2016 (tillämplig sedan den 25 maj 2018), den belgiska lagen av den 30 juli 2018 om skydd av integritet när det gäller behandling av personuppgifter, samt lagen av den 22 augusti 2002 om patienters rättigheter. Personuppgifter kommer att kodas. Ämnen kommer inte att identifieras med namn eller på något annat igenkännbart sätt i någon av de register, resultat eller publikationer som är relaterade till experimentet.
Utredarna av studien kommer att identifiera de potentiella ämnen som verkar uppfylla behörighetskriterierna.
Läkaren eller delegaten kommer att förklara studien. Sedan, om försökspersonen och/eller föräldrarna är överens, kommer det informerade samtycket att undertecknas före varje provtagning.
Flera provtagningar vid olika tidpunkter kommer att tillåtas för ett enda informerat samtycke (ICF).
Medutredarcentrumen kommer tillfälligt att behålla pseudonymiserade prover och kommer regelbundet att skicka de ackumulerade proverna (frysta) till CUSL-laboratoriet (för biobanking). Proverna kommer att förvaras vid -80°C i CUSL biobank före och efter analys. Tidpunkten för mottagning och överföring vid -80°C vid CUSL kommer att registreras i REDCAP.
Senare kommer generering av datauppsättningar representativa för metabolomen i DBS och urinprover genom vätskekromatografi kopplad till högupplöst masspektrometri (LC-MS-q-TOF) analys att utföras.
Den metabolomiska analysen av LC-MS-q-TOF kommer att använda ett SYNAPT-XS-instrument från Waters. Flera kolumner kommer att användas i negativa och positiva elektrospray-insamlingslägen, vilket möjliggör generering av komplementära metabolomiska datamängder som innehåller flera tusentals funktioner som varieras efter exakt massa (m/z) (inklusive spektra efter energikollision) och retentionstidsmätningar. Kvalitetskontroller och poolade prover kommer att analyseras vid varje sats av körning under metabolomikstudien.
Efter dataanalys med progenesis QI, Unifi och R-paket för metabolomikanalys kommer resultaten att diskuteras och delas med medutredarna och de förväntade resultaten kommer förhoppningsvis att publiceras i en peer-reviewed tidskrift. Om nödvändigt (dvs. för att genetiskt bekräfta en ovanlig metabolomisk profil eller ett sekundärt fynd) och om samtycke erhålls från patienten, kompletterande biokemiska tester på initiala DBS- och/eller urinprover; och genetisk testning från DBS kommer att utföras, efter diskussion och överenskommelse med medutredarna av studien. Vid behov (dvs. om en ny diagnos misstänks biokemiskt och/eller genetiskt), kommer försökspersoner att kontaktas efter överenskommelse med medutredarna av studien.
De prover som behövs för denna studie kommer att delas in i tre huvudgrupper som beskrivs nedan, var och en indelad efter ålderskategorier; den första gruppen är den huvudsakliga friska gruppen (Grupp 1) som gör det möjligt att generera en metabolomisk referensdatabas. De två andra grupperna motsvarar grupper av patienter med patologier vars diagnos antingen är bekräftad (Grupp 2) eller misstänkt (Grupp 3).
Totalt förväntat: 3366 ämnen
- 30 för teknisk optimering (utöver DBS och urin kommer helblodsrör att tas)
- 1080 resterande människokroppsmaterial (RHBM) från screeningcenter för nyfödda (grupp 1)
- 1056 kontroller (grupp 1)
- 1200 patienter (grupp 2 och 3)
Det minsta antalet prover som krävs för att generera ett referensintervall med en icke-parametrisk metod är 120 prover enligt CLSI28-A3C riktlinjer (se även Y Ozarda et Al. Clinical Chemistry and laboratory Medicine 2018, Vol 57, Issue 1). Därför satte utredarna ett mål på minst 120 prover insamlade per ålderskategori. Proverna kommer att fördelas rättvist efter kön, säsong och deltagande centra (därmed geografiskt ursprung). För kategorierna för nyfödda kommer målantalet kontrollprov att bli större eftersom det är lättare att få tillgång till ett stort antal kontrollprover med anonymiserade restprover från screeningcenter för nyfödda. Å andra sidan kommer urinprover inte att samlas in för försökspersoner för nyfödda kategorier.
Grupp 2 inkluderar individer med en känd patologi vars diagnos bekräftas av ett genetiskt test (genetisk(a) variant(er) anses vara patogena eller sannolikt patogena enligt American College of Human Genetics klassificering) eller ett biokemiskt referenstest kopplat till en typisk klinisk egenskap. För autismspektrumstörningar bör rekryterade patienter inkluderas enligt klassificeringen Diagnostic and Statistical Manual (DSM) V. Undergrupper definieras enligt patologin som påverkar varje individ (klassificering enligt den drabbade genen, arvssätt och typ av mutation); de primära målpatologier som beaktas är genetiska metabola sjukdomar, men andra sällsynta sjukdomar och autismspektrumstörningar är också målinriktade.
Grupp 3 inkluderar individer för vilka en sällsynt sjukdom misstänks baserat på kliniska data men inte bekräftats (inklusive patienter för vilka de genetiska och biokemiska testerna fortfarande pågår eller är osäkra). Om statusen för en individ ändras före slutet av studien efter bekräftelsen av en diagnos som kommunicerats anonymt av den rekryterande medutredaren (på grund av resultat som erhållits oberoende utanför studien) eller på grund av studiens resultat (specifika biomarkörer och/ eller poängsättning och/eller genetisk bekräftelse med hjälp av testning på andra nivån) kommer försökspersonen sedan att överföras till motsvarande grupp 2. Dessa patienter kommer att rekryteras till alla deltagande centra.
Studietyp
Inskrivning (Beräknad)
Fas
- Inte tillämpbar
Kontakter och platser
Studiekontakt
- Namn: Joseph P Dewulf, M.D., Ph.D.
- Telefonnummer: 02/7646836
- E-post: Etdclin.Busard@saintluc.uclouvain.be
Studieorter
-
-
-
Brussels, Belgien, B-1020
- Har inte rekryterat ännu
- Hôpital Universitaire des enfants Reine Fabiola (HUDERF-ULB)
-
Huvudutredare:
- Lionel Marcélis, MSc, Ph.D.
-
Huvudutredare:
- Aurélie Empain, M.D., Ph.D.
-
Underutredare:
- Corinne De Laet, M.D., Ph.D.
-
Underutredare:
- Ebru Surgun, M.D.
-
Underutredare:
- Céline Morelli, M.D.
-
Brussels, Belgien, B-1200
- Rekrytering
- Cliniques Universitaires Saint Luc
-
Huvudutredare:
- Joseph P. Dewulf, M.D., Ph.D.
-
Huvudutredare:
- Marie-Cécile Nassogne, M.D., Ph.D.
-
Underutredare:
- Xavier Stephenne, M.D., Ph.D.
-
Underutredare:
- Nicole Revencu, M.D., Ph.D.
-
Underutredare:
- Stéphanie Paquay, M.D.
-
Charleroi, Belgien, B-6041
- Har inte rekryterat ännu
- Institut de Pathologie et de Génétique (IPG)
-
Huvudutredare:
- Dominique Roland, M.D.
-
Underutredare:
- Damien Lederer, M.D., Ph.D.
-
Underutredare:
- Isabelle Maystadt, M.D., Ph.D.
-
Liège, Belgien, B-4000
- Har inte rekryterat ännu
- CHU Liège
-
Huvudutredare:
- François-Guillaume Debray, MD PhD
-
Huvudutredare:
- François Boemer, Pharm D PhD
-
Underutredare:
- Caroline Dadoumont, MD
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
- Barn
- Vuxen
- Äldre vuxen
Tar emot friska volontärer
Beskrivning
Inklusionskriterier:
- Försökspersoner från nyfödda till äldre, förmodligen inte drabbade av en sällsynt sjukdom (Grupp 1) (Nyfödda: endast kvarvarande DBS från nyföddsscreening från fullgångna nyfödda och med ett negativt officiellt screeningtest för nyfödda, avidentifierade prover som inte kräver en ICF, nej urinprov för denna kategori), ELLER
- Patienter från nyfödda till äldre, drabbade av en genetisk metabolisk sjukdom (genetisk bekräftelse krävs) eller annan bekräftad sällsynt sjukdom för vilken en metabolisk störning misstänks (Grupp 2), ELLER
- Patienter från nyfödda till äldre, drabbade av autismspektrumstörningar och utvärderade enligt DSMV-klassificeringen (Grupp 2), ELLER
- Patienter som misstänks vara drabbade av en genetisk metabolisk sjukdom eller annan sällsynt sjukdom med potentiell metabolisk störning (dvs. för vilka genetiska och/eller biokemiska test(er) inte är avgörande eller pågår) (Grupp 3)
Exklusions kriterier:
- Försökspersoner eller patienter för vilka de data som krävs för analys och tilldelning i rätt undergrupp saknas
- Inget informerat samtycke undertecknat
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
- Primärt syfte: Diagnostisk
- Tilldelning: N/A
- Interventionsmodell: Enskild gruppuppgift
- Maskning: Ingen (Open Label)
Vapen och interventioner
Deltagargrupp / Arm |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Experimentell: Metabolomisk utvärdering
LC-MS-qTOF analys av DBS och urin med en kombination av metoder
|
Metabolomics studie
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Upptäck nya biomarkörer i torkade blodfläckar och urinprover som kan förbättra diagnosen av sällsynta sjukdomar
Tidsram: 4 år
|
Jämförelse av metaboliska data innehållande tusentals biomarkörkandidater erhållna genom LC-MS-qTOF-analys mellan sällsynta sjukdomskohorter och åldersmatchade kontrollprover
|
4 år
|
Samarbetspartners och utredare
Utredare
- Huvudutredare: Joseph P Dewulf, M.D., Ph.D., Cliniques universitaires Saint-Luc
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
Primärt slutförande (Beräknad)
Avslutad studie (Beräknad)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (Faktisk)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- 2023/09AOU/346
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .