Metabolomický screening krevních skvrn a moči aplikovaný na vzácná onemocnění (BUSARD)
Primárním cílem této studie je vytvořit biobanku vysušených krevních skvrn a moči z velké kontrolní kohorty a shromáždit několik co největších kohort pacientů postižených nebo podezřelých z postižení vzácnými chorobami (především dědičná metabolická onemocnění) nebo autismem. poruchy spektra.
Bude vytvořena metabolomická databáze pomocí hmotnostního spektrometru s vysokým rozlišením (tj. "Zařízení") a budou potvrzeny nebo odhaleny specifické biomarkery pro onemocnění. Konečným cílem je usnadnit a zlepšit diagnostiku a screening pacientů postižených těmito poruchami, ale také zlepšit znalosti o biochemických mechanismech zahrnutých v průběhu vybraných patologií.
Hmotnostní spektrometrie s vysokým rozlišením umožňuje měření tisíců metabolitů v jediné analýze. Současné biochemické testy používané pro diagnostiku dědičných metabolických onemocnění využívají pouze kombinaci maximálně několika desítek biomarkerů v jedné analýze.
Cíle Odhalit nové biomarkery pro diagnostiku (+/- prozkoumat změněné cesty…) Odhalit a/nebo ověřit biomarkery novorozeneckého screeningu prostřednictvím retrospektivní analýzy zachovalé novorozenecké DBS od potvrzených pacientů (užitečné pro biochemické testování NBS prvního nebo druhého stupně!) Validace LC- MS qTOF pro metabolomický screening jako diagnostický test první linie (tisíce metabolitů) s použitím diagnostických algoritmů (upravené z-skóre) a průběžnou optimalizací přidáním nových případů a nových kontrol do databáze Generování biobanky močů a DBS ze vzácných onemocnění (IEMs ) & z velké referenční populace užitečné pro další výzkumné aplikace
Přehled studie
Postavení
Intervence / Léčba
Detailní popis
NÁVRH KLINICKÉHO VYŠETŘENÍ
Intervenční multicentrická studie využívající hmotnostní spektrometrii s vysokým rozlišením aplikovanou na suché krevní skvrny a vzorky moči, generující metabolomická data.
Studie bude zahájena založením biobanky podle skupinového popisu.
Vzorky (sušené krevní skvrny (DBS) a vzorky moči pro každý subjekt) budou odebrány v příslušných střediscích spoluřešitelů a poté budou odeslány do centrální biobanky Cliniques universitaires Saint Luc (CUSL). DBS mohou být uchovávány při pokojové teplotě (v suchu a chráněny před světlem), pokud jsou odeslány na CUSL do 2 týdnů po odběru vzorků.
Postup odběru vzorků, ke kterému dochází v každém spoluvyšetřujícím středisku, bude zahrnovat následující pořadí:
- Informace o studii (vysvětlení zkoušejícího nebo jeho zástupce)
- Shromažďování formulářů informovaného souhlasu s účastí, včetně přihlášení/odhlášení
- Dohoda o vícenásobném odběru vzorků v jiném časovém bodě (pouze pro skupiny II a III)
- Bude shromažďován důvěrný lékařský dotazník/CRF (redukovaná forma pro subjekty ve skupině 1-kontrola)
- DBS a odběr moči. Předměty, pro které je k dispozici pouze neonatální DBS, budou rovněž přijaty.
Identita a účast subjektů v experimentování zůstane přísně důvěrná v souladu s evropským obecným nařízením o ochraně osobních údajů ze dne 27. dubna 2016 (v platnosti od 25. května 2018), belgickým zákonem ze dne 30. července 2018 o ochraně soukromí v souvislosti se zpracováním osobních údajů, jakož i zákonem ze dne 22. srpna 2002 o právech pacientů. Osobní údaje budou kódovány. Subjekty nebudou identifikovány jménem ani jiným rozpoznatelným způsobem v žádném ze záznamů, výsledků nebo publikací souvisejících s experimentem.
Vyšetřovatelé studie identifikují potenciální subjekty, u kterých se zdá, že splňují kritéria způsobilosti.
Lékař nebo delegát vysvětlí studii. Poté, pokud subjekt a/nebo rodiče souhlasí, bude informovaný souhlas podepsán před jakýmkoliv odběrem vzorků.
Pro jeden formulář informovaného souhlasu (ICF) bude povoleno více vzorků v různých časových bodech.
Centra spoluřešitelů budou dočasně uchovávat pseudonymizované vzorky a budou pravidelně zasílat nashromážděné vzorky (zmrazené) do laboratoře ČZU (k biobankování). Vzorky budou před a po analýze skladovány při -80°C v biobance ČZU. Čas příjmu a přenosu při -80°C na ČZU bude zaznamenán v REDCAP.
Později bude provedeno generování datových souborů reprezentujících metabolom ve vzorcích DBS a moči kapalinovou chromatografií spojenou s analýzou hmotnostní spektrometrie s vysokým rozlišením (LC-MS-q-TOF).
Metabolomická analýza pomocí LC-MS-q-TOF bude používat přístroj SYNAPT-XS od Waters. Několik sloupců bude použito v režimech získávání negativních a pozitivních elektrosprejů, což umožní generování komplementárních souborů metabolomických dat obsahujících několik tisíc prvků v rozmezí přesné hmotnosti (m/z) (včetně spekter po energetické kolizi) a měření retenčního času. Kontroly kvality a spojené vzorky budou analyzovány v každé šarži běhu během metabolomické studie.
Po analýze dat pomocí progeneze QI, Unifi a R-package pro metabolomickou analýzu budou výsledky prodiskutovány a sdíleny se spoluřešiteli a očekávané výsledky budou snad publikovány v recenzovaném časopise. Je-li to nutné (tj. pro genetické potvrzení neobvyklého metabolomického profilu nebo sekundárního nálezu) a pokud je získán souhlas od pacienta, doplňkové biochemické testování na počátečních vzorcích DBS a/nebo moči; a genetické testování z DBS bude provedeno po projednání a dohodě se spoluřešiteli studie. V případě potřeby (tj. pokud je biochemicky a/nebo geneticky podezření na novou diagnózu), budou subjekty kontaktovány po dohodě se spoluřešiteli studie.
Vzorky potřebné pro tuto studii budou rozděleny do 3 hlavních skupin podrobně popsaných níže, z nichž každá bude rozdělena podle věkových kategorií; první skupina je hlavní zdravá skupina (Skupina 1), která umožňuje generovat referenční metabolomickou databázi. Dvě další skupiny odpovídají skupinám pacientů s patologií, jejichž diagnóza je buď potvrzena (skupina 2) nebo suspektní (skupina 3).
Celkem se očekává: 3366 subjektů
- 30 pro technickou optimalizaci (kromě DBS a moči budou odebrány vzorky zkumavek s plnou krví)
- 1080 zbytkového materiálu lidského těla (RHBM) ze screeningových center pro novorozence (skupina 1)
- 1056 ovládacích prvků (skupina 1)
- 1200 pacientů (skupiny 2 a 3)
Minimální počet vzorků potřebný k vytvoření referenčního intervalu pomocí neparametrické metody je 120 vzorků podle pokynů CLSI28-A3C (viz také Y Ozarda et Al. Klinická chemie a laboratorní medicína 2018, Vol 57, Issue 1). Vyšetřovatelé proto stanovili cíl minimálně 120 odebraných vzorků pro každou věkovou kategorii. Vzorky budou rovnoměrně rozděleny podle pohlaví, ročního období a zúčastněných center (tedy geografického původu). Pro kategorie novorozenců bude cílový počet kontrolních vzorků vyšší, protože bude snazší dostupnost velkého množství kontrolních vzorků s využitím anonymizovaných reziduálních vzorků ze screeningových center novorozenců. Na druhou stranu vzorky moči nebudou odebírány subjektům pro kategorie novorozenců.
Skupina 2 zahrnuje jedince se známou patologií, jejichž diagnóza je potvrzena genetickým testem (genetické varianty považované za patogenní nebo pravděpodobně patogenní podle klasifikace American College of Human Genetics) nebo biochemickým referenčním testem spojeným s typickým klinickým znakem. U poruch autistického spektra by rekrutovaní pacienti měli být zahrnuti podle klasifikace Diagnostic and Statistical Manual (DSM) V. Podskupiny jsou definovány podle patologie postihující každého jedince (klasifikace podle postiženého genu, způsobu dědičnosti a typu mutace); primárně uvažovanými cílovými patologiemi jsou genetická metabolická onemocnění, ale cílí se i na další vzácná onemocnění a poruchy autistického spektra.
Skupina 3 zahrnuje osoby, u kterých je na základě klinických údajů podezření na vzácné onemocnění, ale nebylo potvrzeno (včetně pacientů, u kterých genetické a biochemické testy stále probíhají nebo nejsou jednoznačné). Pokud se stav jedince změní před ukončením studie po potvrzení diagnózy sdělené anonymně rekrutujícím spoluřešitelem (kvůli výsledkům získaným nezávisle mimo studii) nebo v důsledku výsledků studie (specifické biomarkery a/ nebo skórování a/nebo genetické potvrzení pomocí druhého stupně testování) bude subjekt poté převeden do odpovídající skupiny 2. Tito pacienti budou přijati do všech zúčastněných center.
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Fáze
- Nelze použít
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Joseph P Dewulf, M.D., Ph.D.
- Telefonní číslo: 02/7646836
- E-mail: Etdclin.Busard@saintluc.uclouvain.be
Studijní místa
-
-
-
Brussels, Belgie, B-1020
- Zatím nenabíráme
- Hôpital Universitaire des enfants Reine Fabiola (HUDERF-ULB)
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Lionel Marcélis, MSc, Ph.D.
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Aurélie Empain, M.D., Ph.D.
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Corinne De Laet, M.D., Ph.D.
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Ebru Surgun, M.D.
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Céline Morelli, M.D.
-
Brussels, Belgie, B-1200
- Nábor
- Cliniques Universitaires Saint Luc
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Joseph P. Dewulf, M.D., Ph.D.
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Marie-Cécile Nassogne, M.D., Ph.D.
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Xavier Stephenne, M.D., Ph.D.
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Nicole Revencu, M.D., Ph.D.
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Stéphanie Paquay, M.D.
-
Charleroi, Belgie, B-6041
- Zatím nenabíráme
- Institut de Pathologie et de Génétique (IPG)
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Dominique Roland, M.D.
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Damien Lederer, M.D., Ph.D.
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Isabelle Maystadt, M.D., Ph.D.
-
Liège, Belgie, B-4000
- Zatím nenabíráme
- Chu Liege
-
Vrchní vyšetřovatel:
- François-Guillaume Debray, MD PhD
-
Vrchní vyšetřovatel:
- François Boemer, Pharm D PhD
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Caroline Dadoumont, MD
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Jedinci od novorozenců po seniory, pravděpodobně nepostižení vzácným onemocněním (skupina 1) (novorozenci: pouze reziduální DBS z novorozeneckého screeningu u donošených novorozenců a s negativním oficiálním novorozeneckým screeningovým testem, deidentifikované vzorky nevyžadující ICF, ne vzorek moči pro tuto kategorii), NEBO
- Pacienti od novorozenců po seniory, postižení genetickým metabolickým onemocněním (je vyžadováno genetické potvrzení) nebo jiným potvrzeným vzácným onemocněním, u kterého je podezření na metabolickou poruchu (skupina 2), NEBO
- Pacienti od novorozenců po seniory, postižení poruchami autistického spektra a hodnoceni podle DSMV klasifikace (skupina 2), OR
- Pacienti s podezřením, že jsou postiženi genetickým metabolickým onemocněním nebo jiným vzácným onemocněním s potenciální metabolickou poruchou (tj. pro které jsou genetické a/nebo biochemické testy neprůkazné nebo probíhají) (Skupina 3)
Kritéria vyloučení:
- Subjekty nebo pacienti, pro které chybí data potřebná pro analýzu a zařazení do správné podskupiny
- Nebyl podepsán informovaný souhlas
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Primární účel: Diagnostický
- Přidělení: N/A
- Intervenční model: Přiřazení jedné skupiny
- Maskování: Žádné (otevřený štítek)
Zbraně a zásahy
Skupina účastníků / Arm |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Experimentální: Metabolomické hodnocení
LC-MS-qTOF analýza DBS a moči pomocí kombinace metod
|
Metabolomická studie
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Odhalte nové biomarkery v zaschlých krevních skvrnách a vzorcích moči schopné zlepšit diagnostiku vzácných onemocnění
Časové okno: 4 roky
|
Porovnání metabolických dat obsahujících tisíce kandidátů biomarkerů získaných analýzou LC-MS-qTOF mezi kohortami vzácných onemocnění a kontrolními vzorky odpovídajícího věku
|
4 roky
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Joseph P Dewulf, M.D., Ph.D., Cliniques universitaires Saint-Luc
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Odhadovaný)
Dokončení studie (Odhadovaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- 2023/09AOU/346
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Vzácná onemocnění
-
Istituto Ortopedico GaleazziDokončenoBolest | Spát | Komplikace artroplastiky | Hospitalizace | RARItálie
Klinické studie na Hmotnostní spektrometrie s vysokým rozlišením
-
Ain Shams UniversityDokončenoKrvácení z horní části gastrointestinálního traktuEgypt