Detección metabolómica de orina y manchas de sangre aplicadas a enfermedades raras (BUSARD)
El objetivo principal de este estudio es establecer un biobanco de muestras de sangre seca y orina de una gran cohorte de control y recopilar varias cohortes lo más grandes posible de pacientes afectados o sospechosos de estar afectados por enfermedades raras (principalmente enfermedades metabólicas hereditarias) o por autismo. trastornos del espectro.
Se generará una base de datos metabolómica utilizando un espectrómetro de masas de alta resolución (es decir, el "Dispositivo") y se confirmarán o descubrirán biomarcadores específicos para las enfermedades. El objetivo final es facilitar y mejorar el diagnóstico y cribado de los pacientes afectados por estos trastornos, pero también mejorar el conocimiento sobre los mecanismos bioquímicos implicados en el transcurso de las patologías seleccionadas.
La espectrometría de masas de alta resolución permite medir miles de metabolitos en un solo análisis. Las pruebas bioquímicas actuales utilizadas para el diagnóstico de enfermedades metabólicas hereditarias sólo utilizan una combinación de como máximo unas pocas docenas de biomarcadores en un solo análisis.
Objetivos Descubrir nuevos biomarcadores para el diagnóstico (+/- explorar las vías alteradas…) Descubrir y/o validar biomarcadores de detección neonatal mediante análisis retrospectivo de DBS recién nacidos conservados de pacientes confirmados (¡útil para pruebas bioquímicas de NBS de primer o segundo nivel!) Validación de LC- MS qTOF para detección de metabolómica como prueba de diagnóstico de primera línea (miles de metabolitos) utilizando algoritmos de diagnóstico (puntuaciones z modificadas) y optimización continua agregando nuevos casos y nuevos controles en la base de datos Generación de un biobanco de orina y ECP de enfermedades raras (IEM) ) y de una gran población de referencia útil para otras aplicaciones de investigación
Descripción general del estudio
Estado
Condiciones
Intervención / Tratamiento
Descripción detallada
DISEÑO DE LA INVESTIGACIÓN CLÍNICA
Estudio intervencionista multicéntrico mediante espectrometría de masas de alta resolución aplicada a gotas de sangre seca y muestras de orina, generando datos metabolómicos.
El estudio comenzará con el establecimiento de un biobanco según la descripción del grupo.
Las muestras (manchas de sangre seca (DBS) y muestras de orina para cada sujeto) se recolectarán en los respectivos centros de co-investigadores, antes de enviarse al biobanco central de Cliniques universitaires Saint Luc (CUSL). Se permite que los DBS se mantengan a temperatura ambiente (seco y protegido de la luz) si se envían a CUSL dentro de las 2 semanas posteriores al muestreo.
El procedimiento de muestreo, que se llevará a cabo en cada centro de co-investigación, incluirá el siguiente orden:
- Información sobre el estudio (explicaciones del investigador o su delegado)
- Recopilación de formularios de consentimiento informado para participar, incluida la opción de participar o no
- Acuerdo de muestreo múltiple en otro momento (solo para los grupos II y III)
- Se recopilará un cuestionario médico confidencial/CRF (forma reducida para sujetos del Grupo 1-control)
- DBS y muestreo de orina. También se aceptarán sujetos para los que solo esté disponible DBS neonatal.
La identidad y la participación de los sujetos en la experimentación serán estrictamente confidenciales de acuerdo con el Reglamento general europeo de protección de datos del 27 de abril de 2016 (en aplicación desde el 25 de mayo de 2018), la ley belga del 30 de julio de 2018 sobre la protección de privacidad en lo que respecta al procesamiento de datos personales, así como la ley de 22 de agosto de 2002 sobre los derechos de los pacientes. Los datos personales estarán codificados. Los sujetos no serán identificados por su nombre ni de ninguna otra forma reconocible en ninguno de los registros, resultados o publicaciones relacionadas con la experimentación.
Los investigadores del estudio identificarán a los sujetos potenciales que parezcan cumplir con los criterios de elegibilidad.
El médico o delegado le explicará el estudio. Luego, si el sujeto y/o los padres están de acuerdo, se firmará el consentimiento informado antes de cualquier muestreo.
Se permitirán muestreos múltiples en diferentes momentos para un único formulario de consentimiento informado (ICF).
Los centros co-investigadores mantendrán temporalmente muestras seudonimizadas y enviarán periódicamente las muestras acumuladas (congeladas) al laboratorio CUSL (para biobanco). Las muestras se almacenarán a -80 ° C en el biobanco CUSL antes y después del análisis. La hora de recepción y transferencia a -80°C en CUSL se registrará en REDCAP.
Posteriormente, se generarán conjuntos de datos representativos del metaboloma en DBS y muestras de orina mediante cromatografía líquida acoplada a análisis de espectrometría de masas de alta resolución (LC-MS-q-TOF).
El análisis metabolómico mediante LC-MS-q-TOF utilizará un instrumento SYNAPT-XS de Waters. Se utilizarán varias columnas en modos de adquisición de electropulverización negativa y positiva, lo que permitirá la generación de conjuntos de datos metabolómicos complementarios que contienen varios miles de características clasificadas por masa exacta (m/z) (incluidos espectros después de la colisión de energía) y mediciones del tiempo de retención. Se analizarán controles de calidad y muestras agrupadas en cada lote de ejecución durante el estudio de metabolómica.
Después del análisis de datos utilizando progenesis QI, Unifi y R-package para el análisis metabolómico, los resultados se discutirán y compartirán con los coinvestigadores y, con suerte, los resultados esperados se publicarán en una revista revisada por pares. Si es necesario (es decir, para confirmar genéticamente un perfil metabólico inusual o un hallazgo secundario) y si se obtiene el consentimiento del paciente, pruebas bioquímicas complementarias en muestras iniciales de DBS y/o de orina; y se realizarán pruebas genéticas de la DBS, previa discusión y acuerdo con los co-investigadores del estudio. Si es necesario (es decir, si se sospecha un nuevo diagnóstico bioquímica y/o genéticamente), se contactará a los sujetos después del acuerdo de los co-investigadores del estudio.
Las muestras necesarias para este estudio se dividirán en 3 grupos principales que se detallan a continuación, cada uno de ellos subdividido según categorías de edad; el primer grupo es el principal grupo sano (Grupo 1) que permite generar una base de datos metabolómica de referencia. Los otros dos grupos corresponden a grupos de pacientes con patologías cuyo diagnóstico está confirmado (Grupo 2) o sospechado (Grupo 3).
Total esperado: 3366 sujetos
- 30 para optimización técnica (además de DBS y orina, se tomarán muestras de tubos de sangre completa)
- 1080 material residual del cuerpo humano (RHBM) de centros de cribado neonatal (grupo 1)
- 1056 controles (grupo 1)
- 1200 pacientes (grupos 2 y 3)
El número mínimo de muestras necesarias para generar un intervalo de referencia utilizando un método no paramétrico es 120 muestras según las directrices CLSI28-A3C (ver también Y Ozarda et al. Química clínica y medicina de laboratorio 2018, Vol 57, Número 1). Por lo tanto, los investigadores establecieron un objetivo de un mínimo de 120 muestras recolectadas por categoría de edad. Las muestras se distribuirán equitativamente por sexo, temporada y centros participantes (por tanto, origen geográfico). Para las categorías de recién nacidos, debido a la fácil disponibilidad de una gran cantidad de muestras de control utilizando muestras residuales anónimas de los centros de detección de recién nacidos, la cantidad objetivo de muestras de control será mayor. Por otro lado, no se recolectarán muestras de orina de sujetos de las categorías de recién nacidos.
El grupo 2 incluye individuos con una patología conocida cuyo diagnóstico se confirma mediante una prueba genética (variante(s) genética(s) considerada(s) patógena(s) o probablemente patógena(s) según la clasificación del American College of Human Genetics) o una prueba bioquímica de referencia asociada a una característica clínica típica. Para los trastornos del espectro autista, los pacientes reclutados deben incluirse según la clasificación V del Manual diagnóstico y estadístico (DSM). Los subgrupos se definen según la patología que afecta a cada individuo (clasificación según el gen afectado, modo de herencia y tipo de mutación); Las principales patologías consideradas son las enfermedades metabólicas genéticas, pero también se abordan otras enfermedades raras y trastornos del espectro autista.
El grupo 3 incluye personas en las que se sospecha una enfermedad rara según los datos clínicos pero no se confirma (incluidos los pacientes cuyas pruebas genéticas y bioquímicas aún están en curso o no son concluyentes). Si el estado de un individuo cambia antes del final del estudio después de la confirmación de un diagnóstico comunicado de forma anónima por el co-investigador reclutador (debido a resultados obtenidos de forma independiente fuera del estudio) o debido a los resultados del estudio (biomarcadores específicos y/o o puntuación y/o confirmación genética mediante pruebas de segundo nivel) el sujeto será luego transferido a su correspondiente grupo 2. Estos pacientes serán reclutados en todos los centros participantes.
Tipo de estudio
Inscripción (Estimado)
Fase
- No aplica
Contactos y Ubicaciones
Estudio Contacto
- Nombre: Joseph P Dewulf, M.D., Ph.D.
- Número de teléfono: 02/7646836
- Correo electrónico: Etdclin.Busard@saintluc.uclouvain.be
Ubicaciones de estudio
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Brussels, Bélgica, B-1020
- Aún no reclutando
- Hôpital Universitaire des enfants Reine Fabiola (HUDERF-ULB)
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Investigador principal:
- Lionel Marcélis, MSc, Ph.D.
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Investigador principal:
- Aurélie Empain, M.D., Ph.D.
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Sub-Investigador:
- Corinne De Laet, M.D., Ph.D.
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Sub-Investigador:
- Ebru Surgun, M.D.
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Sub-Investigador:
- Céline Morelli, M.D.
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Brussels, Bélgica, B-1200
- Reclutamiento
- Cliniques Universitaires Saint Luc
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Investigador principal:
- Joseph P. Dewulf, M.D., Ph.D.
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Investigador principal:
- Marie-Cécile Nassogne, M.D., Ph.D.
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Sub-Investigador:
- Xavier Stephenne, M.D., Ph.D.
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Sub-Investigador:
- Nicole Revencu, M.D., Ph.D.
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Sub-Investigador:
- Stéphanie Paquay, M.D.
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Charleroi, Bélgica, B-6041
- Aún no reclutando
- Institut de Pathologie et de Génétique (IPG)
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Investigador principal:
- Dominique Roland, M.D.
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Sub-Investigador:
- Damien Lederer, M.D., Ph.D.
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Sub-Investigador:
- Isabelle Maystadt, M.D., Ph.D.
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Liège, Bélgica, B-4000
- Aún no reclutando
- CHU Liège
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Investigador principal:
- François-Guillaume Debray, MD PhD
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Investigador principal:
- François Boemer, Pharm D PhD
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Sub-Investigador:
- Caroline Dadoumont, MD
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Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
- Niño
- Adulto
- Adulto Mayor
Acepta Voluntarios Saludables
Descripción
Criterios de inclusión:
- Sujetos desde recién nacidos hasta ancianos, presumiblemente no afectados por una enfermedad rara (Grupo 1) (Recién nacidos: solo ECP residual del cribado neonatal de recién nacidos a término y con una prueba oficial de cribado neonatal negativa, muestras no identificadas que no requieren ICF, no muestra de orina para esta categoría), O
- Pacientes desde recién nacidos hasta ancianos, afectados por una enfermedad metabólica genética (se requiere confirmación genética) u otra enfermedad rara confirmada de la cual se sospecha un trastorno metabólico (Grupo 2), O
- Pacientes desde recién nacidos hasta ancianos, afectados por trastornos del espectro autista y evaluados según la clasificación DSMV (Grupo 2), O
- Pacientes sospechosos de estar afectados por una enfermedad metabólica genética u otra enfermedad rara con posible trastorno metabólico (es decir, para los cuales las pruebas genéticas y/o bioquímicas no son concluyentes o están en curso) (Grupo 3)
Criterio de exclusión:
- Sujetos o pacientes para los cuales faltan los datos necesarios para el análisis y la asignación en el subgrupo correcto
- Sin consentimiento informado firmado
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
- Propósito principal: Diagnóstico
- Asignación: N / A
- Modelo Intervencionista: Asignación de un solo grupo
- Enmascaramiento: Ninguno (etiqueta abierta)
Armas e Intervenciones
Grupo de participantes/brazo |
Intervención / Tratamiento |
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Experimental: Evaluación metabolómica
Análisis LC-MS-qTOF de DBS y orina utilizando una combinación de métodos
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Estudio de metabolómica
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¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
|---|---|---|
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Descubra nuevos biomarcadores en muestras de sangre seca y orina capaces de mejorar el diagnóstico de enfermedades raras
Periodo de tiempo: 4 años
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Comparación de datos metabólicos que contienen miles de candidatos a biomarcadores obtenidos mediante análisis LC-MS-qTOF entre cohortes de enfermedades raras y muestras de control de la misma edad
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4 años
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Colaboradores e Investigadores
Investigadores
- Investigador principal: Joseph P Dewulf, M.D., Ph.D., Cliniques universitaires Saint-Luc
Fechas de registro del estudio
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
Finalización primaria (Estimado)
Finalización del estudio (Estimado)
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
Publicado por primera vez (Actual)
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
Última verificación
Más información
Términos relacionados con este estudio
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- 2023/09AOU/346
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
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