Метаболомный скрининг пятен крови и мочи применительно к редким заболеваниям (BUSARD)
Основная цель этого исследования — создать биобанк засохших пятен крови и мочи из большой контрольной группы и собрать несколько как можно больших когорт пациентов, страдающих или подозреваемых в наличии редких заболеваний (в основном наследственных заболеваний обмена веществ) или аутизма. расстройства спектра.
Будет создана метаболомная база данных с использованием масс-спектрометра высокого разрешения (т.е. «Устройства») и будут подтверждены или обнаружены специфические биомаркеры заболеваний. Конечная цель — облегчить и улучшить диагностику и скрининг пациентов, страдающих этими расстройствами, а также улучшить знания о биохимических механизмах, участвующих в течении выбранных патологий.
Масс-спектрометрия высокого разрешения позволяет измерять тысячи метаболитов за один анализ. Современные биохимические тесты, используемые для диагностики наследственных заболеваний обмена веществ, используют комбинацию максимум нескольких десятков биомаркеров в одном анализе.
Цели Раскрыть новые биомаркеры для диагностики (+/- изучить измененные пути...) Выявить и/или подтвердить биомаркеры скрининга новорожденных посредством ретроспективного анализа сохраненных DBS новорожденных от подтвержденных пациентов (полезно для биохимического тестирования NBS первого или второго уровня!) Валидация LC- MS qTOF для метаболомного скрининга в качестве диагностического теста первой линии (тысячи метаболитов) с использованием диагностических алгоритмов (модифицированные z-показатели) и постоянной оптимизации путем добавления новых случаев и новых контролей в базу данных. Создание биобанка мочи и DBS от редких заболеваний (IEMs). ) и из большой выборки, полезной для других исследовательских целей
Обзор исследования
Статус
Вмешательство/лечение
Подробное описание
ПРОЕКТИРОВАНИЕ КЛИНИЧЕСКОГО ИССЛЕДОВАНИЯ
Интервенционное многоцентровое исследование с использованием масс-спектрометрии высокого разрешения, применяемой к высушенным пятнам крови и образцам мочи, с получением метаболомических данных.
Исследование начнется с создания биобанка согласно описанию группы.
Образцы (сухие пятна крови (DBS) и образцы мочи для каждого субъекта) будут собраны в соответствующих центрах совместных исследований, а затем отправлены в центральный биобанк университетских клиник Сен-Люк (CUSL). DBS разрешается хранить при комнатной температуре (в сухом и защищенном от света месте) при отправке в CUSL в течение 2 недель после отбора проб.
Процедура отбора проб, проводимая в каждом центре совместных исследований, будет включать в себя следующий порядок:
- Информация об исследовании (пояснения исследователя или его представителя)
- Сбор форм информированного согласия на участие, включая согласие на участие или отказ от него.
- Согласование многократного отбора проб в другой момент времени (только для групп II и III)
- Будет собрана конфиденциальная медицинская анкета/ИРК (сокращенная форма для субъектов группы 1-контроль).
- DBS и анализ мочи. Также будут приняты субъекты, для которых доступен только неонатальный DBS.
Личность и участие испытуемых в эксперименте останутся строго конфиденциальными в соответствии с Европейским общим регламентом по защите данных от 27 апреля 2016 г. (вступает в силу с 25 мая 2018 г.), законом Бельгии от 30 июля 2018 г. о защите конфиденциальность в отношении обработки персональных данных, а также закон от 22 августа 2002 г. о правах пациентов. Персональные данные будут закодированы. Субъекты не будут идентифицированы по имени или каким-либо другим узнаваемым способом в каких-либо записях, результатах или публикациях, связанных с экспериментами.
Исследователи исследования определят потенциальных субъектов, которые, по всей видимости, соответствуют критериям отбора.
Врач или делегат объяснит суть исследования. Затем, если субъект и/или родители согласны, перед взятием образца будет подписано информированное согласие.
Для одной формы информированного согласия (ICF) будет разрешено многократное взятие образцов в разные моменты времени.
Центры совместных исследований будут временно хранить псевдонимизированные образцы и периодически отправлять накопленные образцы (замороженные) в лабораторию CUSL (для биобанкинга). Образцы будут храниться при температуре -80°C в биобанке CUSL до и после анализа. Время приема и передачи при температуре -80°C в CUSL будет записано в REDCAP.
Позже будет выполнено создание наборов данных, репрезентативных для метаболома в DBS и образцах мочи, с помощью жидкостной хроматографии в сочетании с анализом масс-спектрометрии высокого разрешения (LC-MS-q-TOF).
Для метаболомного анализа с помощью LC-MS-q-TOF будет использоваться прибор SYNAPT-XS от Waters. Несколько колонок будут использоваться в режимах сбора отрицательных и положительных электрораспылений, что позволит генерировать дополнительные наборы метаболомных данных, содержащие несколько тысяч признаков, ранжированных по точной массе (m/z) (включая спектры после энергетического столкновения) и измерениям времени удерживания. Контроль качества и объединенные образцы будут анализироваться в каждой партии во время метаболомного исследования.
После анализа данных с использованием прогенезиса QI, Unifi и R-пакета для метаболомного анализа результаты будут обсуждены и переданы соисследователям, а ожидаемые результаты, как мы надеемся, будут опубликованы в рецензируемом журнале. При необходимости (т. е. для генетического подтверждения необычного метаболомного профиля или вторичного результата) и если согласие получено от пациента, дополнительное биохимическое тестирование исходного DBS и/или образцов мочи; и генетическое тестирование из DBS будет проведено после обсуждения и согласования с соисследователями исследования. При необходимости (т. е. если биохимически и/или генетически подозревается новый диагноз) с субъектами свяжутся после согласия со-исследователей исследования.
Образцы, необходимые для этого исследования, будут разделены на 3 основные группы, подробно описанные ниже, каждая из которых разделена по возрастным категориям; первая группа является основной здоровой группой (группа 1), что позволяет сформировать справочную метаболомную базу данных. Две другие группы соответствуют группам пациентов с патологиями, диагноз которых либо подтвержден (группа 2), либо подозревается (группа 3).
Всего ожидается: 3366 предметов
- 30 для технической оптимизации (помимо DBS и мочи будут взяты пробы из пробирок цельной крови)
- 1080 остаточных материалов человеческого тела (ОМТЧ) из центров скрининга новорожденных (группа 1)
- 1056 элементов управления (группа 1)
- 1200 пациентов (2-я и 3-я группы)
Минимальное количество образцов, необходимое для создания референтного интервала с использованием непараметрического метода, составляет 120 образцов в соответствии с рекомендациями CLSI28-A3C (см. также Y Ozarda et al. Клиническая химия и лабораторная медицина 2018, Том 57, Выпуск 1). Поэтому исследователи поставили цель собрать минимум 120 образцов для каждой возрастной категории. Образцы будут равномерно распределены по полу, сезону и участвующим центрам (следовательно, по географическому происхождению). Для категорий новорожденных, поскольку чем проще получить большое количество контрольных образцов с использованием анонимных остаточных образцов из центров скрининга новорожденных, целевое количество контрольных образцов будет больше. С другой стороны, образцы мочи не будут собираться у субъектов категорий новорожденных.
В группу 2 входят лица с известной патологией, диагноз которой подтвержден генетическим тестом (генетический вариант(ы), считающийся патогенным или вероятно патогенным согласно классификации Американского колледжа генетики человека) или биохимическим эталонным тестом, связанным с типичным клиническим признаком. В случае расстройств аутистического спектра набранные пациенты должны быть включены в соответствии с классификацией V Диагностического и статистического руководства (DSM). Подгруппы определяются в зависимости от патологии, поражающей каждого человека (классификация по пораженному гену, способу наследования и типу мутации); В первую очередь рассматриваемыми патологиями являются генетические метаболические заболевания, но целью также являются и другие редкие заболевания и расстройства аутистического спектра.
В 3-ю группу входят лица, у которых на основании клинических данных заподозрено редкое заболевание, но оно не подтверждено (в том числе пациенты, у которых генетические и биохимические исследования еще продолжаются или не дали результатов). Если статус человека изменяется до окончания исследования после подтверждения диагноза, анонимно сообщенного со-исследователем (в связи с результатами, полученными независимо вне исследования) или в связи с результатами исследования (специфические биомаркеры и/или или оценка и/или генетическое подтверждение с использованием тестирования второго уровня) затем субъект будет переведен в соответствующую группу 2. Эти пациенты будут набраны во всех участвующих центрах.
Тип исследования
Регистрация (Оцененный)
Фаза
- Непригодный
Контакты и местонахождение
Контакты исследования
- Имя: Joseph P Dewulf, M.D., Ph.D.
- Номер телефона: 02/7646836
- Электронная почта: Etdclin.Busard@saintluc.uclouvain.be
Места учебы
-
-
-
Brussels, Бельгия, B-1020
- Еще не набирают
- Hôpital Universitaire des enfants Reine Fabiola (HUDERF-ULB)
-
Главный следователь:
- Lionel Marcélis, MSc, Ph.D.
-
Главный следователь:
- Aurélie Empain, M.D., Ph.D.
-
Младший исследователь:
- Corinne De Laet, M.D., Ph.D.
-
Младший исследователь:
- Ebru Surgun, M.D.
-
Младший исследователь:
- Céline Morelli, M.D.
-
Brussels, Бельгия, B-1200
- Рекрутинг
- Cliniques Universitaires Saint Luc
-
Главный следователь:
- Joseph P. Dewulf, M.D., Ph.D.
-
Главный следователь:
- Marie-Cécile Nassogne, M.D., Ph.D.
-
Младший исследователь:
- Xavier Stephenne, M.D., Ph.D.
-
Младший исследователь:
- Nicole Revencu, M.D., Ph.D.
-
Младший исследователь:
- Stéphanie Paquay, M.D.
-
Charleroi, Бельгия, B-6041
- Еще не набирают
- Institut de Pathologie et de Génétique (IPG)
-
Главный следователь:
- Dominique Roland, M.D.
-
Младший исследователь:
- Damien Lederer, M.D., Ph.D.
-
Младший исследователь:
- Isabelle Maystadt, M.D., Ph.D.
-
Liège, Бельгия, B-4000
- Еще не набирают
- CHU Liège
-
Главный следователь:
- François-Guillaume Debray, MD PhD
-
Главный следователь:
- François Boemer, Pharm D PhD
-
Младший исследователь:
- Caroline Dadoumont, MD
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Ребенок
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Описание
Критерии включения:
- Субъекты от новорожденных до пожилых людей, предположительно не затронутые редким заболеванием (Группа 1) (Новорожденные: только остаточная DBS в результате скрининга доношенных новорожденных и с отрицательным официальным скрининговым тестом новорожденных, деидентифицированные образцы, не требующие МКФ, нет образец мочи для этой категории), ИЛИ
- Пациенты от новорожденных до пожилых людей, страдающие генетическим метаболическим заболеванием (требуется генетическое подтверждение) или другим подтвержденным редким заболеванием, при котором подозревается метаболическое нарушение (группа 2), ИЛИ
- Пациенты от новорожденных до пожилых людей с расстройствами аутистического спектра, оцененные по классификации DSMV (группа 2), ИЛИ
- Пациенты с подозрением на генетическое метаболическое заболевание или другое редкое заболевание с потенциальным метаболическим нарушением (т.е. для которых генетические и/или биохимические тесты не дают окончательных результатов или находятся в стадии разработки) (Группа 3)
Критерий исключения:
- Субъекты или пациенты, для которых отсутствуют данные, необходимые для анализа и отнесения к правильной подгруппе.
- Информированное согласие не подписано
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Основная цель: Диагностика
- Распределение: Н/Д
- Интервенционная модель: Одногрупповое задание
- Маскировка: Нет (открытая этикетка)
Оружие и интервенции
Группа участников / Армия |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Экспериментальный: Метаболомическая оценка
Анализ LC-MS-qTOF DBS и мочи с использованием комбинации методов
|
Метаболомика исследование
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Обнаружьте новые биомаркеры в засохших пятнах крови и образцах мочи, способные улучшить диагностику редких заболеваний
Временное ограничение: 4 года
|
Сравнение данных о метаболизме, содержащих тысячи кандидатов в биомаркеры, полученных с помощью анализа LC-MS-qTOF, между когортами редких заболеваний и контрольными образцами соответствующего возраста
|
4 года
|
Соавторы и исследователи
Следователи
- Главный следователь: Joseph P Dewulf, M.D., Ph.D., Cliniques universitaires Saint-Luc
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Оцененный)
Завершение исследования (Оцененный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- 2023/09AOU/346
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .