Blodflekk- og urinmetabolomisk screening brukt på sjeldne sykdommer (BUSARD)
Hovedmålet med denne studien er å etablere en biobank av tørkede blodflekker og urin fra en stor kontrollkohort og samle flere så store som mulig av pasienter rammet eller mistenkt for å være rammet av sjeldne sykdommer (hovedsakelig arvelige stoffskiftesykdommer) eller av autisme spektrumforstyrrelser.
En metabolomisk database som bruker et høyoppløselig massespektrometer (dvs. "Enheten") vil bli generert og spesifikke biomarkører for sykdommene vil bli bekreftet eller avdekket. Det endelige målet er å lette og forbedre diagnostisering og screening av pasienter som er rammet av disse lidelsene, men også å forbedre kunnskapen om de biokjemiske mekanismene som er involvert i løpet av de utvalgte patologiene.
Høyoppløselig massespektrometri tillater måling av tusenvis av metabolitter i en enkelt analyse. De nåværende biokjemiske testene som brukes for diagnostisering av arvelige metabolske sykdommer, bruker kun en kombinasjon av maksimalt noen få dusin biomarkører i én analyse.
Mål Avdekke nye biomarkører for diagnose (+/- utforske de endrede banene...) Avdekke og/eller validere biomarkører for nyfødtscreening gjennom retrospektiv analyse av bevart nyfødt DBS fra bekreftede pasienter (nyttig for første eller andre tier biokjemisk NBS-testing!) Validering av LC- MS qTOF for metabolomikk-screening som førstelinjediagnostisk test (tusenvis av metabolitter) ved bruk av diagnostiske algoritmer (modifiserte z-score) og kontinuerlig optimalisering ved å legge til nye tilfeller og nye kontroller i databasen Generering av en biobank av urin og DBS fra sjeldne sykdommer (IEMs) ) & fra en stor referansepopulasjon som er nyttig for andre forskningsapplikasjoner
Studieoversikt
Status
Intervensjon / Behandling
Detaljert beskrivelse
DESIGN AV DEN KLINISKE UNDERSØKELSEN
Intervensjonell multisenterstudie med høyoppløselig massespektrometri brukt på tørkede blodflekker og urinprøver, og genererer metabolomiske data.
Utredningen starter ved etablering av en biobank i henhold til gruppebeskrivelse.
Prøvene (tørkede blodflekker (DBS) og urinprøver for hvert forsøksperson) vil bli samlet inn i respektive co-investigator sentre, før de sendes til den sentrale biobanken til Cliniques universitaires Saint Luc (CUSL). DBS tillates oppbevart ved romtemperatur (tørt og beskyttet mot lys) hvis det sendes til CUSL innen 2 uker etter prøvetaking.
Prøvetakingsprosedyren, som finner sted ved hvert samundersøkelsessenter, vil omfatte i følgende rekkefølge:
- Informasjon om studien (forklaringer fra etterforskeren eller hans/hennes delegat)
- Innsamling av informerte samtykkeskjemaer for å delta, inkludert å melde seg på/ute for
- Avtale om flere prøvetaking på et annet tidspunkt (kun for gruppe II og III)
- Et konfidensielt medisinsk spørreskjema/CRF vil bli samlet inn (redusert skjema for forsøkspersoner i gruppe 1-kontrollen)
- DBS og urinprøvetaking. Emner der kun neonatal DBS er tilgjengelig vil også bli akseptert.
Identiteten og deltakelsen til forsøkspersonene i eksperimentet vil forbli strengt konfidensiell i samsvar med den europeiske generelle databeskyttelsesforordningen av 27. april 2016 (i anvendelse siden 25. mai 2018), den belgiske loven av 30. juli 2018 om beskyttelse av personvern med hensyn til behandling av personopplysninger, samt lov av 22. august 2002 om pasientrettigheter. Personopplysninger vil bli kodet. Emner vil ikke bli identifisert med navn eller på noen annen gjenkjennelig måte i noen av postene, resultatene eller publikasjonene knyttet til eksperimentet.
Undersøkerne av studien vil identifisere potensielle emner som ser ut til å oppfylle kvalifikasjonskriteriene.
Legen eller delegaten vil forklare studien. Deretter, hvis forsøkspersonen og/eller foreldrene er enige, vil det informerte samtykket bli signert før prøvetaking.
Flere prøvetaking på forskjellige tidspunkter vil være tillatt for et enkelt informert samtykkeskjema (ICF).
Medetterforskersentrene vil midlertidig beholde pseudonymiserte prøver og vil periodisk sende de akkumulerte prøvene (fryst) til CUSL-laboratoriet (for biobanking). Prøvene vil bli lagret ved -80°C i CUSL biobank før og etter analyse. Tidspunktet for mottak og overføring ved -80°C ved CUSL vil bli registrert i REDCAP.
Senere vil generering av datasett som representerer metabolomet i DBS og urinprøver ved væskekromatografi koblet til høyoppløselig massespektrometri (LC-MS-q-TOF) analyse bli utført.
Metabolomikkanalysen av LC-MS-q-TOF vil bruke et SYNAPT-XS-instrument fra Waters. Flere kolonner vil bli brukt i negative og positive elektrospray-innsamlingsmoduser, noe som tillater generering av komplementære metabolomiske datasett som inneholder flere tusen funksjoner variert etter nøyaktig masse (m/z) (inkludert spektre etter energikollisjon) og retensjonstidsmålinger. Kvalitetskontroller og sammenslåtte prøver vil bli analysert ved hver batch av kjøringen under metabolomikkstudien.
Etter dataanalyse ved bruk av progenese QI, Unifi og R-pakke for metabolomikkanalyse, vil resultatene bli diskutert og delt med medforskerne og de forventede resultatene vil forhåpentligvis publiseres i et fagfellevurdert tidsskrift. Om nødvendig (dvs. for å bekrefte genetisk en uvanlig metabolomisk profil eller et sekundært funn) og hvis samtykke er innhentet fra pasienten, komplementær biokjemisk testing på initial DBS og/eller urinprøver; og genetisk testing fra DBS vil bli utført, etter diskusjon og avtale med medforskerne av studien. Hvis det er nødvendig (dvs. hvis en ny diagnose mistenkes biokjemisk og/eller genetisk), vil forsøkspersonene bli kontaktet etter avtale med medforskerne i studien.
Prøvene som trengs for denne studien vil bli delt inn i 3 hovedgrupper beskrevet nedenfor, hver delt inn etter alderskategorier; den første gruppen er den viktigste sunne gruppen (gruppe 1) som gjør det mulig å generere en metabolomisk referansedatabase. De to andre gruppene tilsvarer grupper av pasienter med patologier hvis diagnose enten er bekreftet (gruppe 2) eller mistenkt (gruppe 3).
Totalt forventet: 3366 fag
- 30 for teknisk optimalisering (i tillegg til DBS og urin vil det bli tatt prøver av helblodsrør)
- 1080 gjenværende menneskekroppsmateriale (RHBM) fra screeningsentre for nyfødte (gruppe 1)
- 1056 kontroller (gruppe 1)
- 1200 pasienter (gruppe 2 og 3)
Minimumsantallet av prøver som er nødvendig for å generere et referanseintervall ved bruk av en ikke-parametrisk metode er 120 prøver i henhold til CLSI28-A3C-retningslinjene (se også Y Ozarda et al. Clinical Chemistry and laboratory Medicine 2018, Vol 57, Issue 1). Derfor satte etterforskerne et mål om minimum 120 prøver samlet inn per alderskategori. Prøver vil bli rettferdig fordelt etter kjønn, sesong og deltakende sentre (dermed geografisk opprinnelse). For nyfødtkategoriene, siden den lettere tilgjengeligheten av et stort antall kontrollprøver ved bruk av anonymiserte restprøver fra nyfødtscreeningssentre, vil måltallet for kontrollprøver være større. På den annen side vil urinprøver ikke bli samlet inn for forsøkspersoner for nyfødte kategorier.
Gruppe 2 inkluderer individer med en kjent patologi hvis diagnose er bekreftet av en genetisk test (genetiske varianter anses som patogene eller sannsynlig patogene i henhold til American College of Human Genetics klassifisering) eller en biokjemisk referansetest knyttet til et typisk klinisk trekk. For autismespekterforstyrrelser bør rekrutterte pasienter inkluderes i henhold til Diagnostic and Statistical Manual (DSM) V klassifisering. Undergrupper er definert i henhold til patologien som påvirker hvert individ (klassifisering i henhold til det berørte genet, arvemåte og type mutasjon); de primære målpatologiene som vurderes er genetiske metabolske sykdommer, men andre sjeldne sykdommer og autismespekterforstyrrelser er også målrettet.
Gruppe 3 inkluderer personer som mistenker en sjelden sykdom basert på kliniske data, men som ikke er bekreftet (inkludert pasienter for hvem de genetiske og biokjemiske testene fortsatt pågår eller er usikre). Hvis statusen til et individ endres før slutten av studien etter bekreftelsen av en diagnose kommunisert anonymt av den rekrutterende medetterforskeren (på grunn av resultater oppnådd uavhengig utenfor studien) eller på grunn av resultatene av studien (spesifikke biomarkører og/ eller skåring og/eller genetisk bekreftelse ved bruk av testing på andre nivå) vil forsøkspersonen deretter bli overført til dens tilsvarende gruppe 2. Disse pasientene vil bli rekruttert i alle deltakende sentre.
Studietype
Registrering (Antatt)
Fase
- Ikke aktuelt
Kontakter og plasseringer
Studiekontakt
- Navn: Joseph P Dewulf, M.D., Ph.D.
- Telefonnummer: 02/7646836
- E-post: Etdclin.Busard@saintluc.uclouvain.be
Studiesteder
-
-
-
Brussels, Belgia, B-1020
- Har ikke rekruttert ennå
- Hôpital Universitaire des enfants Reine Fabiola (HUDERF-ULB)
-
Hovedetterforsker:
- Lionel Marcélis, MSc, Ph.D.
-
Hovedetterforsker:
- Aurélie Empain, M.D., Ph.D.
-
Underetterforsker:
- Corinne De Laet, M.D., Ph.D.
-
Underetterforsker:
- Ebru Surgun, M.D.
-
Underetterforsker:
- Céline Morelli, M.D.
-
Brussels, Belgia, B-1200
- Rekruttering
- Cliniques Universitaires Saint Luc
-
Hovedetterforsker:
- Joseph P. Dewulf, M.D., Ph.D.
-
Hovedetterforsker:
- Marie-Cécile Nassogne, M.D., Ph.D.
-
Underetterforsker:
- Xavier Stephenne, M.D., Ph.D.
-
Underetterforsker:
- Nicole Revencu, M.D., Ph.D.
-
Underetterforsker:
- Stéphanie Paquay, M.D.
-
Charleroi, Belgia, B-6041
- Har ikke rekruttert ennå
- Institut de Pathologie et de Génétique (IPG)
-
Hovedetterforsker:
- Dominique Roland, M.D.
-
Underetterforsker:
- Damien Lederer, M.D., Ph.D.
-
Underetterforsker:
- Isabelle Maystadt, M.D., Ph.D.
-
Liège, Belgia, B-4000
- Har ikke rekruttert ennå
- CHU Liège
-
Hovedetterforsker:
- François-Guillaume Debray, MD PhD
-
Hovedetterforsker:
- François Boemer, Pharm D PhD
-
Underetterforsker:
- Caroline Dadoumont, MD
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Barn
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Personer fra nyfødte til eldre, antagelig ikke påvirket av en sjelden sykdom (gruppe 1) (Nyfødte: kun gjenværende DBS fra nyfødtscreening fra fullbårne nyfødte og med negativ offisiell nyfødtscreeningstest, avidentifiserte prøver som ikke krever ICF, nei urinprøve for denne kategorien), ELLER
- Pasienter fra nyfødte til eldre, rammet av en genetisk stoffskiftesykdom (genetisk bekreftelse kreves) eller en annen bekreftet sjelden sykdom der det er mistanke om metabolsk forstyrrelse (gruppe 2), ELLER
- Pasienter fra nyfødte til eldre, påvirket av autismespekterforstyrrelser og evaluert i henhold til DSMV-klassifiseringen (Gruppe 2), ELLER
- Pasienter som mistenkes for å være påvirket av en genetisk stoffskiftesykdom eller en annen sjelden sykdom med potensiell metabolsk forstyrrelse (dvs. for hvilke genetiske og/eller biokjemiske tester er ikke-konklusive eller pågår) (gruppe 3)
Ekskluderingskriterier:
- Forsøkspersoner eller pasienter hvor det mangler data som kreves for analyse og tildeling i riktig undergruppe
- Ingen informert samtykke signert
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Primært formål: Diagnostisk
- Tildeling: N/A
- Intervensjonsmodell: Enkeltgruppeoppdrag
- Masking: Ingen (Open Label)
Våpen og intervensjoner
Deltakergruppe / Arm |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Eksperimentell: Metabolomikk evaluering
LC-MS-qTOF analyse av DBS og urin ved bruk av en kombinasjon av metoder
|
Metabolomikk studie
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Avdekke nye biomarkører i tørkede blodflekker og urinprøver som kan forbedre diagnosen av sjeldne sykdommer
Tidsramme: 4 år
|
Sammenligning av metabolske data som inneholder tusenvis av biomarkørkandidater oppnådd ved LC-MS-qTOF-analyse mellom sjeldne sykdomskohorter og alderstilpassede kontrollprøver
|
4 år
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Joseph P Dewulf, M.D., Ph.D., Cliniques universitaires Saint-Luc
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Primær fullføring (Antatt)
Studiet fullført (Antatt)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- 2023/09AOU/346
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .