Badania przesiewowe plamy krwi i moczu stosowane w chorobach rzadkich (BUSARD)
Podstawowym celem tego badania jest utworzenie biobanku wysuszonych plam krwi i moczu z dużej kohorty kontrolnej oraz zebranie kilku możliwie dużych kohort pacjentów dotkniętych lub podejrzanych o chorobę rzadką (głównie dziedziczne choroby metaboliczne) lub autyzm. zaburzenia spektrum.
Wygenerowana zostanie metabolomiczna baza danych przy użyciu spektrometru mas o wysokiej rozdzielczości („Urządzenie”) i potwierdzone lub odkryte zostaną specyficzne biomarkery chorób. Ostatecznym celem jest ułatwienie i usprawnienie diagnostyki i badań przesiewowych pacjentów dotkniętych tymi zaburzeniami, ale także poszerzenie wiedzy na temat mechanizmów biochemicznych zachodzących w przebiegu wybranych patologii.
Spektrometria mas o wysokiej rozdzielczości umożliwia pomiar tysięcy metabolitów w jednej analizie. Obecne testy biochemiczne stosowane w diagnostyce dziedzicznych chorób metabolicznych wykorzystują jedynie kombinację maksymalnie kilkudziesięciu biomarkerów w jednej analizie.
Cele Odkrycie nowych biomarkerów do diagnostyki (+/- zbadanie zmienionych ścieżek…) Odkrycie i/lub walidacja biomarkerów badań przesiewowych noworodków poprzez retrospektywną analizę zakonserwowanego DBS noworodków od potwierdzonych pacjentów (przydatne w pierwszym lub drugim stopniu biochemicznych testów NBS!) Walidacja LC- MS qTOF do badań przesiewowych metabolomiki jako test diagnostyczny pierwszego rzutu (tysiące metabolitów) z wykorzystaniem algorytmów diagnostycznych (zmodyfikowane wyniki Z) i ciągła optymalizacja poprzez dodawanie nowych przypadków i nowych kontroli do bazy danych Generowanie biobanku moczu i DBS z chorób rzadkich (IEM) ) oraz z dużej populacji referencyjnej przydatnej do innych zastosowań badawczych
Przegląd badań
Status
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
PROJEKT BADANIA KLINICZNEGO
Interwencyjne wieloośrodkowe badanie z wykorzystaniem wysokiej rozdzielczości spektrometrii mas zastosowanej do wysuszonych plam krwi i próbek moczu, generujące dane metabolomiczne.
Badanie rozpocznie się od założenia biobanku zgodnie z opisem grupy.
Próbki (suche plamy krwi (DBS) i próbki moczu od każdego uczestnika) zostaną zebrane w odpowiednich ośrodkach współbadaczy, zanim zostaną wysłane do centralnego biobanku Cliniques universitaires Saint Luc (CUSL). DBS można przechowywać w temperaturze pokojowej (suchej i chronionej przed światłem), jeśli zostaną wysłane do CUSL w ciągu 2 tygodni od pobrania próbki.
Procedura pobierania próbek, przeprowadzana w każdym ośrodku współkontrolującym, będzie obejmować w następującej kolejności:
- Informacje o badaniu (wyjaśnienia badacza lub jego przedstawiciela)
- Zbiór formularzy świadomej zgody na udział, w tym możliwość wyrażenia zgody na udział w programie
- Zgoda na wielokrotne pobieranie próbek w innym terminie (tylko dla grup II i III)
- Zostanie pobrany poufny kwestionariusz medyczny/CRF (skrócony formularz dla pacjentów z grupy 1-kontrolnej)
- DBS i pobieranie moczu. Przyjmowani będą również pacjenci, dla których dostępny jest wyłącznie noworodkowy DBS.
Tożsamość i udział osób biorących udział w eksperymencie pozostaną ściśle poufne zgodnie z Europejskim ogólnym rozporządzeniem o ochronie danych z dnia 27 kwietnia 2016 r. (obowiązującym od dnia 25 maja 2018 r.), belgijską ustawą z dnia 30 lipca 2018 r. o ochronie danych osobowych prywatności w związku z przetwarzaniem danych osobowych, a także ustawy z dnia 22 sierpnia 2002 r. o prawach pacjenta. Dane osobowe zostaną zakodowane. Uczestnicy nie będą identyfikowani z nazwiska ani w żaden inny rozpoznawalny sposób w żadnych zapisach, wynikach ani publikacjach związanych z eksperymentem.
Badacze biorący udział w badaniu zidentyfikują potencjalnych uczestników, którzy wydają się spełniać kryteria kwalifikowalności.
Lekarz lub delegat wyjaśni przebieg badania. Następnie, jeśli uczestnik i/lub rodzice wyrażą zgodę, przed pobraniem próbki zostanie podpisana świadoma zgoda.
W przypadku jednego formularza świadomej zgody (ICF) dozwolone będzie wielokrotne pobieranie próbek w różnych punktach czasowych.
Ośrodki współbadaczy będą tymczasowo przechowywać pseudonimizowane próbki i okresowo przesyłać zgromadzone próbki (zamrożone) do laboratorium CUSL (w celu biobankowania). Próbki będą przechowywane w temperaturze -80°C w biobanku CUSL przed i po analizie. Czas przyjęcia i przeniesienia w temperaturze -80°C w CUSL zostanie zarejestrowany w REDCAP.
Później zostanie przeprowadzone wygenerowanie zbiorów danych reprezentatywnych dla metabolomu w próbkach DBS i moczu za pomocą chromatografii cieczowej połączonej z analizą spektrometrii mas o wysokiej rozdzielczości (LC-MS-q-TOF).
W analizie metabolomicznej metodą LC-MS-q-TOF wykorzystany zostanie instrument SYNAPT-XS firmy Waters. Kilka kolumn zostanie wykorzystanych w trybach akwizycji metodą elektrorozpylania ujemnego i dodatniego, co umożliwi generowanie uzupełniających zbiorów danych metabolomicznych zawierających kilka tysięcy cech w zakresie dokładnej masy (m/z) (w tym widma po zderzeniu energii) i pomiarów czasu retencji. Kontrole jakości i próbki zbiorcze będą analizowane w każdej partii podczas badania metabolomicznego.
Po analizie danych z wykorzystaniem progenezy QI, Unifi i pakietu R do analizy metabolomicznej wyniki zostaną omówione i udostępnione współbadaczom, a oczekiwane wyniki zostaną, miejmy nadzieję, opublikowane w recenzowanym czasopiśmie. W razie potrzeby (tj. potwierdzenia genetycznego nietypowego profilu metabolomicznego lub ustalenia wtórnego) i uzyskania zgody pacjenta, uzupełniające badania biochemiczne na wstępnych próbkach DBS i/lub moczu; oraz badania genetyczne z DBS zostaną przeprowadzone po dyskusji i porozumieniu ze współbadaczami badania. W razie potrzeby (tj. jeśli podejrzewa się nową diagnozę z powodów biochemicznych i/lub genetycznych) z uczestnikami skontaktuje się po uzyskaniu zgody współbadaczy badania.
Próbki potrzebne do tego badania zostaną podzielone na 3 główne grupy wyszczególnione poniżej, każda podzielona według kategorii wiekowych; pierwsza grupa to główna grupa zdrowa (Grupa 1) pozwalająca na wygenerowanie referencyjnej bazy danych metabolomicznych. Dwie pozostałe grupy odpowiadają grupom pacjentów z patologiami, których rozpoznanie jest albo potwierdzone (Grupa 2), albo podejrzewane (Grupa 3).
Oczekiwana suma: 3366 pacjentów
- 30 na optymalizację techniczną (oprócz DBS i moczu pobierana będzie krew pełna z probówek)
- 1080 pozostałości materiału ludzkiego (RHBM) z ośrodków badań przesiewowych noworodków (grupa 1)
- 1056 kontroli (grupa 1)
- 1200 pacjentów (grupy 2 i 3)
Minimalna liczba próbek niezbędna do wygenerowania przedziału referencyjnego metodą nieparametryczną to 120 próbek zgodnie z wytycznymi CLSI28-A3C (patrz także Y Ozarda i in. Chemia kliniczna i medycyna laboratoryjna 2018, tom 57, wydanie 1). Dlatego badacze ustalili cel zebrania co najmniej 120 próbek w każdej kategorii wiekowej. Próbki zostaną równomiernie rozdzielone według płci, pory roku i uczestniczących ośrodków (a zatem pochodzenia geograficznego). W przypadku kategorii noworodków, ze względu na łatwiejszą dostępność dużej liczby próbek kontrolnych przy użyciu anonimowych próbek resztkowych z ośrodków badań przesiewowych noworodków, docelowa liczba próbek kontrolnych będzie większa. Z drugiej strony próbki moczu nie będą pobierane od pacjentów z kategorii noworodków.
Grupa 2 obejmuje osoby ze znaną patologią, których rozpoznanie zostało potwierdzone testem genetycznym (wariant(y) genetyczny uznawany(-e) za patogenny lub prawdopodobnie patogenny według klasyfikacji American College of Human Genetics) lub referencyjnym testem biochemicznym powiązanym z typową cechą kliniczną. W przypadku zaburzeń ze spektrum autyzmu rekrutowani pacjenci powinni być włączeni zgodnie z klasyfikacją Podręcznika Diagnostycznego i Statystycznego (DSM) V. Podgrupy definiuje się zgodnie z patologią dotykającą każdego osobnika (klasyfikacja według dotkniętego genu, sposobu dziedziczenia i rodzaju mutacji); brane pod uwagę przede wszystkim patologie docelowe to genetyczne choroby metaboliczne, ale celem są także inne rzadkie choroby i zaburzenia ze spektrum autyzmu.
Grupa 3 obejmuje osoby, u których na podstawie danych klinicznych podejrzewa się chorobę rzadką, ale nie została ona potwierdzona (w tym pacjenci, u których badania genetyczne i biochemiczne są jeszcze w toku lub są niejednoznaczne). Jeżeli status danej osoby ulegnie zmianie przed zakończeniem badania, po potwierdzeniu diagnozy przekazanej anonimowo przez współbadacza rekrutującego (w związku z wynikami uzyskanymi niezależnie poza badaniem) lub w związku z wynikami badania (specyficzne biomarkery i/lub lub punktacja i/lub potwierdzenie genetyczne za pomocą testów drugiego poziomu), pacjent zostanie następnie przeniesiony do odpowiedniej grupy 2. Pacjenci ci zostaną zrekrutowani we wszystkich uczestniczących ośrodkach.
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Faza
- Nie dotyczy
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Joseph P Dewulf, M.D., Ph.D.
- Numer telefonu: 02/7646836
- E-mail: Etdclin.Busard@saintluc.uclouvain.be
Lokalizacje studiów
-
-
-
Brussels, Belgia, B-1020
- Jeszcze nie rekrutacja
- Hôpital Universitaire des enfants Reine Fabiola (HUDERF-ULB)
-
Główny śledczy:
- Lionel Marcélis, MSc, Ph.D.
-
Główny śledczy:
- Aurélie Empain, M.D., Ph.D.
-
Pod-śledczy:
- Corinne De Laet, M.D., Ph.D.
-
Pod-śledczy:
- Ebru Surgun, M.D.
-
Pod-śledczy:
- Céline Morelli, M.D.
-
Brussels, Belgia, B-1200
- Rekrutacyjny
- Cliniques Universitaires Saint Luc
-
Główny śledczy:
- Joseph P. Dewulf, M.D., Ph.D.
-
Główny śledczy:
- Marie-Cécile Nassogne, M.D., Ph.D.
-
Pod-śledczy:
- Xavier Stephenne, M.D., Ph.D.
-
Pod-śledczy:
- Nicole Revencu, M.D., Ph.D.
-
Pod-śledczy:
- Stéphanie Paquay, M.D.
-
Charleroi, Belgia, B-6041
- Jeszcze nie rekrutacja
- Institut de Pathologie et de Génétique (IPG)
-
Główny śledczy:
- Dominique Roland, M.D.
-
Pod-śledczy:
- Damien Lederer, M.D., Ph.D.
-
Pod-śledczy:
- Isabelle Maystadt, M.D., Ph.D.
-
Liège, Belgia, B-4000
- Jeszcze nie rekrutacja
- CHU Liège
-
Główny śledczy:
- François-Guillaume Debray, MD PhD
-
Główny śledczy:
- François Boemer, Pharm D PhD
-
Pod-śledczy:
- Caroline Dadoumont, MD
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dziecko
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Pacjenci od noworodków do osób w podeszłym wieku, prawdopodobnie nie dotknięci rzadką chorobą (Grupa 1) (Noworodki: tylko pozostałości DBS z badań przesiewowych noworodków donoszonych i z ujemnym oficjalnym testem przesiewowym noworodków, próbki zdeidentyfikowane niewymagające ICF, nie próbka moczu dla tej kategorii), LUB
- Pacjenci od noworodków do osób starszych, dotknięci genetyczną chorobą metaboliczną (wymagane potwierdzenie genetyczne) lub inną potwierdzoną rzadką chorobą, w przypadku której podejrzewa się zaburzenie metaboliczne (Grupa 2), LUB
- Pacjenci od noworodka do starszego, dotknięci zaburzeniami ze spektrum autyzmu, oceniani według klasyfikacji DSMV (grupa 2), LUB
- Pacjenci podejrzani o genetyczną chorobę metaboliczną lub inną rzadką chorobę z potencjalnymi zaburzeniami metabolicznymi (tj. w przypadku których badania genetyczne i/lub biochemiczne nie są rozstrzygające lub są w toku) (Grupa 3)
Kryteria wyłączenia:
- Osoby lub pacjenci, dla których brakuje danych wymaganych do analizy i przypisania do właściwej podgrupy
- Brak podpisanej świadomej zgody
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Główny cel: Diagnostyczny
- Przydział: Nie dotyczy
- Model interwencyjny: Zadanie dla jednej grupy
- Maskowanie: Brak (otwarta etykieta)
Broń i interwencje
Grupa uczestników / Arm |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Eksperymentalny: Ocena metabolomiki
Analiza LC-MS-qTOF DBS i moczu przy użyciu kombinacji metod
|
Badania metabolomiczne
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Odkryj nowe biomarkery w wysuszonych plamach krwi i próbkach moczu, które mogą poprawić diagnostykę rzadkich chorób
Ramy czasowe: 4 lata
|
Porównanie danych metabolicznych zawierających tysiące kandydatów na biomarkery uzyskanych za pomocą analizy LC-MS-qTOF pomiędzy kohortami chorób rzadkich i dobranymi pod względem wieku próbkami kontrolnymi
|
4 lata
|
Współpracownicy i badacze
Śledczy
- Główny śledczy: Joseph P Dewulf, M.D., Ph.D., Cliniques universitaires Saint-Luc
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
Ukończenie studiów (Szacowany)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- 2023/09AOU/346
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .