Pilottitutkimus ihmisen metagenomista aineenvaihduntasairauksissa

Ihmisen metagenomi käsittää kaikki nukleotidisekvenssit, jotka on eristetty kaikista yksilön pinnalla ja sisällä elävistä organismeista, ja niillä on osoitettu olevan merkittäviä muutoksia suhteessa tiettyihin krooniseen tulehdukseen liittyviin sairaustiloihin, kuten liikalihavuuteen ja sarkopeniaan.

Suoliston bakteerien ja viime aikoina viromin on osoitettu korreloivan merkittävästi liikalihavan fenotyypin kanssa, kun taas suoliston mikrobiomin dysbioosin tiedetään esiintyvän sarkopeniaa sairastavilla yksilöillä. Kliinisesti on olemassa täyttämätön kliininen tarve yksilöidä paremmin potilaiden, joilla on aineenvaihduntahäiriöitä, kuten liikalihavuus ja metabolinen oireyhtymä, sekä potilaiden, jotka kärsivät sarkopeniasta ja ikääntymisen aiheuttamasta heikkoudesta, hoitoa. Näihin häiriöihin liittyvistä metagenomisista allekirjoituksista, erityisesti ei-bakteerilajeista, bakteerien metaboliitteista ja niiden suhteesta isännän aineenvaihduntaan, oli kuitenkin niukasti kirjallisuutta.

Näin ollen oletamme, että ihmisen metagenomi ja metabolomi voivat vaikuttaa aineenvaihduntahäiriöihin liittyviin kroonisiin tulehdussairauksiin, kuten liikalihavuuteen ja ikääntymiseen liittyviin sairauksiin, kuten sarkopeniaan ja ikääntymiseen.

Tämä on kohorttitutkimus, joka sisältää metagenomisen sekvensoinnin ja metabolomisen analyysin potilaiden metagenomista ja metabolomista erilaisissa sairaustiloissa. Rekrytoidaan myös joukko terveitä kontrollipotilaita, joilla ei ole liikalihavuutta tai sarkopeniaa.

Kerätyt näytteet sisältävät uloste-, sylki-, seerumi-, virtsa- ja limakalvonäytteitä metagenomista sekvensointia ja metabolomista testausta varten.